31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1507 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1507  LysM domain-containing protein  100 
 
 		 204 aa  417  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  34.62 
 
 		 205 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1662  hypothetical protein  34.63 
 
 		 225 aa  99.8  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.595279  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2818  peptidoglycan-binding LysM  34.15 
 
 		 225 aa  97.8  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1870  peptidoglycan-binding LysM  30.73 
 
 		 224 aa  95.1  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  27.6 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  29.35 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0771  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  34.15 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  25.5 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3821  peptidoglycan-binding LysM  24.51 
 
 		 229 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.018492  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3663  hypothetical protein  31.88 
 
 		 159 aa  70.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000726508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  28.65 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3040  hypothetical protein  32.12 
 
 		 324 aa  68.9  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000225884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0927  hypothetical protein  29.19 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1955  Peptidoglycan-binding LysM  25.44 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  26.07 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2266  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  28.14 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  hitchhiker  0.000527063 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1878  hypothetical protein  28.57 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4389  Peptidoglycan-binding LysM  24.87 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.855659  normal  0.278561 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2893  hypothetical protein  24.34 
 
 		 247 aa  52.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4346  hypothetical protein  21.95 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0319387  normal  0.0732619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1744  hypothetical protein  27.66 
 
 		 169 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1563  hypothetical protein  26.21 
 
 		 258 aa  48.9  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0233  hypothetical protein  23.19 
 
 		 168 aa  48.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0670  hypothetical protein  19.15 
 
 		 226 aa  45.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.528126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1627  hypothetical protein  30.95 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0432384 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0677  Peptidoglycan-binding LysM  20.16 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3154  hypothetical protein  24.75 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3610  hypothetical protein  22.53 
 
 		 246 aa  42  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000791027 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1816  hypothetical protein  39.29 
 
 		 134 aa  41.6  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.319712 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1079  hypothetical protein  33.33 
 
 		 377 aa  41.6  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.951143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>