45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1905 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  525  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0927  hypothetical protein  55.73 
 
 		 254 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  49.34 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2266  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  48.06 
 
 		 285 aa  219  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  hitchhiker  0.000527063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  43.69 
 
 		 236 aa  191  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4389  Peptidoglycan-binding LysM  43.07 
 
 		 237 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.855659  normal  0.278561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3821  peptidoglycan-binding LysM  38.73 
 
 		 229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.018492  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2818  peptidoglycan-binding LysM  41.2 
 
 		 225 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1662  hypothetical protein  40 
 
 		 225 aa  135  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.595279  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  37.44 
 
 		 219 aa  133  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  34.11 
 
 		 219 aa  128  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1870  peptidoglycan-binding LysM  30.33 
 
 		 224 aa  95.5  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1955  Peptidoglycan-binding LysM  30.99 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0771  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  31.2 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4346  hypothetical protein  30.84 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0319387  normal  0.0732619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  29.32 
 
 		 205 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5251  hypothetical protein  28.14 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3663  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000726508 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1507  LysM domain-containing protein  29.35 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1683  hypothetical protein  27.97 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2549  hypothetical protein  28.39 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1041  hypothetical protein  24 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0670  hypothetical protein  25.66 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.528126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3154  hypothetical protein  25.76 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1627  hypothetical protein  31.54 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0432384 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0233  hypothetical protein  31.39 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3610  hypothetical protein  25.49 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000791027 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1563  hypothetical protein  24.48 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3926  hypothetical protein  27.23 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000265791  hitchhiker  0.00532364 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0677  Peptidoglycan-binding LysM  23.33 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2463  hypothetical protein  25.96 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.258952 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0370  hypothetical protein  26.09 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1878  hypothetical protein  26.1 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1744  hypothetical protein  25.53 
 
 		 169 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3004  hypothetical protein  22.96 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.86 
 
 		 954 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2893  hypothetical protein  21.97 
 
 		 247 aa  48.9  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  45.28 
 
 		 663 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0473  peptidoglycan-binding LysM  43.14 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5417  peptidoglycan-binding LysM  51.06 
 
 		 591 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0262  Peptidoglycan-binding LysM  25.29 
 
 		 318 aa  45.8  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  39.19 
 
 		 389 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3040  hypothetical protein  28.98 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000225884 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1074  signal peptide protein  37.5 
 
 		 568 aa  42.4  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107534  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_002950  PG0149  hypothetical protein  41.07 
 
 		 422 aa  42  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>