More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4302 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  60.77 
 
 		 557 aa  669    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  83.96 
 
 		 559 aa  924    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  74.34 
 
 		 558 aa  793    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  100 
 
 		 607 aa  1223    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  66.67 
 
 		 555 aa  715    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  77.21 
 
 		 560 aa  828    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0356  5'-nucleotidase  50.36 
 
 		 655 aa  506  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0863234 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0268  5'-nucleotidase domain-containing protein  47.4 
 
 		 567 aa  485  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492479 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0448  5'-nucleotidase family protein  48.47 
 
 		 580 aa  479  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3391  5'-Nucleotidase domain protein  49.73 
 
 		 585 aa  481  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0229  5'-nucleotidase domain-containing protein  46.98 
 
 		 567 aa  479  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4541  5'-nucleotidase domain-containing protein  47.87 
 
 		 604 aa  468  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101042  normal  0.534355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3482  5'-Nucleotidase domain protein  46.99 
 
 		 611 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4270  5'-Nucleotidase domain-containing protein  43.44 
 
 		 588 aa  430  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  44.2 
 
 		 578 aa  431  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0143  5'-Nucleotidase domain protein  42.96 
 
 		 575 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2368  5'-nucleotidase-like  41.3 
 
 		 578 aa  387  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.287077  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2145  5'-Nucleotidase domain protein  42.19 
 
 		 569 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07100  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  41.88 
 
 		 597 aa  372  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.593719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0894  putative 5'-nucleotidase family protein  37.83 
 
 		 602 aa  365  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0559  5'-nucleotidase  42.6 
 
 		 583 aa  363  4e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.562968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00130  5-nucleotidase/phosphoesterase  39.17 
 
 		 571 aa  362  7.0000000000000005e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4307  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.52 
 
 		 560 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.2 
 
 		 722 aa  361  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1414  5`-nucleotidase  38.52 
 
 		 560 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  40.15 
 
 		 556 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  36.06 
 
 		 529 aa  343  7e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.85 
 
 		 530 aa  342  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  35.87 
 
 		 529 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  35.87 
 
 		 529 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  35.87 
 
 		 529 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  35.87 
 
 		 529 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  35.69 
 
 		 529 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  35.69 
 
 		 529 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  35.5 
 
 		 529 aa  334  3e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  35.5 
 
 		 529 aa  334  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  36.19 
 
 		 529 aa  332  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.4 
 
 		 529 aa  331  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  36.01 
 
 		 529 aa  330  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.65 
 
 		 529 aa  330  6e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  35.88 
 
 		 529 aa  330  6e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  35.88 
 
 		 529 aa  330  6e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  36.59 
 
 		 529 aa  330  7e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  36.59 
 
 		 529 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  36.59 
 
 		 529 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  36.4 
 
 		 529 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  35.47 
 
 		 529 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1162  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.95 
 
 		 509 aa  298  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.587696  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1147  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.94 
 
 		 561 aa  287  5e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2321  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.54 
 
 		 731 aa  286  8e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857665  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0860  5'-Nucleotidase domain protein  34.53 
 
 		 580 aa  283  7.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1086  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.4 
 
 		 571 aa  258  2e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.244523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0875  5'-Nucleotidase domain protein  33.04 
 
 		 580 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2724  5'-nucleotidase-like  32.45 
 
 		 581 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00164791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  32.93 
 
 		 1512 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4841  5'-Nucleotidase domain-containing protein  32.46 
 
 		 586 aa  251  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.374418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1461  5'-Nucleotidase domain protein  32.92 
 
 		 583 aa  249  8e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.899956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  32.59 
 
 		 1577 aa  246  6e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4846  5'-Nucleotidase domain-containing protein  32.26 
 
 		 578 aa  246  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2731  hypothetical protein  30.65 
 
 		 575 aa  246  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2604  hypothetical protein  31 
 
 		 574 aa  244  5e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3554  5'-Nucleotidase domain protein  34.31 
 
 		 870 aa  242  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00406796  hitchhiker  0.00346018 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  33.85 
 
 		 1652 aa  236  8e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.82 
 
 		 1525 aa  236  9e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0036  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  31.5 
 
 		 1311 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  32.71 
 
 		 1577 aa  232  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  32.46 
 
 		 1506 aa  224  4.9999999999999996e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  29.96 
 
 		 504 aa  209  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.87 
 
 		 508 aa  208  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  31.79 
 
 		 1591 aa  207  6e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27420  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  28.74 
 
 		 826 aa  192  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1029  cell wall anchor domain-containing protein  29.12 
 
 		 752 aa  186  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0457373  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2906  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.5 
 
 		 872 aa  184  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.865364  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1333  5'-nucleotidase family protein  27.11 
 
 		 690 aa  179  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00306106  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  26.09 
 
 		 516 aa  172  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.26 
 
 		 517 aa  170  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  28.46 
 
 		 1181 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2257  5'-nucleotidase family protein  28.92 
 
 		 533 aa  167  5e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000083157  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  28.37 
 
 		 520 aa  166  9e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  27.19 
 
 		 1175 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  26.12 
 
 		 530 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.4 
 
 		 518 aa  165  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  28.4 
 
 		 518 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  28.4 
 
 		 518 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  28.4 
 
 		 518 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.57 
 
 		 518 aa  164  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  26.63 
 
 		 1202 aa  163  9e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.73 
 
 		 605 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  26.14 
 
 		 1215 aa  162  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.37 
 
 		 607 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1067  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase related esterase  27.26 
 
 		 765 aa  160  6e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000206277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  27.82 
 
 		 517 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03620  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  26.88 
 
 		 750 aa  149  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.422162  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  26.17 
 
 		 539 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  27.56 
 
 		 547 aa  146  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  27.51 
 
 		 558 aa  145  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.37 
 
 		 1284 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  29.34 
 
 		 659 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.44 
 
 		 508 aa  139  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.44 
 
 		 508 aa  139  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>