More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5725 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0670  5'-nucleotidase  74.28 
 
 
637 aa  895    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.785834  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5725  5'-nucleotidase domain-containing protein  100 
 
 
672 aa  1367    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.695831 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4022  5'-nucleotidase  79.6 
 
 
641 aa  956    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.887399 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0692  5'-nucleotidase  74.6 
 
 
637 aa  898    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0157449 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1134  5'-nucleotidase  45.85 
 
 
625 aa  498  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00179734  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0357  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  40.13 
 
 
607 aa  423  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0349  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  37.11 
 
 
591 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  34.71 
 
 
581 aa  296  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0538  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  34.8 
 
 
584 aa  292  1e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43694  predicted protein  33.55 
 
 
663 aa  278  2e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.553489  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.39 
 
 
601 aa  277  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  34.56 
 
 
558 aa  263  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.61 
 
 
607 aa  251  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  32.94 
 
 
555 aa  249  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.11 
 
 
605 aa  247  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  34.61 
 
 
659 aa  244  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  33.33 
 
 
638 aa  241  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.62 
 
 
587 aa  236  8e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  30.94 
 
 
520 aa  234  4.0000000000000004e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  32.82 
 
 
526 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  33.63 
 
 
657 aa  234  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  33.46 
 
 
663 aa  233  8.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.64 
 
 
627 aa  228  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.16 
 
 
523 aa  223  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  31.99 
 
 
523 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2370  5'-nucleotidase, putative  27.72 
 
 
573 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.405664 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.7 
 
 
533 aa  199  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  30.05 
 
 
532 aa  197  6e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1368  metallophosphoesterase  28.4 
 
 
580 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.198191  normal  0.0110218 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  31.05 
 
 
529 aa  193  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2995  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.19 
 
 
581 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3153  5'-nucleotidase domain protein  28.64 
 
 
581 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867594 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3010  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.19 
 
 
581 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  29.24 
 
 
619 aa  190  9e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1285  5'-nucleotidase  27.64 
 
 
586 aa  189  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3317  5'-nucleotidase, putative  26.68 
 
 
583 aa  188  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1300  5'-nucleotidase  26.97 
 
 
592 aa  187  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.291258  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05914  5'-nucleotidase  28.15 
 
 
585 aa  187  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2772  putative 5'-nucleotidase  28.37 
 
 
664 aa  187  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000553351  hitchhiker  0.00604315 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1539  metallophosphoesterase  26.6 
 
 
577 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.337659 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1427  5'-nucleotidase  26.19 
 
 
581 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1111  metallophosphoesterase  26.66 
 
 
578 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.443136  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2657  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.43 
 
 
581 aa  182  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1294  metallophosphoesterase  26.97 
 
 
583 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.260824  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1223  metallophosphoesterase  26.98 
 
 
583 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0478  putative 5`-nucleotidase  28.65 
 
 
580 aa  182  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000584896  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1224  metallophosphoesterase  26.69 
 
 
583 aa  182  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.618653  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1252  5'-nucleotidase-like protein  27.03 
 
 
580 aa  181  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000189  5'-nucleotidase  26.29 
 
 
578 aa  181  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000310598  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05939  conserved hypothetical protein  27.76 
 
 
582 aa  169  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0450  5'-nucleotidase  25.12 
 
 
579 aa  158  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.82 
 
 
515 aa  143  8e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0854  5'-Nucleotidase domain protein  27.8 
 
 
619 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192901  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0825  5'-Nucleotidase domain protein  27.8 
 
 
619 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1464  5'-Nucleotidase domain protein  26.78 
 
 
657 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577619  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  26.32 
 
 
808 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  29.42 
 
 
2852 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  27.06 
 
 
520 aa  128  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  25.14 
 
 
523 aa  126  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  26.06 
 
 
560 aa  126  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3228  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.38 
 
 
549 aa  124  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00425735  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  23.4 
 
 
556 aa  124  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  26.42 
 
 
558 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1235  5'-Nucleotidase domain protein  28.42 
 
 
613 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.798144  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3214  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.06 
 
 
668 aa  122  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1083  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.33 
 
 
549 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000234705  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  27.11 
 
 
1355 aa  121  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3032  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.74 
 
 
550 aa  120  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  27.48 
 
 
504 aa  120  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1147  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.89 
 
 
551 aa  119  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0136849  unclonable  0.0000000374568 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3032  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.17 
 
 
551 aa  118  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0289029  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.96 
 
 
509 aa  117  5e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  23.73 
 
 
1215 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1027  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.81 
 
 
550 aa  115  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0559  5'-nucleotidase  26.49 
 
 
583 aa  115  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.562968  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  24.11 
 
 
1202 aa  114  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4270  5'-Nucleotidase domain-containing protein  23.38 
 
 
588 aa  113  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  30.64 
 
 
2667 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00431  UDP-sugar hydrolase  25.84 
 
 
550 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.373208  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3130  5'-Nucleotidase domain protein  25.84 
 
 
550 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.520535  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3136  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.84 
 
 
550 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.161033  unclonable  0.0000000215982 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0519  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.84 
 
 
550 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0524  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.84 
 
 
550 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00436  hypothetical protein  25.84 
 
 
550 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.335822  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0557  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.72 
 
 
550 aa  111  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0572  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.84 
 
 
550 aa  112  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3844  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.68 
 
 
712 aa  112  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  25.04 
 
 
2775 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2185  metallophosphoesterase  32.69 
 
 
315 aa  111  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123783  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4357  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.28 
 
 
535 aa  110  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000122656  decreased coverage  0.0000528459 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0415  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.67 
 
 
550 aa  110  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  24.06 
 
 
518 aa  110  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  23.63 
 
 
529 aa  110  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  27.11 
 
 
515 aa  109  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.17 
 
 
557 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  23.27 
 
 
529 aa  109  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0959  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.07 
 
 
550 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.94 
 
 
3977 aa  108  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  24.06 
 
 
518 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  23.28 
 
 
1181 aa  108  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>