129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3357 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0828  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  66.2 
 
 
818 aa  770    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.182782 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0259  putative extracellular nuclease  80.77 
 
 
624 aa  932    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  60.31 
 
 
653 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240387  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0934  extracellular nuclease  81.35 
 
 
514 aa  806    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2286  endonuclease/exonuclease/phosphatase  66.67 
 
 
621 aa  776    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  92.55 
 
 
604 aa  1058    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0532  extracellular nuclease, putative  81.72 
 
 
622 aa  890    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  66.2 
 
 
848 aa  783    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4553  endonuclease/exonuclease/phosphatase  67.25 
 
 
620 aa  732    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4749  endonuclease/exonuclease/phosphatase  92.37 
 
 
604 aa  1040    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5194  endonuclease/exonuclease/phosphatase  98.34 
 
 
604 aa  1210    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337928  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5536  endonuclease/exonuclease/phosphatase  66.61 
 
 
627 aa  734    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3418  endonuclease/exonuclease/phosphatase  92.37 
 
 
604 aa  1040    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3810  endonuclease/exonuclease/phosphatase  67.25 
 
 
599 aa  731    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1440  putative extracellular nuclease  80.77 
 
 
624 aa  932    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1637  putative extracellular nuclease  80.77 
 
 
624 aa  932    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2637  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  82.31 
 
 
624 aa  925    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.541694  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2498  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  82.31 
 
 
624 aa  924    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.209723  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0292  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  80.77 
 
 
624 aa  932    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.262594  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  93.79 
 
 
603 aa  1058    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79221  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3714  endonuclease/exonuclease/phosphatase  67.08 
 
 
620 aa  729    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.495775 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4098  endonuclease/exonuclease/phosphatase  92.38 
 
 
604 aa  1043    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.535753 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3357  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
604 aa  1231    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  66.83 
 
 
600 aa  749    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187879  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  65.16 
 
 
818 aa  762    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.87 
 
 
826 aa  565  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.8 
 
 
1075 aa  487  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  48.45 
 
 
780 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  47.93 
 
 
780 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  44.96 
 
 
1310 aa  471  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.92 
 
 
947 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  44.43 
 
 
948 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  44.43 
 
 
948 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  44.26 
 
 
948 aa  428  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.37 
 
 
2346 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.12 
 
 
945 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  43.62 
 
 
948 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  44.13 
 
 
1503 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.61 
 
 
955 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  43.24 
 
 
944 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.41 
 
 
944 aa  414  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.98 
 
 
1641 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  43.24 
 
 
944 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  43.07 
 
 
944 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  43.07 
 
 
944 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.87 
 
 
942 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.15 
 
 
1266 aa  402  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.55 
 
 
1641 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  41.61 
 
 
1346 aa  396  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.78 
 
 
940 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.2 
 
 
573 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.78 
 
 
1148 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.34 
 
 
1148 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0110  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.63 
 
 
586 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738543  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0270  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.69 
 
 
641 aa  368  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.527105  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  42.98 
 
 
795 aa  365  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1568  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.03 
 
 
942 aa  363  3e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.0647375 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.38 
 
 
601 aa  363  7.0000000000000005e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0419  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.75 
 
 
1052 aa  357  3.9999999999999996e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0131268  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.56 
 
 
1284 aa  319  9e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  34.11 
 
 
2667 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1737  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.24 
 
 
570 aa  287  4e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.979917  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03816  nuclease  37.13 
 
 
572 aa  282  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0201  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.83 
 
 
481 aa  280  7e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.418254  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  35.34 
 
 
2775 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  33.84 
 
 
2796 aa  272  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2322  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.53 
 
 
929 aa  262  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.451149  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1188  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.83 
 
 
575 aa  259  9e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219404  normal  0.0718602 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  35.16 
 
 
1577 aa  253  9.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  34.18 
 
 
1652 aa  253  9.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3718  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.58 
 
 
870 aa  252  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2843  extracellular nuclease-like  32.82 
 
 
945 aa  251  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0894144  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.94 
 
 
871 aa  251  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00309211  normal  0.0976082 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  35.73 
 
 
1512 aa  248  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3281  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.13 
 
 
1123 aa  246  8e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310372  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0904  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.19 
 
 
870 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00895191  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3033  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.97 
 
 
870 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.441038  normal  0.600162 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03610  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  34.63 
 
 
902 aa  244  3e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230337  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2906  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.78 
 
 
873 aa  244  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.435339  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0941  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.89 
 
 
870 aa  244  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.578163  normal  0.129599 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0890  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.33 
 
 
870 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.298934  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3472  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.98 
 
 
870 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0137942  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2945  extracellular nuclease  31.47 
 
 
865 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.172583 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3595  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.98 
 
 
870 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0433948  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1063  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.52 
 
 
554 aa  241  4e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01770  predicted extracellular nuclease  32.32 
 
 
863 aa  241  4e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.609758  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.87 
 
 
1525 aa  240  5.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  33.44 
 
 
1577 aa  239  9e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3397  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.83 
 
 
870 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00146831  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.56 
 
 
868 aa  237  5.0000000000000005e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002273  predicted extracellular nuclease  32.14 
 
 
984 aa  236  9e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1066  extracellular nuclease  31.16 
 
 
871 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3009  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.2 
 
 
876 aa  234  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00148055  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1364  putative exported nuclease  31.35 
 
 
890 aa  232  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00081  nuclease  31.63 
 
 
982 aa  230  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  34.19 
 
 
1591 aa  229  8e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3943  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.84 
 
 
885 aa  225  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.439448 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  33.53 
 
 
1506 aa  223  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.89 
 
 
1010 aa  222  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.434546 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3886  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.96 
 
 
894 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000584422 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>