More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0364 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3554  5'-Nucleotidase domain protein  55.89 
 
 		 870 aa  709    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00406796  hitchhiker  0.00346018 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0036  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  54.07 
 
 		 1311 aa  639    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  61.04 
 
 		 1577 aa  1578    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  65.42 
 
 		 1652 aa  1794    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  54.65 
 
 		 1512 aa  1350    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  100 
 
 		 1577 aa  3099    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  53.71 
 
 		 1525 aa  1351    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  56.48 
 
 		 1591 aa  1435    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  57.8 
 
 		 1506 aa  1426    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2322  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.52 
 
 		 929 aa  629  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.451149  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03610  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  45.05 
 
 		 902 aa  531  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230337  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27420  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  39.94 
 
 		 826 aa  382  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  37.27 
 
 		 795 aa  379  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2321  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.44 
 
 		 731 aa  317  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857665  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.33 
 
 		 868 aa  300  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.08 
 
 		 848 aa  299  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  28.85 
 
 		 2667 aa  288  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0828  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.41 
 
 		 818 aa  285  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.182782 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  28.17 
 
 		 2775 aa  285  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.02 
 
 		 1266 aa  285  7.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 940 aa  281  5e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.17 
 
 		 818 aa  279  4e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.89 
 
 		 2346 aa  274  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  32.77 
 
 		 780 aa  270  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  33.25 
 
 		 780 aa  270  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.24 
 
 		 942 aa  268  5e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  34.8 
 
 		 1503 aa  268  5e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.86 
 
 		 955 aa  265  4.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.4 
 
 		 573 aa  265  6.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.04 
 
 		 578 aa  263  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.28 
 
 		 1075 aa  263  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  31.1 
 
 		 948 aa  263  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.49 
 
 		 1641 aa  263  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03620  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  35.39 
 
 		 750 aa  260  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.422162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.69 
 
 		 1641 aa  261  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  30.47 
 
 		 948 aa  258  9e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.45 
 
 		 945 aa  256  3e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.44 
 
 		 944 aa  256  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  30.98 
 
 		 948 aa  255  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0259  putative extracellular nuclease  35.09 
 
 		 624 aa  254  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  34.33 
 
 		 560 aa  254  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0292  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.09 
 
 		 624 aa  254  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.262594  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1440  putative extracellular nuclease  35.09 
 
 		 624 aa  254  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1637  putative extracellular nuclease  35.09 
 
 		 624 aa  254  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2498  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.09 
 
 		 624 aa  254  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.209723  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2637  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.09 
 
 		 624 aa  254  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.541694  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2286  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.78 
 
 		 621 aa  252  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  33.96 
 
 		 944 aa  252  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0143  5'-Nucleotidase domain protein  34.03 
 
 		 575 aa  252  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.45 
 
 		 603 aa  251  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  33.96 
 
 		 944 aa  250  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.32 
 
 		 826 aa  251  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  30.55 
 
 		 948 aa  249  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  33.81 
 
 		 944 aa  249  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  33.96 
 
 		 944 aa  249  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0532  extracellular nuclease, putative  35.51 
 
 		 622 aa  249  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  31.92 
 
 		 1310 aa  248  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  33.78 
 
 		 1346 aa  246  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.8 
 
 		 1284 aa  246  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.23 
 
 		 1148 aa  244  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  33.57 
 
 		 559 aa  242  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3357  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.86 
 
 		 604 aa  243  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.44 
 
 		 1148 aa  242  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  34.15 
 
 		 558 aa  241  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  32.63 
 
 		 555 aa  239  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5194  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.02 
 
 		 604 aa  239  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.49 
 
 		 604 aa  237  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  33.28 
 
 		 607 aa  237  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.21 
 
 		 653 aa  236  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240387  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2368  5'-nucleotidase-like  32.37 
 
 		 578 aa  236  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.287077  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0419  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.73 
 
 		 1052 aa  236  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0131268  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0934  extracellular nuclease  35.48 
 
 		 514 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4749  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.12 
 
 		 604 aa  234  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3418  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.12 
 
 		 604 aa  234  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.88 
 
 		 557 aa  233  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4098  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.17 
 
 		 604 aa  233  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535753 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.66 
 
 		 601 aa  228  9e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3482  5'-Nucleotidase domain protein  32.72 
 
 		 611 aa  227  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.07 
 
 		 600 aa  226  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187879  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1568  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.38 
 
 		 942 aa  226  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.0647375 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0270  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.28 
 
 		 641 aa  226  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.527105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5536  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.94 
 
 		 627 aa  224  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.8971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  31.57 
 
 		 529 aa  221  7e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  31.57 
 
 		 529 aa  221  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  31.57 
 
 		 529 aa  221  7e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0356  5'-nucleotidase  31.57 
 
 		 655 aa  221  7.999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0863234 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  31.57 
 
 		 529 aa  221  8.999999999999998e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  31.57 
 
 		 529 aa  221  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4270  5'-Nucleotidase domain-containing protein  32.05 
 
 		 588 aa  221  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  31.57 
 
 		 529 aa  221  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  31.35 
 
 		 529 aa  220  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  33.89 
 
 		 2796 aa  219  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  31.77 
 
 		 529 aa  218  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0448  5'-nucleotidase family protein  31.78 
 
 		 580 aa  218  9e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  31.13 
 
 		 529 aa  217  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  31.13 
 
 		 529 aa  217  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  31.13 
 
 		 529 aa  217  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  31.13 
 
 		 529 aa  217  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  30.97 
 
 		 529 aa  217  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  31.13 
 
 		 529 aa  217  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>