More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2803 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3675  sulfate thiol esterase SoxB  64.01 
 
 		 553 aa  751    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0941118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4369  twin-arginine translocation pathway signal  59.72 
 
 		 578 aa  727    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  60.95 
 
 		 565 aa  724    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1519  5'-nucleotidase domain-containing protein  59.89 
 
 		 563 aa  696    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.661634 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  100 
 
 		 564 aa  1152    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  63.01 
 
 		 559 aa  741    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4958  5'-Nucleotidase domain protein  60.42 
 
 		 565 aa  724    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416285  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4154  5'-nucleotidase domain-containing protein  71.23 
 
 		 564 aa  858    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3914  hypothetical protein  72.87 
 
 		 563 aa  881    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1905  sulfate thiol esterase SoxB  51.5 
 
 		 565 aa  592  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0563  sulfate thiol esterase SoxB  50.09 
 
 		 610 aa  566  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000246299  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2625  sulfate thiol esterase SoxB  53.42 
 
 		 574 aa  568  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.561369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0807  5'-nucleotidase domain-containing protein  51.53 
 
 		 576 aa  556  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3249  sulfate thiol esterase SoxB  50.26 
 
 		 573 aa  548  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3417  sulfate thiol esterase SoxB  50.44 
 
 		 574 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3451  5'-Nucleotidase domain protein  52.37 
 
 		 573 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1032  5'-Nucleotidase domain protein  50.9 
 
 		 576 aa  548  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.556642  normal  0.811589 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3778  5'-nucleotidase domain-containing protein  48.78 
 
 		 580 aa  546  1e-154  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1596  5'-Nucleotidase domain protein  52.62 
 
 		 570 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3128  sulfate thiol esterase SoxB  49.55 
 
 		 573 aa  545  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1672  5'-Nucleotidase domain protein  52.23 
 
 		 571 aa  543  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2279  sulfate thiol esterase SoxB  51.92 
 
 		 571 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1150  5'-Nucleotidase domain protein  47.87 
 
 		 577 aa  541  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000459069 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2432  sulfate thiol esterase SoxB  49.3 
 
 		 575 aa  535  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3123  5'-Nucleotidase domain protein  51.99 
 
 		 573 aa  534  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3253  sulfur oxidation signal peptide protein  50.56 
 
 		 572 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2223  5'-Nucleotidase domain protein  49.91 
 
 		 596 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1916  5'-Nucleotidase domain protein  45.25 
 
 		 600 aa  508  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1939  5'-nucleotidase domain-containing protein  44.73 
 
 		 581 aa  507  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0627  5'-Nucleotidase domain protein  48.15 
 
 		 603 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.367803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0141  5'-nucleotidase domain-containing protein  47.04 
 
 		 592 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0816  5'-Nucleotidase domain protein  46.06 
 
 		 586 aa  491  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24833  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  41.9 
 
 		 577 aa  483  1e-135  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3671  twin-arginine translocation pathway signal  46.56 
 
 		 580 aa  480  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0692  sulfate thiol esterase SoxB  45.8 
 
 		 583 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1927  twin-arginine translocation pathway signal  44.06 
 
 		 585 aa  468  9.999999999999999e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0264  sulfate thiol esterase SoxB  40.66 
 
 		 587 aa  468  9.999999999999999e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000260669  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3048  5'-nucleotidase domain-containing protein  43.53 
 
 		 578 aa  437  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1549  Sulfate thiol esterase  40 
 
 		 636 aa  421  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229205  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2861  5'-Nucleotidase domain-containing protein  40.21 
 
 		 568 aa  410  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1467  5'-Nucleotidase domain protein  36.43 
 
 		 579 aa  383  1e-105  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00451887  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3451  hypothetical protein  37.17 
 
 		 572 aa  376  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.73 
 
 		 479 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  34.48 
 
 		 482 aa  234  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  33.89 
 
 		 481 aa  223  8e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  30.07 
 
 		 504 aa  171  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3035  5'-Nucleotidase domain protein  28.27 
 
 		 594 aa  162  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  28.3 
 
 		 523 aa  150  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11803  5'-nucleotidase  26.14 
 
 		 552 aa  149  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1292  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  26.83 
 
 		 595 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.519034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  25.38 
 
 		 505 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  25.89 
 
 		 530 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.74 
 
 		 508 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1621  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  25.56 
 
 		 577 aa  126  9e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1085  lipoprotein UxpA  26.8 
 
 		 546 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4182  lipoprotein UxpA  27.52 
 
 		 546 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1041  lipoprotein UxpA  26.16 
 
 		 546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  27.09 
 
 		 520 aa  120  7.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  28.44 
 
 		 547 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.39 
 
 		 516 aa  118  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.66 
 
 		 503 aa  116  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.78 
 
 		 515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1044  lipoprotein UxpA  25.54 
 
 		 550 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0577127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  25.85 
 
 		 523 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  25.4 
 
 		 520 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  25.4 
 
 		 520 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  25.4 
 
 		 523 aa  114  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  25.22 
 
 		 518 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  25.22 
 
 		 518 aa  113  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  25.33 
 
 		 518 aa  113  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.19 
 
 		 509 aa  112  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  25.33 
 
 		 518 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  25 
 
 		 518 aa  112  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.17 
 
 		 523 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  26.93 
 
 		 523 aa  110  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  25.19 
 
 		 515 aa  110  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1253  metallophosphoesterase  27.8 
 
 		 392 aa  107  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00126646  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0171  5'-nucleotidase family protein  26.55 
 
 		 590 aa  106  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  25.98 
 
 		 489 aa  106  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.07 
 
 		 517 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4363  cell wall anchor domain-containing protein  24.18 
 
 		 633 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.76 
 
 		 1284 aa  103  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  26.84 
 
 		 504 aa  103  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  26.49 
 
 		 1181 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.67 
 
 		 517 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4357  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  30.56 
 
 		 535 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000122656  decreased coverage  0.0000528459 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  27.65 
 
 		 556 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2582  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.97 
 
 		 505 aa  102  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270196  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  26.27 
 
 		 1175 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  24.47 
 
 		 527 aa  101  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2012  putative esterase  24.71 
 
 		 713 aa  100  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  24.33 
 
 		 659 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3393  5'-nucleotidase; 2',3'-cyclic phosphodiesterase  23.6 
 
 		 527 aa  100  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.803597  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.14 
 
 		 539 aa  100  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3705  5'-nucleotidase family protein  24.47 
 
 		 527 aa  100  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000001284 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2911  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.41 
 
 		 689 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  25.76 
 
 		 581 aa  99.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2813  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.27 
 
 		 686 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  24.57 
 
 		 529 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6244  5'-nucleotidase-like  24.85 
 
 		 689 aa  99  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>