More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2690 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  100 
 
 		 627 aa  1273    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  61.74 
 
 		 663 aa  796    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  61.78 
 
 		 638 aa  806    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  55.62 
 
 		 526 aa  623  1e-177  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  57.17 
 
 		 533 aa  611  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  54.56 
 
 		 529 aa  597  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  54.24 
 
 		 532 aa  572  1.0000000000000001e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  54.37 
 
 		 523 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  54.17 
 
 		 523 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.96 
 
 		 607 aa  421  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.74 
 
 		 605 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  41.58 
 
 		 587 aa  402  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  41.51 
 
 		 555 aa  404  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  40.79 
 
 		 520 aa  386  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  39.42 
 
 		 558 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.149567 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05939  conserved hypothetical protein  33.21 
 
 		 582 aa  303  5.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.24 
 
 		 601 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0357  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  33.8 
 
 		 607 aa  276  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  33.53 
 
 		 619 aa  270  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1134  5'-nucleotidase  34 
 
 		 625 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00179734  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0349  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  35.04 
 
 		 591 aa  263  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  33.46 
 
 		 581 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0538  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  31.58 
 
 		 584 aa  257  4e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.24 
 
 		 508 aa  251  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  31.56 
 
 		 504 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  32.34 
 
 		 529 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.33 
 
 		 529 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  32.14 
 
 		 529 aa  232  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  31.78 
 
 		 529 aa  231  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  32.15 
 
 		 529 aa  231  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  31.96 
 
 		 529 aa  231  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4022  5'-nucleotidase  32.78 
 
 		 641 aa  231  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.887399 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  31.78 
 
 		 529 aa  229  9e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  31.78 
 
 		 529 aa  229  9e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  31.59 
 
 		 529 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  31.59 
 
 		 529 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0670  5'-nucleotidase  32.75 
 
 		 637 aa  227  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.785834  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0692  5'-nucleotidase  32.75 
 
 		 637 aa  227  6e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0157449 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.84 
 
 		 530 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43694  predicted protein  32.49 
 
 		 663 aa  221  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.553489  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5725  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.15 
 
 		 672 aa  220  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695831 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1539  metallophosphoesterase  29.93 
 
 		 577 aa  216  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.337659 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  31.73 
 
 		 509 aa  213  7.999999999999999e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1368  metallophosphoesterase  29.37 
 
 		 580 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.198191  normal  0.0110218 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05914  5'-nucleotidase  29.21 
 
 		 585 aa  211  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  30.22 
 
 		 529 aa  209  9e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  30.04 
 
 		 529 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3010  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.76 
 
 		 581 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  30.04 
 
 		 529 aa  208  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  30.04 
 
 		 529 aa  209  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2995  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.94 
 
 		 581 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  31.25 
 
 		 523 aa  208  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  30.02 
 
 		 529 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  30.02 
 
 		 529 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1252  5'-nucleotidase-like protein  29.16 
 
 		 580 aa  207  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3153  5'-nucleotidase domain protein  28.91 
 
 		 581 aa  207  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867594 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  30.04 
 
 		 529 aa  205  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  30.02 
 
 		 529 aa  205  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  30.71 
 
 		 515 aa  205  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1111  metallophosphoesterase  29.37 
 
 		 578 aa  205  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.443136  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1300  5'-nucleotidase  26.8 
 
 		 592 aa  204  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.291258  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  32.82 
 
 		 520 aa  204  4e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  29.66 
 
 		 529 aa  204  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  32.49 
 
 		 508 aa  204  5e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.04 
 
 		 529 aa  204  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  32.49 
 
 		 508 aa  204  5e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2657  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.77 
 
 		 581 aa  203  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1427  5'-nucleotidase  28.21 
 
 		 581 aa  203  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000189  5'-nucleotidase  28.81 
 
 		 578 aa  201  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000310598  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0825  5'-Nucleotidase domain protein  30.06 
 
 		 619 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0854  5'-Nucleotidase domain protein  30.06 
 
 		 619 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1294  metallophosphoesterase  28.01 
 
 		 583 aa  198  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.260824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2370  5'-nucleotidase, putative  27.87 
 
 		 573 aa  198  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.405664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  31.15 
 
 		 512 aa  197  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3317  5'-nucleotidase, putative  27.27 
 
 		 583 aa  196  9e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1223  metallophosphoesterase  27.64 
 
 		 583 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1285  5'-nucleotidase  27.49 
 
 		 586 aa  195  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1224  metallophosphoesterase  27.64 
 
 		 583 aa  193  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.618653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1472  5'-nucleotidase  31.75 
 
 		 517 aa  192  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.150971 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0478  putative 5`-nucleotidase  28.2 
 
 		 580 aa  192  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000584896  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  30 
 
 		 503 aa  188  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  30.56 
 
 		 556 aa  188  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2772  putative 5'-nucleotidase  28.7 
 
 		 664 aa  184  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000553351  hitchhiker  0.00604315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1472  5'-nucleotidase  31.11 
 
 		 505 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633021  normal  0.092078 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0023  cell wall anchor domain-containing protein  28.76 
 
 		 772 aa  181  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0275377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0023  cell wall anchor domain-containing protein  28.76 
 
 		 772 aa  181  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.244704  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.19 
 
 		 722 aa  181  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1750  5'-nucleotidase  31.52 
 
 		 500 aa  181  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.398789 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  28.36 
 
 		 515 aa  179  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1235  5'-Nucleotidase domain protein  30.1 
 
 		 613 aa  179  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.798144  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.8 
 
 		 1284 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2582  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.56 
 
 		 505 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270196  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1464  5'-Nucleotidase domain protein  28.32 
 
 		 657 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.21 
 
 		 518 aa  173  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.49 
 
 		 516 aa  172  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0450  5'-nucleotidase  26.17 
 
 		 579 aa  172  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  28.21 
 
 		 518 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  28.21 
 
 		 518 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  28.21 
 
 		 518 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3478  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.72 
 
 		 508 aa  171  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622587  normal  0.226915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>