57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1052 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 219 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  62.33 
 
 		 219 aa  297  8e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2818  peptidoglycan-binding LysM  37.27 
 
 		 225 aa  151  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1662  hypothetical protein  37.27 
 
 		 225 aa  151  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.595279  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  34.11 
 
 		 256 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4389  Peptidoglycan-binding LysM  37.21 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.855659  normal  0.278561 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0927  hypothetical protein  33.5 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  34.63 
 
 		 251 aa  114  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1870  peptidoglycan-binding LysM  31.19 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  34.78 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  30.81 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2266  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  33.51 
 
 		 285 aa  99.8  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  hitchhiker  0.000527063 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0771  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  27.23 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4346  hypothetical protein  30.94 
 
 		 230 aa  85.9  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0319387  normal  0.0732619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3821  peptidoglycan-binding LysM  27.23 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.018492  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1507  LysM domain-containing protein  27.6 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1955  Peptidoglycan-binding LysM  26.22 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3926  hypothetical protein  27.67 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000265791  hitchhiker  0.00532364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3663  hypothetical protein  24.66 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000726508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3040  hypothetical protein  34.09 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000225884 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0233  hypothetical protein  25.47 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5251  hypothetical protein  26.83 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337466 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3610  hypothetical protein  24.62 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000791027 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1878  hypothetical protein  27.65 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1627  hypothetical protein  26.97 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0432384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1563  hypothetical protein  24.51 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3154  hypothetical protein  22.84 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1744  hypothetical protein  26 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0677  Peptidoglycan-binding LysM  25.34 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2795  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  45.45 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.683971  normal  0.0904413 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3004  hypothetical protein  22.81 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  45.83 
 
 		 591 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0370  hypothetical protein  22.5 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2549  hypothetical protein  23.04 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2893  hypothetical protein  27.39 
 
 		 247 aa  50.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2463  hypothetical protein  26.85 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.258952 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.14 
 
 		 954 aa  49.7  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  41.54 
 
 		 1910 aa  48.9  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1005  Peptidoglycan-binding LysM  44.64 
 
 		 559 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0784845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1683  hypothetical protein  21.43 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1041  hypothetical protein  19.69 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1338  protein serine/threonine phosphatase  37.33 
 
 		 474 aa  46.2  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000169814  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2634  peptidoglycan-binding LysM  52.08 
 
 		 302 aa  45.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  40.58 
 
 		 234 aa  45.4  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1074  signal peptide protein  43.75 
 
 		 568 aa  45.4  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107534  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3821  hypothetical protein  36.92 
 
 		 96 aa  45.1  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1079  hypothetical protein  29.01 
 
 		 377 aa  44.7  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.951143 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  44.9 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0940  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 559 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.147374 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  40.82 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  36.54 
 
 		 166 aa  42.7  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4948  Peptidoglycan-binding LysM  40.74 
 
 		 153 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 543 aa  42.4  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0937  hypothetical protein  36.92 
 
 		 96 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00383294  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11314  hypothetical protein  42.55 
 
 		 456 aa  42  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4808  Peptidoglycan-binding LysM  29.55 
 
 		 235 aa  42  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2915  Peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 		 566 aa  41.6  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>