More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1539 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2657  5'-nucleotidase domain-containing protein  60.8 
 
 		 581 aa  712    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3153  5'-nucleotidase domain protein  59.86 
 
 		 581 aa  704    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867594 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3317  5'-nucleotidase, putative  60.62 
 
 		 583 aa  710    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1539  metallophosphoesterase  100 
 
 		 577 aa  1187    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.337659 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1252  5'-nucleotidase-like protein  56.4 
 
 		 580 aa  659    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1223  metallophosphoesterase  61.22 
 
 		 583 aa  717    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1294  metallophosphoesterase  61.39 
 
 		 583 aa  716    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.260824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1111  metallophosphoesterase  56.6 
 
 		 578 aa  660    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.443136  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1427  5'-nucleotidase  72.34 
 
 		 581 aa  860    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1368  metallophosphoesterase  60.31 
 
 		 580 aa  712    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.198191  normal  0.0110218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1300  5'-nucleotidase  62.43 
 
 		 592 aa  753    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.291258  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1224  metallophosphoesterase  61.39 
 
 		 583 aa  718    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.618653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1285  5'-nucleotidase  64.9 
 
 		 586 aa  747    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2995  5'-nucleotidase domain-containing protein  60.03 
 
 		 581 aa  707    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2370  5'-nucleotidase, putative  58.64 
 
 		 573 aa  684    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.405664 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3010  5'-nucleotidase domain-containing protein  60.21 
 
 		 581 aa  708    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0478  putative 5`-nucleotidase  42.83 
 
 		 580 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000584896  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05914  5'-nucleotidase  40.99 
 
 		 585 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000189  5'-nucleotidase  40.64 
 
 		 578 aa  434  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000310598  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0450  5'-nucleotidase  39.79 
 
 		 579 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2772  putative 5'-nucleotidase  30.55 
 
 		 664 aa  254  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000553351  hitchhiker  0.00604315 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.93 
 
 		 627 aa  216  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0357  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  28.44 
 
 		 607 aa  216  8e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  29.72 
 
 		 526 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  29.34 
 
 		 638 aa  213  9e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  29 
 
 		 663 aa  209  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  29.04 
 
 		 659 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  27.53 
 
 		 529 aa  205  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1134  5'-nucleotidase  27.48 
 
 		 625 aa  205  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00179734  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  28.52 
 
 		 558 aa  204  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  29.23 
 
 		 657 aa  204  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  28.04 
 
 		 523 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.85 
 
 		 523 aa  197  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.22 
 
 		 601 aa  196  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0538  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  28.5 
 
 		 584 aa  195  2e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  28.15 
 
 		 581 aa  194  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0349  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  27.89 
 
 		 591 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  27 
 
 		 533 aa  191  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  29.15 
 
 		 555 aa  189  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0670  5'-nucleotidase  26.36 
 
 		 637 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.785834  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0692  5'-nucleotidase  26.36 
 
 		 637 aa  184  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0157449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5725  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.26 
 
 		 672 aa  179  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.78 
 
 		 607 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43694  predicted protein  25.81 
 
 		 663 aa  177  4e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.553489  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.64 
 
 		 605 aa  177  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  28.84 
 
 		 520 aa  177  5e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4022  5'-nucleotidase  26.18 
 
 		 641 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.887399 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  26.23 
 
 		 532 aa  173  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  25.05 
 
 		 587 aa  163  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  28.8 
 
 		 504 aa  162  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05939  conserved hypothetical protein  25.84 
 
 		 582 aa  150  6e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  25.79 
 
 		 523 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  23.46 
 
 		 619 aa  127  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.45 
 
 		 508 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  23.63 
 
 		 515 aa  112  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  25.16 
 
 		 512 aa  108  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.36 
 
 		 515 aa  101  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.82 
 
 		 503 aa  100  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.76 
 
 		 509 aa  99.8  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2185  metallophosphoesterase  32.26 
 
 		 315 aa  96.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  25.47 
 
 		 1215 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  24.64 
 
 		 1202 aa  96.7  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  25.56 
 
 		 504 aa  95.1  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  24.9 
 
 		 1181 aa  94.7  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  23.57 
 
 		 489 aa  94  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  24.12 
 
 		 1175 aa  94  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1793  metallophosphoesterase  29.72 
 
 		 302 aa  93.2  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4342  metallophosphoesterase  28.29 
 
 		 313 aa  91.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.266194  normal  0.291471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0324  metallophosphoesterase  28.57 
 
 		 313 aa  91.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0297927  normal  0.111016 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  23.08 
 
 		 518 aa  90.1  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  23.24 
 
 		 518 aa  87.8  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2257  5'-nucleotidase family protein  23.78 
 
 		 533 aa  87  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000083157  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  22.18 
 
 		 516 aa  87  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  23.24 
 
 		 518 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  22.9 
 
 		 518 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3473  metallophosphoesterase  29.6 
 
 		 303 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.590454  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  27.87 
 
 		 481 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  22.5 
 
 		 530 aa  85.9  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  24.28 
 
 		 520 aa  85.5  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1027  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.75 
 
 		 550 aa  85.1  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.08 
 
 		 517 aa  84.7  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3228  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.6 
 
 		 549 aa  84  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00425735  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1083  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.06 
 
 		 549 aa  84  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000234705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  22.88 
 
 		 518 aa  83.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.52 
 
 		 722 aa  83.2  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0141  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.25 
 
 		 592 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1038  metallophosphoesterase  27.49 
 
 		 638 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  27.84 
 
 		 559 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.05 
 
 		 1284 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3032  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.03 
 
 		 550 aa  81.6  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  22.65 
 
 		 517 aa  80.5  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2582  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.05 
 
 		 505 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270196  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  27.41 
 
 		 564 aa  78.2  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1474  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.61 
 
 		 491 aa  77.8  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1908  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.78 
 
 		 572 aa  77  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00316066  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4369  twin-arginine translocation pathway signal  27.49 
 
 		 578 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3671  twin-arginine translocation pathway signal  27.48 
 
 		 580 aa  77  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  20.04 
 
 		 556 aa  76.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0557  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.4 
 
 		 550 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  28.24 
 
 		 565 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>