More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3482 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3482  5'-Nucleotidase domain protein  100 
 
 		 611 aa  1225    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  49.05 
 
 		 557 aa  512  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0559  5'-nucleotidase  50.36 
 
 		 583 aa  510  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.562968  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  46.15 
 
 		 560 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  47.15 
 
 		 558 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  46.35 
 
 		 559 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  47.1 
 
 		 607 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0356  5'-nucleotidase  48.26 
 
 		 655 aa  475  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0863234 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  46.47 
 
 		 555 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0448  5'-nucleotidase family protein  44.58 
 
 		 580 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2368  5'-nucleotidase-like  42.48 
 
 		 578 aa  417  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.287077  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0268  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.83 
 
 		 567 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3391  5'-Nucleotidase domain protein  42.61 
 
 		 585 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0229  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.32 
 
 		 567 aa  402  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.17 
 
 		 578 aa  393  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0143  5'-Nucleotidase domain protein  42.51 
 
 		 575 aa  395  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4541  5'-nucleotidase domain-containing protein  41.95 
 
 		 604 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101042  normal  0.534355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4270  5'-Nucleotidase domain-containing protein  40.51 
 
 		 588 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0894  putative 5'-nucleotidase family protein  38.07 
 
 		 602 aa  365  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00130  5-nucleotidase/phosphoesterase  37.67 
 
 		 571 aa  354  2.9999999999999997e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07100  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  40.25 
 
 		 597 aa  349  8e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.593719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.85 
 
 		 722 aa  336  7e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1414  5`-nucleotidase  36.4 
 
 		 560 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  39.38 
 
 		 556 aa  333  8e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2145  5'-Nucleotidase domain protein  40.43 
 
 		 569 aa  331  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4307  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.04 
 
 		 560 aa  329  8e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  36.01 
 
 		 529 aa  316  8e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  36.19 
 
 		 529 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  35.84 
 
 		 529 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  35.84 
 
 		 529 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  36.03 
 
 		 529 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  36.19 
 
 		 529 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  35.66 
 
 		 529 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  35.66 
 
 		 529 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.85 
 
 		 529 aa  312  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  35.31 
 
 		 529 aa  311  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.54 
 
 		 530 aa  300  4e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2321  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.37 
 
 		 731 aa  293  4e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857665  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0860  5'-Nucleotidase domain protein  36.22 
 
 		 580 aa  293  7e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1147  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.32 
 
 		 561 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  34.09 
 
 		 529 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  34.09 
 
 		 529 aa  282  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  33.92 
 
 		 529 aa  281  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  33.92 
 
 		 529 aa  281  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  33.92 
 
 		 529 aa  281  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  33.92 
 
 		 529 aa  281  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  33.92 
 
 		 529 aa  281  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  33.74 
 
 		 529 aa  280  5e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 529 aa  278  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  32.92 
 
 		 529 aa  273  7e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1162  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.24 
 
 		 509 aa  270  4e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.587696  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1086  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.97 
 
 		 571 aa  269  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.244523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  34.24 
 
 		 1512 aa  265  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0875  5'-Nucleotidase domain protein  35.27 
 
 		 580 aa  263  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.16 
 
 		 1525 aa  256  8e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  31.6 
 
 		 1577 aa  239  9e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2731  hypothetical protein  30.39 
 
 		 575 aa  238  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  32.99 
 
 		 1652 aa  236  8e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2604  hypothetical protein  30.82 
 
 		 574 aa  236  9e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  32.39 
 
 		 1577 aa  235  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2724  5'-nucleotidase-like  32.82 
 
 		 581 aa  233  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00164791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0036  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  32.03 
 
 		 1311 aa  226  8e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.45 
 
 		 508 aa  223  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  30.15 
 
 		 1506 aa  215  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4841  5'-Nucleotidase domain-containing protein  30.07 
 
 		 586 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.374418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3554  5'-Nucleotidase domain protein  31.72 
 
 		 870 aa  213  7.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00406796  hitchhiker  0.00346018 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  31.83 
 
 		 504 aa  211  5e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1461  5'-Nucleotidase domain protein  31.01 
 
 		 583 aa  208  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.899956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4846  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.42 
 
 		 578 aa  204  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  31.81 
 
 		 1591 aa  197  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1029  cell wall anchor domain-containing protein  32.25 
 
 		 752 aa  191  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0457373  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1333  5'-nucleotidase family protein  28.45 
 
 		 690 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00306106  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27420  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  28.22 
 
 		 826 aa  176  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.4 
 
 		 605 aa  170  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.56 
 
 		 517 aa  167  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.38 
 
 		 607 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  29.06 
 
 		 518 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.88 
 
 		 518 aa  163  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  28.88 
 
 		 518 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  28.88 
 
 		 518 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.88 
 
 		 518 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1067  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase related esterase  28.28 
 
 		 765 aa  160  7e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000206277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2906  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.27 
 
 		 872 aa  157  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.865364  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  28.55 
 
 		 520 aa  155  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.26 
 
 		 587 aa  152  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.35 
 
 		 1284 aa  150  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  27.71 
 
 		 516 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  28.45 
 
 		 539 aa  148  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  28.35 
 
 		 558 aa  147  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4363  cell wall anchor domain-containing protein  26.14 
 
 		 633 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  26.92 
 
 		 530 aa  144  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  28.73 
 
 		 508 aa  144  6e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  28.73 
 
 		 508 aa  144  6e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  28.22 
 
 		 517 aa  144  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.26 
 
 		 601 aa  137  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.51 
 
 		 555 aa  137  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.84 
 
 		 515 aa  136  9e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1134  5'-nucleotidase  27.19 
 
 		 625 aa  136  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00179734  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  27 
 
 		 1181 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  25.86 
 
 		 1175 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>