136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0941 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3397  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  93.33 
 
 		 870 aa  1665    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00146831  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1066  extracellular nuclease  91.95 
 
 		 871 aa  1602    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002273  predicted extracellular nuclease  48.82 
 
 		 984 aa  755    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2906  endonuclease/exonuclease/phosphatase  75.57 
 
 		 873 aa  1347    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.435339  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3033  endonuclease/exonuclease/phosphatase  99.54 
 
 		 870 aa  1770    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.441038  normal  0.600162 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0941  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 870 aa  1776    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.578163  normal  0.129599 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3718  endonuclease/exonuclease/phosphatase  69.31 
 
 		 870 aa  1233    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0904  endonuclease/exonuclease/phosphatase  98.16 
 
 		 870 aa  1749    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00895191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2945  extracellular nuclease  73.88 
 
 		 865 aa  1315    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.172583 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0890  endonuclease/exonuclease/phosphatase  93.33 
 
 		 870 aa  1667    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.298934  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  74.64 
 
 		 871 aa  1286    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00309211  normal  0.0976082 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3009  endonuclease/exonuclease/phosphatase  90.73 
 
 		 876 aa  1607    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00148055  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3472  endonuclease/exonuclease/phosphatase  93.56 
 
 		 870 aa  1669    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0137942  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00081  nuclease  47.66 
 
 		 982 aa  739    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3943  endonuclease/exonuclease/phosphatase  60.27 
 
 		 885 aa  1047    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.439448 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3944  endonuclease/exonuclease/phosphatase  59.42 
 
 		 892 aa  1026    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000110843  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3595  endonuclease/exonuclease/phosphatase  93.33 
 
 		 870 aa  1665    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0433948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3886  endonuclease/exonuclease/phosphatase  62.25 
 
 		 894 aa  1060    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000584422 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1364  putative exported nuclease  49.07 
 
 		 890 aa  786    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2198  hypothetical protein  41.2 
 
 		 869 aa  572  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.18 
 
 		 1010 aa  542  9.999999999999999e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.434546 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.33 
 
 		 945 aa  376  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  32.99 
 
 		 948 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.6 
 
 		 955 aa  369  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  33.1 
 
 		 948 aa  365  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.79 
 
 		 947 aa  364  4e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  35.56 
 
 		 780 aa  362  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  35.25 
 
 		 780 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.02 
 
 		 940 aa  356  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  32.72 
 
 		 948 aa  355  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  32.6 
 
 		 948 aa  355  2e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.44 
 
 		 942 aa  353  8.999999999999999e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  32.44 
 
 		 944 aa  348  3e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  32.33 
 
 		 944 aa  348  4e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  34.56 
 
 		 1310 aa  347  5e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.29 
 
 		 944 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  32.21 
 
 		 944 aa  344  4e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  32.21 
 
 		 944 aa  343  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.29 
 
 		 1075 aa  336  1e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  34.08 
 
 		 1346 aa  331  3e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.48 
 
 		 826 aa  316  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0828  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.79 
 
 		 818 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.182782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.83 
 
 		 818 aa  304  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.83 
 
 		 848 aa  294  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01770  predicted extracellular nuclease  30.66 
 
 		 863 aa  291  3e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.609758  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  32.65 
 
 		 1503 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.46 
 
 		 1641 aa  259  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0419  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.36 
 
 		 1052 aa  257  6e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0131268  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.88 
 
 		 1641 aa  253  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0259  putative extracellular nuclease  31.33 
 
 		 624 aa  243  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1440  putative extracellular nuclease  31.33 
 
 		 624 aa  243  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1637  putative extracellular nuclease  31.33 
 
 		 624 aa  243  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2637  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.33 
 
 		 624 aa  242  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.541694  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0292  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.33 
 
 		 624 aa  243  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.262594  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.55 
 
 		 601 aa  241  5e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2498  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.17 
 
 		 624 aa  240  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.209723  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.56 
 
 		 1266 aa  239  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  30.93 
 
 		 795 aa  238  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0270  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.85 
 
 		 641 aa  238  5.0000000000000005e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.527105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.74 
 
 		 603 aa  236  9e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4749  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.84 
 
 		 604 aa  235  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3418  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.84 
 
 		 604 aa  235  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4098  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.84 
 
 		 604 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.41 
 
 		 604 aa  230  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.12 
 
 		 573 aa  229  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5194  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.78 
 
 		 604 aa  229  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3357  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.54 
 
 		 604 aa  229  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0532  extracellular nuclease, putative  30.66 
 
 		 622 aa  228  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.63 
 
 		 1148 aa  227  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.07 
 
 		 1148 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.92 
 
 		 2346 aa  221  7e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0934  extracellular nuclease  31.99 
 
 		 514 aa  218  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1568  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.47 
 
 		 942 aa  216  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.0647375 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.35 
 
 		 600 aa  204  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187879  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5536  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.55 
 
 		 627 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.8971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  28.75 
 
 		 1652 aa  195  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2286  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.94 
 
 		 621 aa  193  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3810  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.97 
 
 		 599 aa  191  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4553  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.82 
 
 		 620 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3714  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.82 
 
 		 620 aa  190  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.495775 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.44 
 
 		 1284 aa  187  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.31 
 
 		 868 aa  180  9e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.73 
 
 		 653 aa  180  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240387  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0110  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.34 
 
 		 586 aa  175  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738543  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  30.04 
 
 		 2796 aa  174  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  29.87 
 
 		 1506 aa  174  5.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  29.34 
 
 		 1577 aa  174  5.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2843  extracellular nuclease-like  27.42 
 
 		 945 aa  173  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0894144  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  29 
 
 		 1591 aa  172  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  29.06 
 
 		 2775 aa  171  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0201  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.78 
 
 		 481 aa  171  8e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.418254  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  28.76 
 
 		 2667 aa  170  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3281  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.07 
 
 		 1123 aa  167  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.27 
 
 		 1525 aa  163  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  28.3 
 
 		 1577 aa  163  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2322  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.49 
 
 		 929 aa  158  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.451149  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  28.31 
 
 		 1512 aa  152  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1737  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.48 
 
 		 570 aa  151  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.979917  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1188  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.82 
 
 		 575 aa  139  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219404  normal  0.0718602 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03610  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  27.47 
 
 		 902 aa  132  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>