More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0559 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0559  5'-nucleotidase  100 
 
 
583 aa  1177    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.562968  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3482  5'-Nucleotidase domain protein  50.83 
 
 
611 aa  519  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  43.73 
 
 
560 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  43.83 
 
 
559 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  42.96 
 
 
607 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  43.73 
 
 
555 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  43.83 
 
 
558 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.12 
 
 
557 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0448  5'-nucleotidase family protein  42.55 
 
 
580 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0356  5'-nucleotidase  40.78 
 
 
655 aa  350  5e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0863234 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2368  5'-nucleotidase-like  37.2 
 
 
578 aa  347  5e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.287077  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0268  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.89 
 
 
567 aa  327  3e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0229  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.97 
 
 
567 aa  327  3e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4541  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.78 
 
 
604 aa  318  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101042  normal  0.534355 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2145  5'-Nucleotidase domain protein  38.83 
 
 
569 aa  316  9e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00130  5-nucleotidase/phosphoesterase  36.03 
 
 
571 aa  309  6.999999999999999e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.08 
 
 
578 aa  302  9e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4270  5'-Nucleotidase domain-containing protein  35.49 
 
 
588 aa  298  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1414  5`-nucleotidase  33.62 
 
 
560 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3391  5'-Nucleotidase domain protein  37.85 
 
 
585 aa  286  5e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4307  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.1 
 
 
560 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0143  5'-Nucleotidase domain protein  34.82 
 
 
575 aa  283  9e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0894  putative 5'-nucleotidase family protein  32.89 
 
 
602 aa  269  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07100  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  35.32 
 
 
597 aa  267  4e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.593719  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.69 
 
 
722 aa  265  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  35.66 
 
 
556 aa  259  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.34 
 
 
530 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  33.27 
 
 
529 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  31.82 
 
 
529 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  33.27 
 
 
529 aa  251  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  33.1 
 
 
529 aa  251  3e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  33.27 
 
 
529 aa  251  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  33.27 
 
 
529 aa  251  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  31.99 
 
 
529 aa  250  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  33.1 
 
 
529 aa  250  5e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  32.76 
 
 
529 aa  250  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  33.27 
 
 
529 aa  249  8e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.1 
 
 
529 aa  249  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  31.99 
 
 
529 aa  249  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  31.64 
 
 
529 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  31.64 
 
 
529 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  31.64 
 
 
529 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  31.64 
 
 
529 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  32.81 
 
 
529 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  31.29 
 
 
529 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.99 
 
 
529 aa  243  7e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  31.12 
 
 
529 aa  243  7e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0860  5'-Nucleotidase domain protein  32.63 
 
 
580 aa  243  7e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1147  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.43 
 
 
561 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2321  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.39 
 
 
731 aa  236  8e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857665  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1461  5'-Nucleotidase domain protein  30.28 
 
 
583 aa  226  7e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.899956  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0875  5'-Nucleotidase domain protein  32 
 
 
580 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608431  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1162  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.17 
 
 
509 aa  211  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.587696  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1086  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.85 
 
 
571 aa  208  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.244523  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2724  5'-nucleotidase-like  31.78 
 
 
581 aa  203  6e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00164791  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  31.27 
 
 
1652 aa  192  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  32.11 
 
 
1512 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  31.79 
 
 
1577 aa  190  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  31.03 
 
 
1577 aa  186  9e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2731  hypothetical protein  28.28 
 
 
575 aa  186  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  30.27 
 
 
1506 aa  186  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4846  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.12 
 
 
578 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.36 
 
 
1525 aa  185  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.02 
 
 
508 aa  182  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2604  hypothetical protein  28.03 
 
 
574 aa  181  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  27.83 
 
 
504 aa  176  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0036  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  29.57 
 
 
1311 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4841  5'-Nucleotidase domain-containing protein  27.57 
 
 
586 aa  167  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.374418  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3554  5'-Nucleotidase domain protein  29.08 
 
 
870 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00406796  hitchhiker  0.00346018 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  29.73 
 
 
1591 aa  163  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1029  cell wall anchor domain-containing protein  30.44 
 
 
752 aa  161  4e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0457373  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27420  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  29.25 
 
 
826 aa  160  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1333  5'-nucleotidase family protein  26.97 
 
 
690 aa  148  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00306106  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  28.15 
 
 
558 aa  141  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.61 
 
 
517 aa  140  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2906  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.39 
 
 
872 aa  137  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.865364  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  28.25 
 
 
520 aa  136  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  26.73 
 
 
1215 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  26.42 
 
 
1181 aa  134  6e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.59 
 
 
1284 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.55 
 
 
605 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5725  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.45 
 
 
672 aa  132  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.695831 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  25.85 
 
 
1175 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  26.53 
 
 
1202 aa  132  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.15 
 
 
587 aa  131  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.34 
 
 
607 aa  131  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  26.46 
 
 
638 aa  131  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  29.36 
 
 
523 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  27.26 
 
 
659 aa  130  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1067  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase related esterase  25.33 
 
 
765 aa  130  6e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000206277  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  26.78 
 
 
530 aa  130  7.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.92 
 
 
515 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.36 
 
 
523 aa  128  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.67 
 
 
601 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.45 
 
 
516 aa  124  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.6 
 
 
555 aa  124  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  27.24 
 
 
518 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  27.24 
 
 
518 aa  123  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  27.24 
 
 
518 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  27.24 
 
 
518 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>