More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2625 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1916  5'-Nucleotidase domain protein  55.57 
 
 
600 aa  678    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3253  sulfur oxidation signal peptide protein  66.78 
 
 
572 aa  766    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1032  5'-Nucleotidase domain protein  67.02 
 
 
576 aa  820    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.556642  normal  0.811589 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2223  5'-Nucleotidase domain protein  56.4 
 
 
596 aa  654    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3778  5'-nucleotidase domain-containing protein  71.28 
 
 
580 aa  856    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3128  sulfate thiol esterase SoxB  70.1 
 
 
573 aa  860    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304524  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3249  sulfate thiol esterase SoxB  69.88 
 
 
573 aa  833    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0807  5'-nucleotidase domain-containing protein  67.89 
 
 
576 aa  818    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0563  sulfate thiol esterase SoxB  65.51 
 
 
610 aa  783    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000246299  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1672  5'-Nucleotidase domain protein  67.14 
 
 
571 aa  797    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3451  5'-Nucleotidase domain protein  64.86 
 
 
573 aa  749    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2279  sulfate thiol esterase SoxB  66.43 
 
 
571 aa  790    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0627  5'-Nucleotidase domain protein  56.59 
 
 
603 aa  647    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.367803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2625  sulfate thiol esterase SoxB  100 
 
 
574 aa  1181    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.561369  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3417  sulfate thiol esterase SoxB  67.25 
 
 
574 aa  801    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2432  sulfate thiol esterase SoxB  68.94 
 
 
575 aa  819    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3123  5'-Nucleotidase domain protein  65.21 
 
 
573 aa  737    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1150  5'-Nucleotidase domain protein  56.8 
 
 
577 aa  694    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000459069 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1596  5'-Nucleotidase domain protein  67.66 
 
 
570 aa  803    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1927  twin-arginine translocation pathway signal  53.58 
 
 
585 aa  627  1e-178  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0816  5'-Nucleotidase domain protein  53.9 
 
 
586 aa  622  1e-177  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24833  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1905  sulfate thiol esterase SoxB  53.32 
 
 
565 aa  597  1e-169  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3671  twin-arginine translocation pathway signal  54.27 
 
 
580 aa  590  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1549  Sulfate thiol esterase  49.68 
 
 
636 aa  585  1e-166  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229205  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0141  5'-nucleotidase domain-containing protein  54.47 
 
 
592 aa  581  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  52.13 
 
 
564 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4154  5'-nucleotidase domain-containing protein  50.62 
 
 
564 aa  573  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1939  5'-nucleotidase domain-containing protein  49.83 
 
 
581 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0692  sulfate thiol esterase SoxB  52.22 
 
 
583 aa  570  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3914  hypothetical protein  50.97 
 
 
563 aa  571  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3675  sulfate thiol esterase SoxB  52.31 
 
 
553 aa  555  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0941118  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  50.35 
 
 
559 aa  553  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1519  5'-nucleotidase domain-containing protein  50 
 
 
563 aa  541  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.661634 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3048  5'-nucleotidase domain-containing protein  51.18 
 
 
578 aa  536  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4958  5'-Nucleotidase domain protein  48.94 
 
 
565 aa  535  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416285  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  49.73 
 
 
565 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4369  twin-arginine translocation pathway signal  47.27 
 
 
578 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  43.36 
 
 
577 aa  483  1e-135  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0264  sulfate thiol esterase SoxB  39.28 
 
 
587 aa  441  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000260669  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1467  5'-Nucleotidase domain protein  38.08 
 
 
579 aa  394  1e-108  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00451887  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2861  5'-Nucleotidase domain-containing protein  38.62 
 
 
568 aa  390  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3451  hypothetical protein  38.05 
 
 
572 aa  376  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.92 
 
 
479 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  31.48 
 
 
481 aa  209  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  32.13 
 
 
482 aa  207  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11803  5'-nucleotidase  27.59 
 
 
552 aa  161  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1292  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  26.32 
 
 
595 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.519034  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  29.4 
 
 
504 aa  147  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  27.56 
 
 
505 aa  145  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1621  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  27.07 
 
 
577 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637652  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.44 
 
 
508 aa  139  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3035  5'-Nucleotidase domain protein  25.3 
 
 
594 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4182  lipoprotein UxpA  27.71 
 
 
546 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  26.03 
 
 
530 aa  125  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2012  putative esterase  26.32 
 
 
713 aa  124  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  27.1 
 
 
489 aa  123  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  29.05 
 
 
520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1041  lipoprotein UxpA  26.51 
 
 
546 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1085  lipoprotein UxpA  25.74 
 
 
546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1044  lipoprotein UxpA  25.18 
 
 
550 aa  107  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0577127  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.79 
 
 
627 aa  105  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  23.43 
 
 
532 aa  104  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.86 
 
 
515 aa  103  7e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  25.99 
 
 
659 aa  103  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  26.02 
 
 
523 aa  99.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.07 
 
 
533 aa  98.2  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  26.13 
 
 
1215 aa  98.2  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  24.7 
 
 
657 aa  98.2  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  26.94 
 
 
515 aa  97.1  9e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  26.82 
 
 
1175 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.17 
 
 
517 aa  95.5  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2582  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.09 
 
 
505 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270196  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  25.75 
 
 
555 aa  94.7  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  26.78 
 
 
523 aa  94.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  26.18 
 
 
1181 aa  94.7  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  25.81 
 
 
638 aa  94.4  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  22.55 
 
 
516 aa  92  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  25.2 
 
 
504 aa  92  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  25.68 
 
 
1202 aa  92.8  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1038  metallophosphoesterase  29.17 
 
 
638 aa  92  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27161  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4363  cell wall anchor domain-containing protein  28.76 
 
 
633 aa  91.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.36 
 
 
523 aa  91.3  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  25 
 
 
523 aa  91.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  25.12 
 
 
733 aa  91.3  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.23 
 
 
503 aa  90.9  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  24.78 
 
 
520 aa  90.5  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  24.78 
 
 
520 aa  90.5  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  26.4 
 
 
512 aa  90.5  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  24.78 
 
 
523 aa  90.1  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  23.86 
 
 
518 aa  90.1  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  23.86 
 
 
518 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  24.21 
 
 
518 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  23.64 
 
 
518 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  24.21 
 
 
518 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  27.25 
 
 
520 aa  88.2  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  32.12 
 
 
581 aa  87.8  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1753  UshA protein  23.73 
 
 
508 aa  87.4  6e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  23.43 
 
 
547 aa  87  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05914  5'-nucleotidase  31.67 
 
 
585 aa  86.7  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.7 
 
 
539 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.970271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>