More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0741 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  100 
 
 
508 aa  1029    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  53.61 
 
 
504 aa  556  1e-157  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  33.4 
 
 
516 aa  269  7e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  34.73 
 
 
530 aa  268  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  35.25 
 
 
587 aa  262  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.58 
 
 
517 aa  260  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  34.26 
 
 
659 aa  259  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  33.82 
 
 
529 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  33.82 
 
 
529 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  33.7 
 
 
529 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.58 
 
 
533 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  32.67 
 
 
518 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.24 
 
 
627 aa  250  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.58 
 
 
1284 aa  250  5e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  32.21 
 
 
518 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  33.46 
 
 
529 aa  250  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  32.21 
 
 
518 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  33.46 
 
 
529 aa  250  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  33.46 
 
 
529 aa  249  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  33.46 
 
 
529 aa  249  7e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  32.67 
 
 
518 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  32.01 
 
 
518 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  33 
 
 
523 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  33.46 
 
 
529 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.73 
 
 
607 aa  247  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  31.04 
 
 
539 aa  247  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  33.09 
 
 
657 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.53 
 
 
605 aa  246  6e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  30.77 
 
 
523 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  34.23 
 
 
1215 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  32.6 
 
 
523 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  35.67 
 
 
508 aa  244  3e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  33.15 
 
 
529 aa  244  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  35.67 
 
 
508 aa  244  3e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.64 
 
 
529 aa  244  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  33.59 
 
 
532 aa  243  7e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  34.29 
 
 
1202 aa  243  7e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  34.97 
 
 
520 aa  242  9e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  32.67 
 
 
517 aa  240  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.46 
 
 
530 aa  240  5e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  34.02 
 
 
555 aa  238  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  32.66 
 
 
529 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  32.47 
 
 
529 aa  236  7e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  32.47 
 
 
529 aa  236  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  32.47 
 
 
529 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  32.47 
 
 
529 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  32.47 
 
 
529 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  32.1 
 
 
529 aa  234  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  35.61 
 
 
556 aa  234  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  32.35 
 
 
529 aa  234  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.29 
 
 
529 aa  234  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  32.29 
 
 
529 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  33.53 
 
 
558 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  32.26 
 
 
515 aa  231  3e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  35.43 
 
 
509 aa  230  5e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  32.29 
 
 
526 aa  229  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  32.24 
 
 
560 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  32.54 
 
 
529 aa  227  5.0000000000000005e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0229  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.78 
 
 
567 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  31.6 
 
 
663 aa  224  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0268  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.15 
 
 
567 aa  221  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492479 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  34.33 
 
 
520 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  32.03 
 
 
638 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  30.85 
 
 
1181 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  30.64 
 
 
1175 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1162  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.25 
 
 
509 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.587696  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3482  5'-Nucleotidase domain protein  32.43 
 
 
611 aa  213  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  33.01 
 
 
503 aa  212  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  30.84 
 
 
607 aa  210  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2145  5'-Nucleotidase domain protein  32.17 
 
 
569 aa  207  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  30.54 
 
 
559 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  30.47 
 
 
558 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2257  5'-nucleotidase family protein  28.89 
 
 
533 aa  204  4e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000083157  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.52 
 
 
557 aa  202  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  28.85 
 
 
523 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  30.02 
 
 
555 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4357  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  31.19 
 
 
535 aa  201  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000122656  decreased coverage  0.0000528459 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  28.65 
 
 
520 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  28.65 
 
 
520 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1147  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.18 
 
 
561 aa  200  6e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.33 
 
 
722 aa  199  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.65 
 
 
523 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  28.25 
 
 
504 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  29.16 
 
 
515 aa  197  3e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  27.97 
 
 
489 aa  190  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0860  5'-Nucleotidase domain protein  30.49 
 
 
580 aa  190  7e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.917974 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05939  conserved hypothetical protein  30.06 
 
 
582 aa  189  8e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0448  5'-nucleotidase family protein  32.01 
 
 
580 aa  189  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  30.2 
 
 
505 aa  189  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0023  cell wall anchor domain-containing protein  30.25 
 
 
772 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.244704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0023  cell wall anchor domain-containing protein  30.25 
 
 
772 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0275377  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.34 
 
 
578 aa  186  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2906  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.01 
 
 
872 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.865364  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1414  5`-nucleotidase  29.62 
 
 
560 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1753  UshA protein  29.4 
 
 
508 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07100  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  31.89 
 
 
597 aa  183  7e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.593719  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2731  hypothetical protein  26.9 
 
 
575 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4307  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.37 
 
 
560 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4363  cell wall anchor domain-containing protein  25.87 
 
 
633 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3032  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  28.96 
 
 
551 aa  182  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0289029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>