More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2145 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2145  5'-Nucleotidase domain protein  100 
 
 
569 aa  1153    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  44.59 
 
 
558 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0268  5'-nucleotidase domain-containing protein  45.84 
 
 
567 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492479 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4541  5'-nucleotidase domain-containing protein  44.54 
 
 
604 aa  410  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101042  normal  0.534355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0229  5'-nucleotidase domain-containing protein  45.4 
 
 
567 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.29 
 
 
557 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3391  5'-Nucleotidase domain protein  43.25 
 
 
585 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  43.04 
 
 
560 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4270  5'-Nucleotidase domain-containing protein  42.26 
 
 
588 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  42.83 
 
 
555 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  42.19 
 
 
607 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.91 
 
 
578 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  41.81 
 
 
559 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0143  5'-Nucleotidase domain protein  41.19 
 
 
575 aa  364  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0356  5'-nucleotidase  41.45 
 
 
655 aa  354  2e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0863234 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0448  5'-nucleotidase family protein  39.92 
 
 
580 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0894  putative 5'-nucleotidase family protein  38.88 
 
 
602 aa  345  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  40.42 
 
 
556 aa  326  6e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3482  5'-Nucleotidase domain protein  40.29 
 
 
611 aa  323  4e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2368  5'-nucleotidase-like  39.56 
 
 
578 aa  322  9.999999999999999e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.287077  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.41 
 
 
530 aa  316  6e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  38.37 
 
 
529 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  38.57 
 
 
529 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  38.18 
 
 
529 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  38.18 
 
 
529 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  37.98 
 
 
529 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  37.98 
 
 
529 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  37.91 
 
 
529 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.64 
 
 
722 aa  313  5.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  38.18 
 
 
529 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.78 
 
 
529 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  37.91 
 
 
529 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  37.67 
 
 
529 aa  310  5e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  37.67 
 
 
529 aa  310  6.999999999999999e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  37.67 
 
 
529 aa  310  6.999999999999999e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  37.67 
 
 
529 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  37.67 
 
 
529 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  37.48 
 
 
529 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  37.48 
 
 
529 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  37.48 
 
 
529 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  37.48 
 
 
529 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.83 
 
 
529 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0559  5'-nucleotidase  39.31 
 
 
583 aa  295  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.562968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00130  5-nucleotidase/phosphoesterase  36.4 
 
 
571 aa  290  4e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07100  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  36.17 
 
 
597 aa  289  1e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.593719  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1414  5`-nucleotidase  34.93 
 
 
560 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4307  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.93 
 
 
560 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1147  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.5 
 
 
561 aa  266  7e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0860  5'-Nucleotidase domain protein  35.53 
 
 
580 aa  264  3e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1162  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.18 
 
 
509 aa  250  6e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.587696  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2724  5'-nucleotidase-like  33.21 
 
 
581 aa  239  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00164791  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2731  hypothetical protein  30.81 
 
 
575 aa  237  4e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2604  hypothetical protein  30.87 
 
 
574 aa  236  7e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0875  5'-Nucleotidase domain protein  33.9 
 
 
580 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608431  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  32.23 
 
 
504 aa  228  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.58 
 
 
1525 aa  228  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1086  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.52 
 
 
571 aa  228  3e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.244523  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4841  5'-Nucleotidase domain-containing protein  30.96 
 
 
586 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.374418  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0036  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  30.97 
 
 
1311 aa  216  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  31.67 
 
 
1577 aa  211  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.17 
 
 
508 aa  209  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4846  5'-Nucleotidase domain-containing protein  29.59 
 
 
578 aa  208  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2321  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.95 
 
 
731 aa  208  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857665  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  33.27 
 
 
1652 aa  207  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  32.54 
 
 
1512 aa  206  6e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1029  cell wall anchor domain-containing protein  31.32 
 
 
752 aa  206  7e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0457373  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3554  5'-Nucleotidase domain protein  33.1 
 
 
870 aa  205  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00406796  hitchhiker  0.00346018 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  31.6 
 
 
1577 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  31.15 
 
 
1202 aa  196  8.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  30.77 
 
 
1215 aa  193  7e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1461  5'-Nucleotidase domain protein  29.38 
 
 
583 aa  189  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.899956  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  31.31 
 
 
1591 aa  189  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  30.12 
 
 
1506 aa  187  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1333  5'-nucleotidase family protein  31.4 
 
 
690 aa  186  9e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00306106  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  29.38 
 
 
1181 aa  176  8e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  28.96 
 
 
1175 aa  176  8e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27420  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  29.57 
 
 
826 aa  176  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  29.43 
 
 
520 aa  170  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1067  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase related esterase  28.02 
 
 
765 aa  165  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000206277  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  29.64 
 
 
659 aa  160  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.38 
 
 
515 aa  159  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.08 
 
 
1284 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  27.64 
 
 
558 aa  156  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  28.79 
 
 
657 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.79 
 
 
508 aa  154  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.79 
 
 
508 aa  154  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.36 
 
 
607 aa  153  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.66 
 
 
587 aa  151  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2257  5'-nucleotidase family protein  25.4 
 
 
533 aa  150  5e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000083157  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.36 
 
 
605 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.06 
 
 
509 aa  148  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  26.65 
 
 
518 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.6 
 
 
555 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.86 
 
 
518 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  26.45 
 
 
518 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.45 
 
 
518 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  26.45 
 
 
518 aa  147  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  26.07 
 
 
530 aa  145  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  26.94 
 
 
520 aa  145  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.02 
 
 
517 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>