More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0448 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0448  5'-nucleotidase family protein  100 
 
 
580 aa  1170    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0356  5'-nucleotidase  49.73 
 
 
655 aa  507  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0863234 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  49.82 
 
 
557 aa  499  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  49.82 
 
 
559 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  48.64 
 
 
558 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  47.22 
 
 
607 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  47.47 
 
 
560 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  46.39 
 
 
555 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3482  5'-Nucleotidase domain protein  44.93 
 
 
611 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0268  5'-nucleotidase domain-containing protein  44.88 
 
 
567 aa  434  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4270  5'-Nucleotidase domain-containing protein  41.07 
 
 
588 aa  424  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0229  5'-nucleotidase domain-containing protein  43.81 
 
 
567 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  43.32 
 
 
578 aa  410  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3391  5'-Nucleotidase domain protein  43.77 
 
 
585 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2368  5'-nucleotidase-like  41.67 
 
 
578 aa  400  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.287077  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4541  5'-nucleotidase domain-containing protein  41.27 
 
 
604 aa  397  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101042  normal  0.534355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0894  putative 5'-nucleotidase family protein  37.26 
 
 
602 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0143  5'-Nucleotidase domain protein  40.21 
 
 
575 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2145  5'-Nucleotidase domain protein  40.3 
 
 
569 aa  360  4e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07100  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  40.47 
 
 
597 aa  355  1e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.593719  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0559  5'-nucleotidase  42.83 
 
 
583 aa  353  4e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.562968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00130  5-nucleotidase/phosphoesterase  38.17 
 
 
571 aa  334  3e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.7 
 
 
722 aa  332  8e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  34.75 
 
 
529 aa  326  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  34.92 
 
 
529 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  34.92 
 
 
529 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  34.75 
 
 
529 aa  325  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  34.75 
 
 
529 aa  325  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  34.58 
 
 
529 aa  323  4e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  34.95 
 
 
529 aa  323  6e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4307  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.23 
 
 
560 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1414  5`-nucleotidase  36.3 
 
 
560 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  34.6 
 
 
529 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.78 
 
 
529 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  35.39 
 
 
529 aa  317  5e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  37.98 
 
 
556 aa  316  9e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  34.26 
 
 
529 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  35.56 
 
 
529 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  35.56 
 
 
529 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  35.56 
 
 
529 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  35.69 
 
 
529 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  35.39 
 
 
529 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  35.39 
 
 
529 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  35.51 
 
 
529 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  35.73 
 
 
529 aa  312  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.03 
 
 
530 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.21 
 
 
529 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0860  5'-Nucleotidase domain protein  34.86 
 
 
580 aa  282  9e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2321  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.16 
 
 
731 aa  277  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857665  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1162  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.52 
 
 
509 aa  268  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.587696  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1086  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.87 
 
 
571 aa  268  2.9999999999999995e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.244523  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1147  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.37 
 
 
561 aa  266  8e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0875  5'-Nucleotidase domain protein  33.8 
 
 
580 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608431  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4841  5'-Nucleotidase domain-containing protein  32.65 
 
 
586 aa  263  8.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.374418  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.37 
 
 
1525 aa  256  9e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4846  5'-Nucleotidase domain-containing protein  29.77 
 
 
578 aa  250  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  31.44 
 
 
1512 aa  239  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  32.83 
 
 
1577 aa  238  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2724  5'-nucleotidase-like  30.97 
 
 
581 aa  233  6e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00164791  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2604  hypothetical protein  31.19 
 
 
574 aa  233  9e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2731  hypothetical protein  31.19 
 
 
575 aa  233  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  32.38 
 
 
1652 aa  225  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  32.01 
 
 
1577 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1461  5'-Nucleotidase domain protein  30.32 
 
 
583 aa  222  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.899956  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  31.21 
 
 
1506 aa  217  5e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0036  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  28.64 
 
 
1311 aa  216  7e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3554  5'-Nucleotidase domain protein  31 
 
 
870 aa  216  9e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00406796  hitchhiker  0.00346018 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1029  cell wall anchor domain-containing protein  31.17 
 
 
752 aa  204  4e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0457373  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  29.39 
 
 
1591 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  30.44 
 
 
504 aa  197  5.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.39 
 
 
508 aa  194  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1333  5'-nucleotidase family protein  29.65 
 
 
690 aa  191  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00306106  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  28.9 
 
 
520 aa  182  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1067  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase related esterase  27.58 
 
 
765 aa  181  4e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000206277  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27420  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  27.55 
 
 
826 aa  179  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.38 
 
 
607 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  27.38 
 
 
659 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  27.18 
 
 
657 aa  174  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.28 
 
 
1284 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  25.72 
 
 
530 aa  171  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  28.27 
 
 
1181 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.32 
 
 
605 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  29.03 
 
 
515 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  27.5 
 
 
1175 aa  167  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  27.02 
 
 
1202 aa  166  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  27.4 
 
 
1215 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2906  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.35 
 
 
872 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.865364  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.54 
 
 
523 aa  163  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.1 
 
 
627 aa  160  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  27.59 
 
 
523 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.43 
 
 
533 aa  156  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.92 
 
 
509 aa  156  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  26.57 
 
 
532 aa  154  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.17 
 
 
517 aa  153  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.9 
 
 
503 aa  152  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.89 
 
 
587 aa  152  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  25.95 
 
 
638 aa  152  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  26.04 
 
 
516 aa  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  27.72 
 
 
663 aa  148  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.79 
 
 
508 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>