47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1662 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1662  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  464  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.595279  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2818  peptidoglycan-binding LysM  96.44 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  37.27 
 
 		 219 aa  151  8e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  39.02 
 
 		 219 aa  151  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  40 
 
 		 256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  37.56 
 
 		 205 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1870  peptidoglycan-binding LysM  37.61 
 
 		 224 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0771  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  32.02 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4389  Peptidoglycan-binding LysM  36.29 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.855659  normal  0.278561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  35.64 
 
 		 251 aa  115  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  33.61 
 
 		 236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0927  hypothetical protein  32.67 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1507  LysM domain-containing protein  34.63 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4346  hypothetical protein  30.19 
 
 		 230 aa  98.2  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0319387  normal  0.0732619 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2266  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  34.24 
 
 		 285 aa  95.1  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  hitchhiker  0.000527063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3821  peptidoglycan-binding LysM  29.07 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.018492  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3663  hypothetical protein  30.72 
 
 		 159 aa  84.7  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000726508 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3154  hypothetical protein  28.45 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1955  Peptidoglycan-binding LysM  28.7 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1683  hypothetical protein  28.57 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1878  hypothetical protein  28.86 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0370  hypothetical protein  28.5 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2549  hypothetical protein  27.75 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3004  hypothetical protein  25 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3926  hypothetical protein  25.62 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000265791  hitchhiker  0.00532364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0670  hypothetical protein  26.55 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.528126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0677  Peptidoglycan-binding LysM  26.29 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0233  hypothetical protein  28.92 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3610  hypothetical protein  24.46 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000791027 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1041  hypothetical protein  24.52 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2893  hypothetical protein  24.89 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5251  hypothetical protein  34.58 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1563  hypothetical protein  24.3 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4943  LysM domain/BON superfamily protein  36.59 
 
 		 146 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1627  hypothetical protein  24.84 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0432384 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3040  hypothetical protein  29.22 
 
 		 324 aa  49.7  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000225884 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2463  hypothetical protein  25.87 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.258952 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5404  LysM domain protein  35.37 
 
 		 146 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  48.94 
 
 		 234 aa  45.8  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1744  hypothetical protein  21.47 
 
 		 169 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1079  hypothetical protein  26.43 
 
 		 377 aa  45.4  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.951143 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3683  peptidoglycan-binding LysM  37.88 
 
 		 5236 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1923  peptidoglycan-binding LysM  37.88 
 
 		 5189 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2290  YD repeat protein  47.92 
 
 		 6272 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  41.94 
 
 		 954 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4808  Peptidoglycan-binding LysM  30 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2785  LysM domain/BON superfamily protein  33.33 
 
 		 149 aa  42  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.267708 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>