48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1870 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1870  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 224 aa  457  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0981  hypothetical protein  44.81 
 
 		 205 aa  164  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.787443  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0771  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  40.55 
 
 		 222 aa  149  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4346  hypothetical protein  37.16 
 
 		 230 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0319387  normal  0.0732619 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1955  Peptidoglycan-binding LysM  37.38 
 
 		 239 aa  135  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2818  peptidoglycan-binding LysM  37.44 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1662  hypothetical protein  37.61 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.595279  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26580  LysM domain-containing protein  31.05 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1052  Peptidoglycan-binding LysM  31.19 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1905  hypothetical protein  30.33 
 
 		 256 aa  95.5  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211998  hitchhiker  0.0023156 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1507  LysM domain-containing protein  30.73 
 
 		 204 aa  95.1  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3154  hypothetical protein  28.64 
 
 		 229 aa  91.7  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1041  hypothetical protein  25.7 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0670  hypothetical protein  26.89 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.528126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3004  hypothetical protein  26.89 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0370  hypothetical protein  25.36 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3610  hypothetical protein  27.6 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000791027 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0927  hypothetical protein  25.25 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.171853 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2463  hypothetical protein  28.87 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.258952 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0677  Peptidoglycan-binding LysM  25.85 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5385  Peptidoglycan-binding LysM  28.92 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2944  Peptidoglycan-binding LysM  29.56 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.34706  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1683  hypothetical protein  27.14 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2266  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  27.51 
 
 		 285 aa  71.6  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.355475  hitchhiker  0.000527063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5251  hypothetical protein  20.4 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337466 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2549  hypothetical protein  27.5 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4389  Peptidoglycan-binding LysM  26.29 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.855659  normal  0.278561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3926  hypothetical protein  26 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000265791  hitchhiker  0.00532364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3821  peptidoglycan-binding LysM  33.06 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.018492  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3663  hypothetical protein  27.14 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000726508 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1878  hypothetical protein  29.68 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2893  hypothetical protein  25.83 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  54.17 
 
 		 954 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11314  hypothetical protein  52.94 
 
 		 456 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1563  hypothetical protein  23.51 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1627  hypothetical protein  25.38 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0432384 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  42 
 
 		 627 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0233  hypothetical protein  23.33 
 
 		 168 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.916377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  39.58 
 
 		 659 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  39.58 
 
 		 657 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  48.94 
 
 		 663 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1338  protein serine/threonine phosphatase  40 
 
 		 474 aa  47  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000169814  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0285  peptidoglycan-binding LysM  45.1 
 
 		 1095 aa  45.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3040  hypothetical protein  28.12 
 
 		 324 aa  45.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000225884 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4719  peptidoglycan-binding LysM  42.37 
 
 		 1079 aa  42.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0262  Peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 318 aa  42.4  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0893  Peptidoglycan-binding LysM  43.75 
 
 		 137 aa  41.6  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  32.99 
 
 		 284 aa  41.6  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>