More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1685 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  100 
 
 
2852 aa  5722    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  58.58 
 
 
2701 aa  748    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  65.03 
 
 
2182 aa  741    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  55.74 
 
 
1587 aa  670    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  73.35 
 
 
3977 aa  1514    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  52.73 
 
 
980 aa  616  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  45.82 
 
 
2667 aa  473  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  44.54 
 
 
2775 aa  473  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  38.01 
 
 
1355 aa  379  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  40.23 
 
 
808 aa  380  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1464  5'-Nucleotidase domain protein  37.44 
 
 
657 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577619  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3214  5'-nucleotidase domain-containing protein  39.36 
 
 
668 aa  375  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  37.18 
 
 
2796 aa  373  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6734  5'-Nucleotidase domain protein  36.68 
 
 
726 aa  349  4e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0580  alkaline phosphatase  37.68 
 
 
748 aa  342  8e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00489448 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  35.72 
 
 
1175 aa  324  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0596  Alkaline phosphatase  44.84 
 
 
945 aa  311  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0854  5'-Nucleotidase domain protein  30.91 
 
 
619 aa  199  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192901  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0825  5'-Nucleotidase domain protein  30.91 
 
 
619 aa  199  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1235  5'-Nucleotidase domain protein  31.02 
 
 
613 aa  185  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.798144  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2776  5'-Nucleotidase domain protein  32.25 
 
 
603 aa  165  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.831007 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  29.41 
 
 
520 aa  159  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  44.53 
 
 
506 aa  157  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3844  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.57 
 
 
712 aa  155  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  28.34 
 
 
659 aa  152  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  28.34 
 
 
558 aa  148  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  28.08 
 
 
532 aa  148  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  28.34 
 
 
657 aa  146  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  40.48 
 
 
576 aa  145  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.06 
 
 
607 aa  144  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.53 
 
 
605 aa  143  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  41.39 
 
 
633 aa  142  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  27.15 
 
 
529 aa  141  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  38.06 
 
 
592 aa  141  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  28.34 
 
 
526 aa  140  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  25.67 
 
 
587 aa  139  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.17 
 
 
555 aa  137  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.43 
 
 
523 aa  137  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  31.74 
 
 
1844 aa  136  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  28.43 
 
 
523 aa  136  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  26.09 
 
 
638 aa  132  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0524  metallophosphoesterase  29.12 
 
 
721 aa  131  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0512  alkaline phosphatase  31.14 
 
 
521 aa  131  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  36.25 
 
 
622 aa  130  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4022  5'-nucleotidase  29.29 
 
 
641 aa  130  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.887399 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.13 
 
 
533 aa  130  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.23 
 
 
627 aa  129  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  40.5 
 
 
539 aa  128  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1722  hypothetical protein  54.62 
 
 
1013 aa  126  6e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.919333  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5725  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.59 
 
 
672 aa  126  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.695831 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  42.86 
 
 
1289 aa  125  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  37.45 
 
 
1322 aa  125  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  40.08 
 
 
539 aa  125  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4158  metallophosphoesterase  32.62 
 
 
364 aa  123  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  55.75 
 
 
4379 aa  124  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  37.5 
 
 
546 aa  123  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  37.6 
 
 
498 aa  121  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  27.02 
 
 
663 aa  118  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1019  phosphohydrolase  29.39 
 
 
410 aa  117  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  31.21 
 
 
621 aa  115  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  29.4 
 
 
619 aa  115  9e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  33.33 
 
 
624 aa  114  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0692  5'-nucleotidase  27.06 
 
 
637 aa  115  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0157449 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  34.41 
 
 
624 aa  114  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  33.7 
 
 
624 aa  114  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0670  5'-nucleotidase  27.06 
 
 
637 aa  114  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.785834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.4 
 
 
601 aa  114  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.54 
 
 
774 aa  113  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  33.61 
 
 
575 aa  113  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  32.85 
 
 
624 aa  112  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  30.8 
 
 
624 aa  112  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  31.16 
 
 
624 aa  112  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  32.97 
 
 
624 aa  111  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3159  Alkaline phosphatase  31.56 
 
 
571 aa  111  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0625023  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0451  alkaline phosphatase  31.23 
 
 
497 aa  111  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000822257  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  31.88 
 
 
624 aa  110  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  35.51 
 
 
501 aa  111  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  34.78 
 
 
567 aa  111  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1134  5'-nucleotidase  26.34 
 
 
625 aa  110  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00179734  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  32.82 
 
 
589 aa  110  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3391  metallophosphoesterase  31.98 
 
 
363 aa  110  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119138  normal  0.040425 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  41.73 
 
 
692 aa  109  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  32.35 
 
 
627 aa  109  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  30.63 
 
 
624 aa  109  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03560  Alkaline phosphatase  32.29 
 
 
631 aa  109  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  32.08 
 
 
622 aa  108  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  33.46 
 
 
635 aa  108  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
629 aa  108  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  35.04 
 
 
598 aa  107  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2010  Alkaline phosphatase  30.4 
 
 
627 aa  107  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.208798  normal  0.40879 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1983  Alkaline phosphatase  30.4 
 
 
627 aa  107  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  32.27 
 
 
600 aa  107  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  32.05 
 
 
589 aa  106  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  43.71 
 
 
16311 aa  106  8e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.1 
 
 
1372 aa  105  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3876  metallophosphoesterase  30 
 
 
366 aa  105  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3826  metallophosphoesterase  30 
 
 
366 aa  104  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  25.78 
 
 
581 aa  103  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  28.02 
 
 
388 aa  103  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1840  Alkaline phosphatase  29.75 
 
 
615 aa  102  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>