More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2483 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  100 
 
 
512 aa  1003    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2582  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.33 
 
 
505 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270196  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4645  5'-Nucleotidase domain protein  39.71 
 
 
506 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132836  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1472  5'-nucleotidase  37.79 
 
 
517 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.150971 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1750  5'-nucleotidase  38.14 
 
 
500 aa  295  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.398789 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1472  5'-nucleotidase  37.73 
 
 
505 aa  292  8e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633021  normal  0.092078 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3478  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.14 
 
 
508 aa  263  6.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622587  normal  0.226915 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10661  5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14310)  33.4 
 
 
666 aa  240  5e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.36 
 
 
587 aa  234  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.97 
 
 
607 aa  232  9e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  33.59 
 
 
659 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  32.88 
 
 
657 aa  229  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  32.76 
 
 
532 aa  228  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.24 
 
 
605 aa  228  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  32.63 
 
 
526 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.6 
 
 
627 aa  216  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  31.41 
 
 
638 aa  215  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.46 
 
 
523 aa  210  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  33.65 
 
 
523 aa  209  8e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  28.76 
 
 
504 aa  209  8e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  33.2 
 
 
529 aa  209  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3565  5'-nucleotidase-like  29.61 
 
 
491 aa  205  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3839  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.81 
 
 
502 aa  205  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0174247 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  31.43 
 
 
523 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  31.36 
 
 
520 aa  205  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  32.7 
 
 
663 aa  200  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  32.38 
 
 
555 aa  194  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.47 
 
 
533 aa  184  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05655  5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01160)  32.85 
 
 
498 aa  184  5.0000000000000004e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.511883 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  31.73 
 
 
558 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3996  metallophosphoesterase  30.04 
 
 
501 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  29 
 
 
1202 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  28.8 
 
 
1215 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.21 
 
 
508 aa  176  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  30.74 
 
 
508 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  30.74 
 
 
508 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.87 
 
 
601 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  27.14 
 
 
1181 aa  163  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2906  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.72 
 
 
872 aa  163  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.865364  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  26.93 
 
 
1175 aa  163  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  28.98 
 
 
619 aa  162  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.96 
 
 
509 aa  157  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08461  metallophosphoesterase  27.53 
 
 
503 aa  157  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  30.8 
 
 
503 aa  156  8e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  30.21 
 
 
556 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.97 
 
 
530 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  26.23 
 
 
529 aa  154  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  26.57 
 
 
529 aa  154  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0770  hypothetical protein  29.59 
 
 
494 aa  154  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0435577  normal  0.251523 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  26.43 
 
 
529 aa  154  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  26.38 
 
 
529 aa  153  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  26.38 
 
 
529 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  26.47 
 
 
529 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  26.38 
 
 
529 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  26.38 
 
 
529 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  26.67 
 
 
529 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04020  conserved hypothetical protein  28.84 
 
 
788 aa  151  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.43338  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  26.38 
 
 
529 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  30.32 
 
 
520 aa  150  4e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.05 
 
 
529 aa  150  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.75 
 
 
515 aa  150  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  26.29 
 
 
529 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  26.19 
 
 
529 aa  150  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  26.29 
 
 
529 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  29.06 
 
 
581 aa  150  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  26.29 
 
 
529 aa  150  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  26.1 
 
 
529 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  26.1 
 
 
529 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4357  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.94 
 
 
535 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000122656  decreased coverage  0.0000528459 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.19 
 
 
529 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0825  5'-Nucleotidase domain protein  27.5 
 
 
619 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  26.1 
 
 
529 aa  148  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  25.67 
 
 
529 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0854  5'-Nucleotidase domain protein  27.32 
 
 
619 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192901  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1235  5'-Nucleotidase domain protein  31.67 
 
 
613 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.798144  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  28.51 
 
 
539 aa  144  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0223  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.1 
 
 
567 aa  142  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2272  5'-Nucleotidase domain protein  27.65 
 
 
698 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  31.42 
 
 
560 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2257  5'-nucleotidase family protein  28.18 
 
 
533 aa  139  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000083157  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  25.55 
 
 
530 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2368  5'-nucleotidase-like  27.4 
 
 
578 aa  136  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.287077  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  24.15 
 
 
504 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  28.13 
 
 
555 aa  134  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0023  cell wall anchor domain-containing protein  27.06 
 
 
772 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0275377  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  31.16 
 
 
559 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0023  cell wall anchor domain-containing protein  27.06 
 
 
772 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.244704  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  25.71 
 
 
518 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  25.51 
 
 
518 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  25.71 
 
 
518 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4307  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.55 
 
 
560 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2370  5'-nucleotidase, putative  27.58 
 
 
573 aa  131  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.405664 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  25.51 
 
 
518 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.95 
 
 
722 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  25.71 
 
 
518 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1414  5`-nucleotidase  29.55 
 
 
560 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  26.97 
 
 
505 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2137  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.3 
 
 
571 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000210765  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2309  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.26 
 
 
572 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.897886  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2135  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.98 
 
 
567 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035246  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>