More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3417 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1916  5'-Nucleotidase domain protein  54.24 
 
 		 600 aa  682    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0807  5'-nucleotidase domain-containing protein  72.68 
 
 		 576 aa  884    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3253  sulfur oxidation signal peptide protein  73.82 
 
 		 572 aa  879    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3451  5'-Nucleotidase domain protein  74.91 
 
 		 573 aa  885    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1672  5'-Nucleotidase domain protein  67.59 
 
 		 571 aa  803    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1032  5'-Nucleotidase domain protein  73.38 
 
 		 576 aa  895    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.556642  normal  0.811589 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3128  sulfate thiol esterase SoxB  68.65 
 
 		 573 aa  839    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3249  sulfate thiol esterase SoxB  86.16 
 
 		 573 aa  1017    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0563  sulfate thiol esterase SoxB  68.59 
 
 		 610 aa  831    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000246299  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1596  5'-Nucleotidase domain protein  68.35 
 
 		 570 aa  806    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2279  sulfate thiol esterase SoxB  68.28 
 
 		 571 aa  809    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2223  5'-Nucleotidase domain protein  56.93 
 
 		 596 aa  665    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2625  sulfate thiol esterase SoxB  67.25 
 
 		 574 aa  800    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.561369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3417  sulfate thiol esterase SoxB  100 
 
 		 574 aa  1176    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1150  5'-Nucleotidase domain protein  55.56 
 
 		 577 aa  687    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000459069 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3123  5'-Nucleotidase domain protein  75.78 
 
 		 573 aa  879    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3778  5'-nucleotidase domain-containing protein  67.71 
 
 		 580 aa  830    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0627  5'-Nucleotidase domain protein  55.92 
 
 		 603 aa  648    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.367803 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2432  sulfate thiol esterase SoxB  68.83 
 
 		 575 aa  818    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1927  twin-arginine translocation pathway signal  54.34 
 
 		 585 aa  630  1e-179  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0816  5'-Nucleotidase domain protein  53.49 
 
 		 586 aa  624  1e-177  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24833  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3671  twin-arginine translocation pathway signal  54.67 
 
 		 580 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1905  sulfate thiol esterase SoxB  51.87 
 
 		 565 aa  590  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0692  sulfate thiol esterase SoxB  52.63 
 
 		 583 aa  586  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1939  5'-nucleotidase domain-containing protein  50 
 
 		 581 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0141  5'-nucleotidase domain-containing protein  53.91 
 
 		 592 aa  578  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3914  hypothetical protein  50.26 
 
 		 563 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1549  Sulfate thiol esterase  47.87 
 
 		 636 aa  566  1e-160  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229205  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4369  twin-arginine translocation pathway signal  50.96 
 
 		 578 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  51.05 
 
 		 559 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4154  5'-nucleotidase domain-containing protein  49.3 
 
 		 564 aa  565  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4958  5'-Nucleotidase domain protein  50.96 
 
 		 565 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416285  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  51.13 
 
 		 565 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  50.44 
 
 		 564 aa  555  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3675  sulfate thiol esterase SoxB  49.73 
 
 		 553 aa  555  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0941118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1519  5'-nucleotidase domain-containing protein  50.53 
 
 		 563 aa  550  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.661634 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3048  5'-nucleotidase domain-containing protein  50.27 
 
 		 578 aa  529  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  46.4 
 
 		 577 aa  504  1e-141  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0264  sulfate thiol esterase SoxB  39.61 
 
 		 587 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000260669  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2861  5'-Nucleotidase domain-containing protein  42.1 
 
 		 568 aa  436  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1467  5'-Nucleotidase domain protein  38.33 
 
 		 579 aa  410  1e-113  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00451887  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3451  hypothetical protein  41.44 
 
 		 572 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  32.77 
 
 		 482 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.4 
 
 		 479 aa  201  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  31.23 
 
 		 481 aa  200  7e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11803  5'-nucleotidase  27.97 
 
 		 552 aa  167  5.9999999999999996e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  31.52 
 
 		 504 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1292  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  25.78 
 
 		 595 aa  153  8.999999999999999e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.519034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  29.33 
 
 		 505 aa  150  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.95 
 
 		 508 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1621  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  27.03 
 
 		 577 aa  137  7.000000000000001e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3035  5'-Nucleotidase domain protein  25.54 
 
 		 594 aa  127  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  27.5 
 
 		 523 aa  124  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2012  putative esterase  24.72 
 
 		 713 aa  117  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1041  lipoprotein UxpA  25.69 
 
 		 546 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  25.25 
 
 		 518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4182  lipoprotein UxpA  26.28 
 
 		 546 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  24.8 
 
 		 530 aa  115  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  25.05 
 
 		 518 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  25.05 
 
 		 518 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  26.88 
 
 		 520 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  24.85 
 
 		 518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  26.88 
 
 		 520 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1085  lipoprotein UxpA  25.09 
 
 		 546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  27.31 
 
 		 523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  25.05 
 
 		 518 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  28.38 
 
 		 520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.88 
 
 		 523 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  25.56 
 
 		 489 aa  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.3 
 
 		 516 aa  107  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.54 
 
 		 503 aa  107  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.59 
 
 		 515 aa  107  8e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1044  lipoprotein UxpA  24.45 
 
 		 550 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0577127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  27.8 
 
 		 555 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  23.98 
 
 		 517 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.33 
 
 		 517 aa  99.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  24.42 
 
 		 532 aa  99  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  25.8 
 
 		 659 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.77 
 
 		 533 aa  95.9  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.11 
 
 		 539 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.65 
 
 		 1284 aa  94.4  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1750  5'-nucleotidase  24.82 
 
 		 500 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.398789 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1286  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  23.71 
 
 		 687 aa  90.5  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  24.67 
 
 		 657 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1472  5'-nucleotidase  24.11 
 
 		 505 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633021  normal  0.092078 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  26.15 
 
 		 504 aa  87.8  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  27.57 
 
 		 515 aa  87  8e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1472  5'-nucleotidase  23.88 
 
 		 517 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.150971 
 
 
-
 
NC_002950  PG0171  5'-nucleotidase family protein  25.95 
 
 		 590 aa  84  0.000000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1992  putative 2`,3`-cyclic-nucleotide 2`-phosphodiesterase  25.43 
 
 		 634 aa  83.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1086  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.2 
 
 		 571 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.244523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  27.75 
 
 		 523 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0351  5'-Nucleotidase domain protein  25.81 
 
 		 579 aa  82.4  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4363  cell wall anchor domain-containing protein  27.07 
 
 		 633 aa  82.4  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  27.83 
 
 		 1181 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  27.29 
 
 		 1215 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  26.11 
 
 		 512 aa  82  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.69 
 
 		 509 aa  81.6  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  30.77 
 
 		 581 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.72 
 
 		 508 aa  79.7  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>