More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0627 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc3253  sulfur oxidation signal peptide protein  57.36 
 
 
572 aa  658    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3123  5'-Nucleotidase domain protein  57.17 
 
 
573 aa  639    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3451  5'-Nucleotidase domain protein  57.17 
 
 
573 aa  650    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1032  5'-Nucleotidase domain protein  54.71 
 
 
576 aa  660    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.556642  normal  0.811589 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0627  5'-Nucleotidase domain protein  100 
 
 
603 aa  1247    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.367803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3128  sulfate thiol esterase SoxB  57.78 
 
 
573 aa  682    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304524  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3249  sulfate thiol esterase SoxB  57.6 
 
 
573 aa  684    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0563  sulfate thiol esterase SoxB  60.41 
 
 
610 aa  707    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000246299  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0807  5'-nucleotidase domain-containing protein  54.44 
 
 
576 aa  659    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3778  5'-nucleotidase domain-containing protein  56.73 
 
 
580 aa  680    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2625  sulfate thiol esterase SoxB  56.93 
 
 
574 aa  662    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.561369  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3417  sulfate thiol esterase SoxB  56.43 
 
 
574 aa  669    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2223  5'-Nucleotidase domain protein  68.34 
 
 
596 aa  813    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1150  5'-Nucleotidase domain protein  55.57 
 
 
577 aa  672    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000459069 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1916  5'-Nucleotidase domain protein  55.13 
 
 
600 aa  690    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2432  sulfate thiol esterase SoxB  56.61 
 
 
575 aa  662    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2279  sulfate thiol esterase SoxB  54.44 
 
 
571 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1672  5'-Nucleotidase domain protein  54.78 
 
 
571 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1596  5'-Nucleotidase domain protein  54.78 
 
 
570 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1939  5'-nucleotidase domain-containing protein  52.09 
 
 
581 aa  595  1e-168  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0816  5'-Nucleotidase domain protein  52 
 
 
586 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24833  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1927  twin-arginine translocation pathway signal  50.41 
 
 
585 aa  581  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1549  Sulfate thiol esterase  48.02 
 
 
636 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229205  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1905  sulfate thiol esterase SoxB  48.78 
 
 
565 aa  547  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3675  sulfate thiol esterase SoxB  48.44 
 
 
553 aa  542  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0941118  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3914  hypothetical protein  48.94 
 
 
563 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3671  twin-arginine translocation pathway signal  49.14 
 
 
580 aa  533  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4154  5'-nucleotidase domain-containing protein  46.76 
 
 
564 aa  528  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  47.71 
 
 
559 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4958  5'-Nucleotidase domain protein  47.88 
 
 
565 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416285  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1519  5'-nucleotidase domain-containing protein  47.38 
 
 
563 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.661634 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  48.51 
 
 
564 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0692  sulfate thiol esterase SoxB  49.45 
 
 
583 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  47.11 
 
 
565 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4369  twin-arginine translocation pathway signal  46.26 
 
 
578 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0141  5'-nucleotidase domain-containing protein  48.33 
 
 
592 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3048  5'-nucleotidase domain-containing protein  47.31 
 
 
578 aa  491  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  43.77 
 
 
577 aa  465  1e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0264  sulfate thiol esterase SoxB  37.18 
 
 
587 aa  411  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000260669  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1467  5'-Nucleotidase domain protein  36.61 
 
 
579 aa  371  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00451887  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2861  5'-Nucleotidase domain-containing protein  37.67 
 
 
568 aa  369  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3451  hypothetical protein  35.48 
 
 
572 aa  347  3e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  29.77 
 
 
481 aa  182  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  29.05 
 
 
482 aa  173  9e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.99 
 
 
479 aa  172  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11803  5'-nucleotidase  28.21 
 
 
552 aa  156  9e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1621  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  27.65 
 
 
577 aa  143  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637652  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1292  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  26.11 
 
 
595 aa  140  6e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.519034  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  29.47 
 
 
504 aa  139  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3035  5'-Nucleotidase domain protein  26.34 
 
 
594 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  28.21 
 
 
505 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2012  putative esterase  25.96 
 
 
713 aa  124  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.79 
 
 
508 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.32 
 
 
515 aa  114  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4182  lipoprotein UxpA  24.87 
 
 
546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  24.71 
 
 
489 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  27.31 
 
 
520 aa  110  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1041  lipoprotein UxpA  25.93 
 
 
546 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  24.81 
 
 
530 aa  103  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1085  lipoprotein UxpA  24.58 
 
 
546 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  25.43 
 
 
532 aa  100  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.21 
 
 
601 aa  97.8  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1044  lipoprotein UxpA  24.15 
 
 
550 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0577127  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.95 
 
 
508 aa  96.7  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.95 
 
 
508 aa  96.7  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  26.67 
 
 
1215 aa  94  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  24.56 
 
 
555 aa  93.6  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.48 
 
 
1284 aa  92.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  23.16 
 
 
523 aa  91.3  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  26.44 
 
 
1202 aa  90.9  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3374  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.73 
 
 
527 aa  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.231702  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  25.39 
 
 
558 aa  90.1  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3705  5'-nucleotidase family protein  24.73 
 
 
527 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000001284 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2582  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.04 
 
 
505 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270196  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.53 
 
 
509 aa  86.7  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0402  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.24 
 
 
689 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0127264  normal  0.0127974 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  23.74 
 
 
518 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4363  cell wall anchor domain-containing protein  30.57 
 
 
633 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  23.64 
 
 
518 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  23.54 
 
 
518 aa  85.1  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.58 
 
 
533 aa  84.7  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  24.3 
 
 
527 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4241  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  24.6 
 
 
608 aa  84.7  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  24.71 
 
 
515 aa  84.7  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  23.64 
 
 
518 aa  84.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  21.36 
 
 
504 aa  84  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1038  metallophosphoesterase  25.55 
 
 
638 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27161  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.01 
 
 
503 aa  84  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3393  5'-nucleotidase; 2',3'-cyclic phosphodiesterase  24.3 
 
 
527 aa  84  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.803597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  23.35 
 
 
518 aa  83.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3724  2,3-cyclic-nucleotide 2-phosphodiesterase, putative  21.81 
 
 
529 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1429  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase periplasmic precursor protein  25.8 
 
 
662 aa  80.1  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.811098 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2287  5'-nucleotidase-like  24.61 
 
 
689 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195836  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  28.74 
 
 
581 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2951  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.8 
 
 
686 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7607  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  24.64 
 
 
585 aa  80.1  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2902  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.61 
 
 
689 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.522294  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  23.71 
 
 
587 aa  79.7  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6244  5'-nucleotidase-like  24.61 
 
 
689 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2813  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.61 
 
 
686 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.166692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>