33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3663 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3663  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  325  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000726508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0233  hypothetical protein  40 
 
 		 168 aa  110  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2818  peptidoglycan-binding LysM  30.95 
 
 		 225 aa  88.2  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1662  hypothetical protein  30.95 
 
 		 225 aa  87.8  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.595279  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  33.8 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  32.89 
 
 		 256 aa  81.3  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0927  hypothetical protein  34.25 
 
 		 254 aa  81.3  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  33.08 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2266  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.88 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  hitchhiker  0.000527063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  35.66 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  27.54 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  24.68 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1507  LysM domain-containing protein  31.88 
 
 		 204 aa  70.9  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4346  hypothetical protein  30 
 
 		 230 aa  67.8  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0319387  normal  0.0732619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4389  Peptidoglycan-binding LysM  29.55 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.855659  normal  0.278561 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1870  peptidoglycan-binding LysM  26.43 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0677  Peptidoglycan-binding LysM  30.34 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1744  hypothetical protein  24.44 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3040  hypothetical protein  28.57 
 
 		 324 aa  57  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000225884 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0771  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  25.17 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0850  hypothetical protein  27.04 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3821  peptidoglycan-binding LysM  25.66 
 
 		 229 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.018492  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1627  hypothetical protein  23.68 
 
 		 194 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0432384 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0670  hypothetical protein  23.68 
 
 		 226 aa  49.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.528126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2463  hypothetical protein  26.17 
 
 		 220 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.258952 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0660  hypothetical protein  27.15 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3610  hypothetical protein  26.21 
 
 		 246 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000791027 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1079  hypothetical protein  26.49 
 
 		 377 aa  47.4  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.951143 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0370  hypothetical protein  27.34 
 
 		 225 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1955  Peptidoglycan-binding LysM  25.34 
 
 		 239 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1041  hypothetical protein  27.2 
 
 		 221 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3004  hypothetical protein  29.79 
 
 		 213 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3154  hypothetical protein  24.54 
 
 		 229 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>