More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0697 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  100 
 
 
1506 aa  3014    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  59.73 
 
 
1577 aa  1401    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  57.69 
 
 
1591 aa  1373    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  57.88 
 
 
1577 aa  1409    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  51.08 
 
 
1525 aa  1118    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  54.08 
 
 
1652 aa  1399    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  51.25 
 
 
1512 aa  1108    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0036  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  51.26 
 
 
1311 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3554  5'-Nucleotidase domain protein  45.01 
 
 
870 aa  596  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00406796  hitchhiker  0.00346018 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2322  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.28 
 
 
929 aa  508  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.451149  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03610  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  46.47 
 
 
902 aa  444  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230337  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27420  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  40.2 
 
 
826 aa  363  1e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2321  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.07 
 
 
731 aa  306  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857665  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.2 
 
 
868 aa  301  7e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03620  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  33.56 
 
 
750 aa  278  6e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.422162  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.98 
 
 
942 aa  267  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.39 
 
 
826 aa  267  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  35.87 
 
 
795 aa  266  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.6 
 
 
1075 aa  264  8e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.29 
 
 
818 aa  260  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.61 
 
 
848 aa  260  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0828  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.82 
 
 
818 aa  258  7e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.182782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  31.03 
 
 
2667 aa  257  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.28 
 
 
945 aa  255  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.89 
 
 
2346 aa  254  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0419  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.74 
 
 
1052 aa  252  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0131268  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  34.19 
 
 
780 aa  251  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  33.6 
 
 
780 aa  250  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35 
 
 
573 aa  249  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  33.55 
 
 
1346 aa  248  6e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.57 
 
 
1266 aa  247  9.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.98 
 
 
1284 aa  246  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0110  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.82 
 
 
586 aa  244  7e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738543  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.38 
 
 
947 aa  244  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0259  putative extracellular nuclease  33.95 
 
 
624 aa  241  5e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0292  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.95 
 
 
624 aa  241  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.262594  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1440  putative extracellular nuclease  33.95 
 
 
624 aa  241  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1637  putative extracellular nuclease  33.95 
 
 
624 aa  241  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2498  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.95 
 
 
624 aa  241  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.209723  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2637  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.95 
 
 
624 aa  241  9e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.541694  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0532  extracellular nuclease, putative  33.91 
 
 
622 aa  240  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.54 
 
 
940 aa  240  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  27.45 
 
 
2775 aa  239  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1568  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.04 
 
 
942 aa  238  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.0647375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  31.92 
 
 
558 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0143  5'-Nucleotidase domain protein  32.87 
 
 
575 aa  236  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.3 
 
 
557 aa  236  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.41 
 
 
1148 aa  236  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
955 aa  236  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  32.81 
 
 
948 aa  235  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.8 
 
 
604 aa  235  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  31.88 
 
 
1310 aa  234  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.23 
 
 
603 aa  233  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79221  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  31.67 
 
 
560 aa  233  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.35 
 
 
578 aa  231  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2286  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.39 
 
 
621 aa  231  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32 
 
 
1148 aa  231  9e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.75 
 
 
1641 aa  230  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  32.19 
 
 
944 aa  230  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  33.12 
 
 
948 aa  230  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  32.55 
 
 
529 aa  230  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  32.55 
 
 
529 aa  230  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.09 
 
 
1641 aa  229  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  32.37 
 
 
529 aa  230  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  32.45 
 
 
948 aa  230  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  32.59 
 
 
529 aa  229  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  32.37 
 
 
529 aa  229  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  32.37 
 
 
529 aa  229  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  33.39 
 
 
1503 aa  229  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.54 
 
 
944 aa  229  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  32.55 
 
 
529 aa  228  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  32.14 
 
 
948 aa  228  9e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.91 
 
 
653 aa  227  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240387  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  32.16 
 
 
559 aa  228  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  31.85 
 
 
529 aa  227  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  32.03 
 
 
944 aa  226  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  32.03 
 
 
944 aa  227  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  32.22 
 
 
529 aa  224  8e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0270  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.36 
 
 
641 aa  224  8e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.527105  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.54 
 
 
530 aa  224  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4098  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.4 
 
 
604 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.535753 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4749  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.4 
 
 
604 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3418  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.4 
 
 
604 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.3 
 
 
529 aa  224  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  31.07 
 
 
555 aa  223  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  32.46 
 
 
607 aa  223  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.77 
 
 
722 aa  223  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  31.53 
 
 
944 aa  222  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2368  5'-nucleotidase-like  30.65 
 
 
578 aa  222  5e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.287077  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3357  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.55 
 
 
604 aa  221  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5194  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.76 
 
 
604 aa  220  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337928  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.83 
 
 
600 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187879  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  29.84 
 
 
529 aa  216  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  29.66 
 
 
529 aa  216  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.3 
 
 
601 aa  215  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  29.73 
 
 
529 aa  215  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  29.66 
 
 
529 aa  215  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  29.73 
 
 
529 aa  215  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  29.66 
 
 
529 aa  215  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.06 
 
 
529 aa  215  5.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>