16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3040 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3040  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  623  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000225884 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1878  hypothetical protein  32.72 
 
 		 239 aa  91.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1507  LysM domain-containing protein  29.57 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  32.09 
 
 		 219 aa  67  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  29.27 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  30 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3663  hypothetical protein  28.57 
 
 		 159 aa  52.8  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000726508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2818  peptidoglycan-binding LysM  28.14 
 
 		 225 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  27.36 
 
 		 236 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1870  peptidoglycan-binding LysM  28.35 
 
 		 224 aa  50.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0927  hypothetical protein  28.87 
 
 		 254 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1662  hypothetical protein  28.37 
 
 		 225 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.595279  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1955  Peptidoglycan-binding LysM  27.48 
 
 		 239 aa  48.9  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0771  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  27.4 
 
 		 222 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  28.98 
 
 		 256 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4389  Peptidoglycan-binding LysM  27.88 
 
 		 237 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.855659  normal  0.278561 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>