More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2321 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2321  5'-nucleotidase domain-containing protein  100 
 
 
731 aa  1474    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857665  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  35.88 
 
 
1577 aa  321  3.9999999999999996e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  36.23 
 
 
1652 aa  316  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.28 
 
 
1525 aa  313  4.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  34.93 
 
 
1577 aa  311  2.9999999999999997e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  35.09 
 
 
1512 aa  310  6.999999999999999e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  35.07 
 
 
1506 aa  309  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.66 
 
 
557 aa  308  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3554  5'-Nucleotidase domain protein  35.92 
 
 
870 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00406796  hitchhiker  0.00346018 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0036  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  32.74 
 
 
1311 aa  303  1e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  36.95 
 
 
560 aa  297  6e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  36.54 
 
 
607 aa  296  7e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3482  5'-Nucleotidase domain protein  37.26 
 
 
611 aa  292  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  34.66 
 
 
529 aa  290  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  35.29 
 
 
529 aa  290  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  35.48 
 
 
529 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  35.48 
 
 
529 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  35.48 
 
 
529 aa  288  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  35.67 
 
 
529 aa  288  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  35.48 
 
 
529 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  36.41 
 
 
559 aa  288  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.29 
 
 
529 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  34.89 
 
 
529 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.3 
 
 
530 aa  283  9e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1414  5`-nucleotidase  33.1 
 
 
560 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0268  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.33 
 
 
567 aa  282  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492479 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  34.51 
 
 
529 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4307  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.74 
 
 
560 aa  281  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0356  5'-nucleotidase  35.52 
 
 
655 aa  279  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0863234 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  34.43 
 
 
529 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.05 
 
 
529 aa  279  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  34.81 
 
 
529 aa  278  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  34.43 
 
 
529 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  34.81 
 
 
529 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  34.81 
 
 
529 aa  278  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  34.26 
 
 
529 aa  278  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  34.86 
 
 
529 aa  278  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0229  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.39 
 
 
567 aa  277  5e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  34.86 
 
 
529 aa  277  6e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0448  5'-nucleotidase family protein  33.27 
 
 
580 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  34.68 
 
 
529 aa  275  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2368  5'-nucleotidase-like  34.58 
 
 
578 aa  272  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.287077  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  35.8 
 
 
558 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0143  5'-Nucleotidase domain protein  35.23 
 
 
575 aa  268  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.74 
 
 
578 aa  264  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00130  5-nucleotidase/phosphoesterase  32.3 
 
 
571 aa  261  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  34.83 
 
 
1591 aa  253  7e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  33.94 
 
 
555 aa  249  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.92 
 
 
722 aa  247  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3391  5'-Nucleotidase domain protein  35.6 
 
 
585 aa  244  6e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4270  5'-Nucleotidase domain-containing protein  33.78 
 
 
588 aa  238  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27420  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  32.98 
 
 
826 aa  234  3e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0894  putative 5'-nucleotidase family protein  32.95 
 
 
602 aa  234  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07100  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  34.84 
 
 
597 aa  228  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.593719  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0559  5'-nucleotidase  33.27 
 
 
583 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.562968  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  33.64 
 
 
556 aa  225  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4541  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.75 
 
 
604 aa  221  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101042  normal  0.534355 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2145  5'-Nucleotidase domain protein  32.45 
 
 
569 aa  220  7.999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4841  5'-Nucleotidase domain-containing protein  31.92 
 
 
586 aa  215  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.374418  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0860  5'-Nucleotidase domain protein  30.62 
 
 
580 aa  204  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1162  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.36 
 
 
509 aa  198  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.587696  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1147  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.76 
 
 
561 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  27.68 
 
 
504 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1461  5'-Nucleotidase domain protein  31.18 
 
 
583 aa  183  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.899956  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03620  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  30.38 
 
 
750 aa  181  4e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.422162  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2724  5'-nucleotidase-like  27.91 
 
 
581 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00164791  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4846  5'-Nucleotidase domain-containing protein  30.62 
 
 
578 aa  176  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  28.94 
 
 
520 aa  175  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2604  hypothetical protein  26.5 
 
 
574 aa  167  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1086  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.26 
 
 
571 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.244523  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2731  hypothetical protein  26.32 
 
 
575 aa  164  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.57 
 
 
508 aa  164  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  29.39 
 
 
659 aa  164  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0875  5'-Nucleotidase domain protein  28.55 
 
 
580 aa  161  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608431  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2906  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.66 
 
 
872 aa  158  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.865364  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.64 
 
 
1284 aa  158  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  28.17 
 
 
657 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  29.81 
 
 
555 aa  155  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.5 
 
 
607 aa  155  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1333  5'-nucleotidase family protein  27.64 
 
 
690 aa  151  4e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00306106  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  29.06 
 
 
518 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.59 
 
 
605 aa  144  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  29.07 
 
 
532 aa  144  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0015  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  27.36 
 
 
540 aa  144  8e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.77 
 
 
627 aa  144  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.73 
 
 
533 aa  142  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  28.68 
 
 
518 aa  142  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  29.21 
 
 
523 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  28.62 
 
 
517 aa  140  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  28.49 
 
 
518 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.49 
 
 
518 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.79 
 
 
516 aa  140  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  28.49 
 
 
518 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  27.8 
 
 
558 aa  140  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.03 
 
 
523 aa  140  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  24.96 
 
 
1215 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.51 
 
 
517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  25.34 
 
 
1202 aa  136  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4363  cell wall anchor domain-containing protein  26.59 
 
 
633 aa  135  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.12 
 
 
515 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>