More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1176 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  100 
 
 
505 aa  1031    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  29.67 
 
 
504 aa  207  4e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.2 
 
 
508 aa  189  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  29.64 
 
 
577 aa  186  7e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4154  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.73 
 
 
564 aa  183  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  27.81 
 
 
532 aa  180  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  29.14 
 
 
481 aa  171  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  28.29 
 
 
482 aa  171  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.76 
 
 
587 aa  169  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4369  twin-arginine translocation pathway signal  27.71 
 
 
578 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  26.32 
 
 
559 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3253  sulfur oxidation signal peptide protein  32.08 
 
 
572 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.09 
 
 
517 aa  165  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  30.7 
 
 
1181 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1519  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.96 
 
 
563 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.661634 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  25.63 
 
 
530 aa  163  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0264  sulfate thiol esterase SoxB  26.69 
 
 
587 aa  163  6e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000260669  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.42 
 
 
523 aa  163  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3914  hypothetical protein  27.29 
 
 
563 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  29.42 
 
 
523 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  26.88 
 
 
657 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4958  5'-Nucleotidase domain protein  27.17 
 
 
565 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416285  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  26.48 
 
 
659 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  30.32 
 
 
1175 aa  159  8e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  27.17 
 
 
565 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  28.3 
 
 
1202 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.17 
 
 
479 aa  156  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  28.09 
 
 
1215 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  26 
 
 
526 aa  154  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.59 
 
 
515 aa  154  5e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3451  5'-Nucleotidase domain protein  30.67 
 
 
573 aa  153  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2279  sulfate thiol esterase SoxB  30 
 
 
571 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1905  sulfate thiol esterase SoxB  26.44 
 
 
565 aa  150  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3417  sulfate thiol esterase SoxB  29.33 
 
 
574 aa  150  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1672  5'-Nucleotidase domain protein  29.84 
 
 
571 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  27.93 
 
 
520 aa  149  8e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  26.55 
 
 
529 aa  149  9e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3249  sulfate thiol esterase SoxB  28.25 
 
 
573 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3123  5'-Nucleotidase domain protein  30.67 
 
 
573 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3675  sulfate thiol esterase SoxB  26.96 
 
 
553 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0941118  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1150  5'-Nucleotidase domain protein  25.97 
 
 
577 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000459069 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.49 
 
 
533 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  28.17 
 
 
558 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1032  5'-Nucleotidase domain protein  28.47 
 
 
576 aa  147  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.556642  normal  0.811589 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1596  5'-Nucleotidase domain protein  29.6 
 
 
570 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0807  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.57 
 
 
576 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  26.83 
 
 
638 aa  146  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1467  5'-Nucleotidase domain protein  27.68 
 
 
579 aa  145  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00451887  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3778  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.95 
 
 
580 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.61 
 
 
627 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2625  sulfate thiol esterase SoxB  27.56 
 
 
574 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.561369  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  24.82 
 
 
523 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11803  5'-nucleotidase  25.49 
 
 
552 aa  144  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0563  sulfate thiol esterase SoxB  27.88 
 
 
610 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000246299  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.27 
 
 
1284 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  24.12 
 
 
518 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  24.12 
 
 
518 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  25.38 
 
 
564 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  24.12 
 
 
518 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2432  sulfate thiol esterase SoxB  26.09 
 
 
575 aa  140  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  24.02 
 
 
518 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  25.66 
 
 
663 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.39 
 
 
607 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.79 
 
 
605 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4357  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.77 
 
 
535 aa  137  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000122656  decreased coverage  0.0000528459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  24.02 
 
 
518 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  26.18 
 
 
529 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  26.18 
 
 
529 aa  136  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.47 
 
 
508 aa  136  9e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.47 
 
 
508 aa  136  9e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3451  hypothetical protein  28.04 
 
 
572 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  26.18 
 
 
529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  25.97 
 
 
529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  26.18 
 
 
529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  25.97 
 
 
529 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  25.97 
 
 
529 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0816  5'-Nucleotidase domain protein  25.52 
 
 
586 aa  134  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24833  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2257  5'-nucleotidase family protein  24.9 
 
 
533 aa  134  3.9999999999999996e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000083157  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2861  5'-Nucleotidase domain-containing protein  24.69 
 
 
568 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  22.47 
 
 
489 aa  134  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.77 
 
 
529 aa  134  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.23 
 
 
517 aa  134  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4363  cell wall anchor domain-containing protein  23.23 
 
 
633 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  27.96 
 
 
555 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.31 
 
 
539 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  26.62 
 
 
529 aa  131  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1927  twin-arginine translocation pathway signal  25.11 
 
 
585 aa  131  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1621  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  25.1 
 
 
577 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637652  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3128  sulfate thiol esterase SoxB  24.69 
 
 
573 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304524  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  25.15 
 
 
529 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1753  UshA protein  25.54 
 
 
508 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2223  5'-Nucleotidase domain protein  25.6 
 
 
596 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.07 
 
 
509 aa  127  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1939  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.42 
 
 
581 aa  126  7e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0023  cell wall anchor domain-containing protein  24.85 
 
 
772 aa  126  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.244704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0023  cell wall anchor domain-containing protein  24.85 
 
 
772 aa  126  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0275377  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3048  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.42 
 
 
578 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1751  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.69 
 
 
553 aa  126  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000978587  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  23.32 
 
 
523 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  23.11 
 
 
520 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>