More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0563 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1596  5'-Nucleotidase domain protein  65.68 
 
 		 570 aa  772    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3253  sulfur oxidation signal peptide protein  65.05 
 
 		 572 aa  769    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1916  5'-Nucleotidase domain protein  53.85 
 
 		 600 aa  676    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3123  5'-Nucleotidase domain protein  65.74 
 
 		 573 aa  752    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2223  5'-Nucleotidase domain protein  60.61 
 
 		 596 aa  690    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0807  5'-nucleotidase domain-containing protein  66.67 
 
 		 576 aa  818    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3778  5'-nucleotidase domain-containing protein  66.67 
 
 		 580 aa  803    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3128  sulfate thiol esterase SoxB  68.17 
 
 		 573 aa  822    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3249  sulfate thiol esterase SoxB  70.21 
 
 		 573 aa  842    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0563  sulfate thiol esterase SoxB  100 
 
 		 610 aa  1254    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000246299  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1672  5'-Nucleotidase domain protein  65.16 
 
 		 571 aa  766    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2279  sulfate thiol esterase SoxB  64.81 
 
 		 571 aa  764    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2625  sulfate thiol esterase SoxB  65.51 
 
 		 574 aa  776    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.561369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1150  5'-Nucleotidase domain protein  57.99 
 
 		 577 aa  700    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000459069 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3417  sulfate thiol esterase SoxB  68.59 
 
 		 574 aa  824    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0627  5'-Nucleotidase domain protein  60.07 
 
 		 603 aa  684    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.367803 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1032  5'-Nucleotidase domain protein  66.84 
 
 		 576 aa  833    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.556642  normal  0.811589 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2432  sulfate thiol esterase SoxB  66.96 
 
 		 575 aa  788    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3451  5'-Nucleotidase domain protein  65.62 
 
 		 573 aa  769    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0816  5'-Nucleotidase domain protein  53.5 
 
 		 586 aa  620  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24833  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1927  twin-arginine translocation pathway signal  53.4 
 
 		 585 aa  620  1e-176  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1905  sulfate thiol esterase SoxB  53.78 
 
 		 565 aa  616  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1549  Sulfate thiol esterase  50.31 
 
 		 636 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229205  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1939  5'-nucleotidase domain-containing protein  50.52 
 
 		 581 aa  593  1e-168  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3671  twin-arginine translocation pathway signal  52.39 
 
 		 580 aa  580  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  50.09 
 
 		 564 aa  566  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4154  5'-nucleotidase domain-containing protein  49.73 
 
 		 564 aa  567  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0692  sulfate thiol esterase SoxB  50.59 
 
 		 583 aa  567  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3914  hypothetical protein  48.84 
 
 		 563 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0141  5'-nucleotidase domain-containing protein  52.05 
 
 		 592 aa  561  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3675  sulfate thiol esterase SoxB  50.57 
 
 		 553 aa  549  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0941118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  50.72 
 
 		 559 aa  549  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1519  5'-nucleotidase domain-containing protein  49.64 
 
 		 563 aa  544  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.661634 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4958  5'-Nucleotidase domain protein  49.19 
 
 		 565 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416285  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4369  twin-arginine translocation pathway signal  47.58 
 
 		 578 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3048  5'-nucleotidase domain-containing protein  49.45 
 
 		 578 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  48.1 
 
 		 565 aa  515  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  43.11 
 
 		 577 aa  489  1e-137  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0264  sulfate thiol esterase SoxB  39.3 
 
 		 587 aa  441  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000260669  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2861  5'-Nucleotidase domain-containing protein  37.5 
 
 		 568 aa  391  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1467  5'-Nucleotidase domain protein  37.32 
 
 		 579 aa  390  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00451887  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3451  hypothetical protein  36.36 
 
 		 572 aa  368  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  29.95 
 
 		 482 aa  200  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.89 
 
 		 479 aa  192  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  29.6 
 
 		 481 aa  182  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11803  5'-nucleotidase  27.21 
 
 		 552 aa  166  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1292  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  27.14 
 
 		 595 aa  159  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.519034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  29.11 
 
 		 504 aa  144  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  27.88 
 
 		 505 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1621  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  25.73 
 
 		 577 aa  140  8.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3035  5'-Nucleotidase domain protein  26.24 
 
 		 594 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  26.12 
 
 		 489 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.81 
 
 		 508 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4182  lipoprotein UxpA  26.08 
 
 		 546 aa  120  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  29.78 
 
 		 520 aa  117  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.17 
 
 		 515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2012  putative esterase  25 
 
 		 713 aa  111  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  26.86 
 
 		 530 aa  110  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.47 
 
 		 1284 aa  110  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  25.56 
 
 		 518 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  25.33 
 
 		 518 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1041  lipoprotein UxpA  24.6 
 
 		 546 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  25.33 
 
 		 518 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.32 
 
 		 503 aa  105  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  25.16 
 
 		 523 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  25.11 
 
 		 518 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  25.33 
 
 		 518 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  26.3 
 
 		 532 aa  104  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1085  lipoprotein UxpA  24.7 
 
 		 546 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  27.19 
 
 		 547 aa  103  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  26.8 
 
 		 523 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.58 
 
 		 555 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  26.58 
 
 		 520 aa  101  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  26.58 
 
 		 520 aa  101  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.58 
 
 		 523 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4363  cell wall anchor domain-containing protein  24.27 
 
 		 633 aa  99.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.05 
 
 		 517 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.78 
 
 		 516 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1044  lipoprotein UxpA  23.62 
 
 		 550 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0577127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  26.67 
 
 		 520 aa  94  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.58 
 
 		 533 aa  93.6  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.78 
 
 		 517 aa  92  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1926  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.81 
 
 		 568 aa  90.9  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  32.34 
 
 		 581 aa  90.5  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  26.2 
 
 		 659 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.79 
 
 		 627 aa  89.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3228  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.04 
 
 		 549 aa  89  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00425735  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.46 
 
 		 539 aa  88.2  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  23.22 
 
 		 504 aa  87  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0171  5'-nucleotidase family protein  25 
 
 		 590 aa  85.1  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  26.53 
 
 		 512 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1083  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.1 
 
 		 549 aa  84.7  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000234705  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3374  5'-nucleotidase domain-containing protein  22.35 
 
 		 527 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.231702  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1793  metallophosphoesterase  28.94 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25 
 
 		 509 aa  83.2  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  25.43 
 
 		 657 aa  83.2  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7607  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  24.12 
 
 		 585 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  25.36 
 
 		 526 aa  82.8  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2309  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.85 
 
 		 572 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.897886  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0351  5'-Nucleotidase domain protein  27.47 
 
 		 579 aa  82  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>