More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3914 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  66.13 
 
 		 559 aa  766    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  72.87 
 
 		 564 aa  881    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4369  twin-arginine translocation pathway signal  59.82 
 
 		 578 aa  726    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  59.47 
 
 		 565 aa  711    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4958  5'-Nucleotidase domain protein  60.88 
 
 		 565 aa  725    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3675  sulfate thiol esterase SoxB  64.86 
 
 		 553 aa  754    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0941118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4154  5'-nucleotidase domain-containing protein  79.22 
 
 		 564 aa  955    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1519  5'-nucleotidase domain-containing protein  59.82 
 
 		 563 aa  706    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.661634 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3914  hypothetical protein  100 
 
 		 563 aa  1157    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1905  sulfate thiol esterase SoxB  51.5 
 
 		 565 aa  603  1.0000000000000001e-171  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1032  5'-Nucleotidase domain protein  50.36 
 
 		 576 aa  570  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.556642  normal  0.811589 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0807  5'-nucleotidase domain-containing protein  50.81 
 
 		 576 aa  571  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3778  5'-nucleotidase domain-containing protein  51.35 
 
 		 580 aa  569  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3417  sulfate thiol esterase SoxB  50 
 
 		 574 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2625  sulfate thiol esterase SoxB  50.8 
 
 		 574 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.561369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0563  sulfate thiol esterase SoxB  48.84 
 
 		 610 aa  560  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000246299  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3128  sulfate thiol esterase SoxB  48.86 
 
 		 573 aa  558  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1150  5'-Nucleotidase domain protein  48.03 
 
 		 577 aa  554  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000459069 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3249  sulfate thiol esterase SoxB  48.86 
 
 		 573 aa  554  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2279  sulfate thiol esterase SoxB  51.82 
 
 		 571 aa  548  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1596  5'-Nucleotidase domain protein  51.82 
 
 		 570 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3451  5'-Nucleotidase domain protein  52.08 
 
 		 573 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1672  5'-Nucleotidase domain protein  51.06 
 
 		 571 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3253  sulfur oxidation signal peptide protein  49.74 
 
 		 572 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2223  5'-Nucleotidase domain protein  49.74 
 
 		 596 aa  536  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2432  sulfate thiol esterase SoxB  48.57 
 
 		 575 aa  538  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3123  5'-Nucleotidase domain protein  51.7 
 
 		 573 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1916  5'-Nucleotidase domain protein  45.44 
 
 		 600 aa  521  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0141  5'-nucleotidase domain-containing protein  47.74 
 
 		 592 aa  520  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1939  5'-nucleotidase domain-containing protein  46.32 
 
 		 581 aa  518  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0816  5'-Nucleotidase domain protein  46.49 
 
 		 586 aa  512  1e-144  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24833  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0627  5'-Nucleotidase domain protein  48.59 
 
 		 603 aa  513  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.367803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0692  sulfate thiol esterase SoxB  47.6 
 
 		 583 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3671  twin-arginine translocation pathway signal  45.96 
 
 		 580 aa  498  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  42.86 
 
 		 577 aa  489  1e-137  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1927  twin-arginine translocation pathway signal  43.1 
 
 		 585 aa  480  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3048  5'-nucleotidase domain-containing protein  47.1 
 
 		 578 aa  475  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0264  sulfate thiol esterase SoxB  40.24 
 
 		 587 aa  450  1e-125  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000260669  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1549  Sulfate thiol esterase  41.45 
 
 		 636 aa  445  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229205  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2861  5'-Nucleotidase domain-containing protein  41.51 
 
 		 568 aa  427  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3451  hypothetical protein  38.53 
 
 		 572 aa  393  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1467  5'-Nucleotidase domain protein  37.43 
 
 		 579 aa  386  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00451887  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  37.5 
 
 		 482 aa  259  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  37.36 
 
 		 481 aa  236  6e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.94 
 
 		 479 aa  236  6e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  29.42 
 
 		 504 aa  171  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  27.29 
 
 		 505 aa  163  9e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3035  5'-Nucleotidase domain protein  27.47 
 
 		 594 aa  157  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1292  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  26.8 
 
 		 595 aa  155  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.519034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11803  5'-nucleotidase  24.33 
 
 		 552 aa  135  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  27.23 
 
 		 518 aa  133  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  27.01 
 
 		 518 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  27.01 
 
 		 518 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  27.01 
 
 		 518 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  26.1 
 
 		 523 aa  131  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.79 
 
 		 518 aa  131  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1621  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  27.53 
 
 		 577 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  25.75 
 
 		 530 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  25.63 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  25.63 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  25.63 
 
 		 523 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.91 
 
 		 508 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.86 
 
 		 539 aa  127  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  25.4 
 
 		 523 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.79 
 
 		 523 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  27.56 
 
 		 523 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1041  lipoprotein UxpA  26.01 
 
 		 546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4182  lipoprotein UxpA  26.23 
 
 		 546 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1085  lipoprotein UxpA  25.59 
 
 		 546 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  28.15 
 
 		 515 aa  120  9e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0171  5'-nucleotidase family protein  27.15 
 
 		 590 aa  119  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  26.23 
 
 		 517 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.82 
 
 		 517 aa  117  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1044  lipoprotein UxpA  25.59 
 
 		 550 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0577127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  28.41 
 
 		 515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.94 
 
 		 516 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  25.26 
 
 		 520 aa  110  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  25.56 
 
 		 526 aa  110  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.68 
 
 		 533 aa  107  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  24.03 
 
 		 489 aa  107  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2012  putative esterase  26.36 
 
 		 713 aa  107  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  25.66 
 
 		 547 aa  106  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  24.64 
 
 		 504 aa  106  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.92 
 
 		 503 aa  106  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  25.51 
 
 		 532 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  26.32 
 
 		 581 aa  105  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2582  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.42 
 
 		 505 aa  104  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270196  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.88 
 
 		 509 aa  103  9e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  22.9 
 
 		 529 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  22.9 
 
 		 529 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4357  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.2 
 
 		 535 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000122656  decreased coverage  0.0000528459 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  22.9 
 
 		 529 aa  102  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  22.7 
 
 		 529 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  22.7 
 
 		 529 aa  101  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  22.7 
 
 		 529 aa  101  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  22.7 
 
 		 529 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2272  5'-Nucleotidase domain protein  26.82 
 
 		 698 aa  100  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  22.49 
 
 		 529 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.89 
 
 		 627 aa  100  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4645  5'-Nucleotidase domain protein  26.94 
 
 		 506 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>