More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1461 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1461  5'-Nucleotidase domain protein  100 
 
 
583 aa  1162    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.899956  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4841  5'-Nucleotidase domain-containing protein  40.25 
 
 
586 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.374418  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4846  5'-Nucleotidase domain-containing protein  34.6 
 
 
578 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.81 
 
 
578 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0229  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.03 
 
 
567 aa  262  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4270  5'-Nucleotidase domain-containing protein  31.86 
 
 
588 aa  260  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0143  5'-Nucleotidase domain protein  32.07 
 
 
575 aa  250  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  32.92 
 
 
607 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  32.98 
 
 
560 aa  249  9e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0268  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.84 
 
 
567 aa  246  6e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492479 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.51 
 
 
557 aa  246  6.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3391  5'-Nucleotidase domain protein  34.32 
 
 
585 aa  238  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  32.68 
 
 
559 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  32.62 
 
 
558 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0894  putative 5'-nucleotidase family protein  30.54 
 
 
602 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  30.59 
 
 
555 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4541  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.45 
 
 
604 aa  225  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101042  normal  0.534355 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4307  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.04 
 
 
560 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1414  5`-nucleotidase  29.86 
 
 
560 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0356  5'-nucleotidase  31.68 
 
 
655 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0863234 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0448  5'-nucleotidase family protein  30.18 
 
 
580 aa  212  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0559  5'-nucleotidase  30.05 
 
 
583 aa  210  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.562968  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3482  5'-Nucleotidase domain protein  31.01 
 
 
611 aa  206  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  28.72 
 
 
529 aa  204  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  28.72 
 
 
529 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  28.72 
 
 
529 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  28.72 
 
 
529 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  28.37 
 
 
529 aa  204  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00130  5-nucleotidase/phosphoesterase  29.87 
 
 
571 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.4 
 
 
722 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  28.6 
 
 
529 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  28.02 
 
 
529 aa  201  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  27.5 
 
 
529 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  27.5 
 
 
529 aa  197  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.47 
 
 
530 aa  196  9e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  29.37 
 
 
529 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  29.37 
 
 
529 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  29.19 
 
 
529 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  28.55 
 
 
529 aa  195  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  28.55 
 
 
529 aa  195  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2368  5'-nucleotidase-like  29.78 
 
 
578 aa  195  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.287077  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  28.55 
 
 
529 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  28.37 
 
 
529 aa  194  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  29.23 
 
 
529 aa  194  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.45 
 
 
529 aa  194  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  31.35 
 
 
556 aa  193  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.96 
 
 
529 aa  192  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  29.04 
 
 
529 aa  191  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2145  5'-Nucleotidase domain protein  28.85 
 
 
569 aa  189  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07100  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  29.94 
 
 
597 aa  184  5.0000000000000004e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.593719  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1147  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.58 
 
 
561 aa  179  9e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2321  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.24 
 
 
731 aa  176  7e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857665  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  28.68 
 
 
1512 aa  163  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.46 
 
 
1525 aa  161  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  28.38 
 
 
1652 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1162  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.52 
 
 
509 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.587696  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  26.94 
 
 
1506 aa  145  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2724  5'-nucleotidase-like  26.16 
 
 
581 aa  143  9e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00164791  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0860  5'-Nucleotidase domain protein  26.8 
 
 
580 aa  143  9e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  27.3 
 
 
1577 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1029  cell wall anchor domain-containing protein  27.87 
 
 
752 aa  138  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0457373  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  24.6 
 
 
504 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3554  5'-Nucleotidase domain protein  27.43 
 
 
870 aa  136  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00406796  hitchhiker  0.00346018 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  26.7 
 
 
1591 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2604  hypothetical protein  23.16 
 
 
574 aa  133  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1086  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.42 
 
 
571 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.244523  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2731  hypothetical protein  22.61 
 
 
575 aa  131  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0036  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  26.75 
 
 
1311 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  25.93 
 
 
1577 aa  127  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27420  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  26.5 
 
 
826 aa  126  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0875  5'-Nucleotidase domain protein  24.29 
 
 
580 aa  124  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608431  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.53 
 
 
508 aa  121  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  25.43 
 
 
520 aa  113  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1067  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase related esterase  24.91 
 
 
765 aa  105  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000206277  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  23.47 
 
 
530 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  24.61 
 
 
1181 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1333  5'-nucleotidase family protein  24.52 
 
 
690 aa  103  8e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00306106  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  22.95 
 
 
1284 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  23.6 
 
 
1175 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  25.39 
 
 
659 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  23.34 
 
 
1202 aa  99  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  23.47 
 
 
1215 aa  98.2  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  25.59 
 
 
657 aa  94.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  28.15 
 
 
529 aa  93.2  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  23.39 
 
 
638 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.58 
 
 
607 aa  89.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4241  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  23.59 
 
 
608 aa  88.2  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  24.25 
 
 
547 aa  87.8  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4363  cell wall anchor domain-containing protein  22.36 
 
 
633 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.46 
 
 
555 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03620  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  25.67 
 
 
750 aa  85.9  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.422162  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  21.43 
 
 
489 aa  84  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.78 
 
 
605 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  25.04 
 
 
558 aa  81.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0338  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase related esterase  20.97 
 
 
519 aa  80.9  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.41 
 
 
601 aa  80.9  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  21.68 
 
 
523 aa  80.5  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.05 
 
 
517 aa  79.7  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.13 
 
 
533 aa  79.7  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.47 
 
 
627 aa  79.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>