More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4160 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  63.01 
 
 
564 aa  741    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3914  hypothetical protein  66.13 
 
 
563 aa  766    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4958  5'-Nucleotidase domain protein  61.95 
 
 
565 aa  724    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416285  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4369  twin-arginine translocation pathway signal  61.38 
 
 
578 aa  733    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  62.26 
 
 
565 aa  726    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3675  sulfate thiol esterase SoxB  72.27 
 
 
553 aa  832    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0941118  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  100 
 
 
559 aa  1143    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4154  5'-nucleotidase domain-containing protein  64.54 
 
 
564 aa  754    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1519  5'-nucleotidase domain-containing protein  63.83 
 
 
563 aa  723    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.661634 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1905  sulfate thiol esterase SoxB  53.04 
 
 
565 aa  608  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3417  sulfate thiol esterase SoxB  51.14 
 
 
574 aa  560  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2279  sulfate thiol esterase SoxB  52.88 
 
 
571 aa  554  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1596  5'-Nucleotidase domain protein  54.93 
 
 
570 aa  552  1e-156  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0807  5'-nucleotidase domain-containing protein  50.64 
 
 
576 aa  551  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1672  5'-Nucleotidase domain protein  54.35 
 
 
571 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0563  sulfate thiol esterase SoxB  50.72 
 
 
610 aa  549  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000246299  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1032  5'-Nucleotidase domain protein  50.18 
 
 
576 aa  550  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.556642  normal  0.811589 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2625  sulfate thiol esterase SoxB  51.8 
 
 
574 aa  549  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.561369  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3778  5'-nucleotidase domain-containing protein  51.26 
 
 
580 aa  545  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3249  sulfate thiol esterase SoxB  49.82 
 
 
573 aa  534  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1150  5'-Nucleotidase domain protein  45.7 
 
 
577 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000459069 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3253  sulfur oxidation signal peptide protein  52.69 
 
 
572 aa  530  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2432  sulfate thiol esterase SoxB  50.63 
 
 
575 aa  531  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3451  5'-Nucleotidase domain protein  52.02 
 
 
573 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0692  sulfate thiol esterase SoxB  49.39 
 
 
583 aa  525  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2223  5'-Nucleotidase domain protein  48.08 
 
 
596 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0816  5'-Nucleotidase domain protein  47.91 
 
 
586 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24833  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3128  sulfate thiol esterase SoxB  47.54 
 
 
573 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304524  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0141  5'-nucleotidase domain-containing protein  49.72 
 
 
592 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3123  5'-Nucleotidase domain protein  51.82 
 
 
573 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3671  twin-arginine translocation pathway signal  50.92 
 
 
580 aa  515  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0627  5'-Nucleotidase domain protein  46.57 
 
 
603 aa  505  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.367803 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1927  twin-arginine translocation pathway signal  46.57 
 
 
585 aa  498  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  44.58 
 
 
577 aa  493  9.999999999999999e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1916  5'-Nucleotidase domain protein  40.98 
 
 
600 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3048  5'-nucleotidase domain-containing protein  47.66 
 
 
578 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1939  5'-nucleotidase domain-containing protein  44.11 
 
 
581 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0264  sulfate thiol esterase SoxB  41.84 
 
 
587 aa  457  1e-127  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000260669  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2861  5'-Nucleotidase domain-containing protein  41.4 
 
 
568 aa  421  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1549  Sulfate thiol esterase  38.37 
 
 
636 aa  413  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229205  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1467  5'-Nucleotidase domain protein  37.91 
 
 
579 aa  409  1.0000000000000001e-112  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00451887  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3451  hypothetical protein  36.85 
 
 
572 aa  386  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  35.29 
 
 
482 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.57 
 
 
479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  33.1 
 
 
481 aa  212  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  26.32 
 
 
505 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  26.28 
 
 
504 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11803  5'-nucleotidase  24.84 
 
 
552 aa  144  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3035  5'-Nucleotidase domain protein  27.24 
 
 
594 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  27.08 
 
 
523 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1292  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  26.56 
 
 
595 aa  134  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.519034  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  27.29 
 
 
516 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.97 
 
 
508 aa  130  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1041  lipoprotein UxpA  26.16 
 
 
546 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.58 
 
 
523 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  26.37 
 
 
523 aa  128  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1085  lipoprotein UxpA  26.03 
 
 
546 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.95 
 
 
517 aa  125  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1621  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  25.66 
 
 
577 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637652  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  28.93 
 
 
520 aa  122  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  28.1 
 
 
520 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  28.1 
 
 
520 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  28.1 
 
 
523 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.1 
 
 
523 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  25.7 
 
 
489 aa  120  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1044  lipoprotein UxpA  26.02 
 
 
550 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0577127  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4182  lipoprotein UxpA  26.73 
 
 
546 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1472  5'-nucleotidase  27.88 
 
 
505 aa  117  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633021  normal  0.092078 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  26.61 
 
 
530 aa  117  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  24.95 
 
 
532 aa  116  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2012  putative esterase  26.83 
 
 
713 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  25.51 
 
 
659 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  26.81 
 
 
518 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.79 
 
 
533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  26.81 
 
 
518 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.81 
 
 
518 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.12 
 
 
607 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  26.59 
 
 
518 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1750  5'-nucleotidase  27.19 
 
 
500 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.398789 
 
 
-
 
NC_002950  PG0171  5'-nucleotidase family protein  27.79 
 
 
590 aa  108  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1472  5'-nucleotidase  26.24 
 
 
517 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.150971 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.37 
 
 
518 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  27.47 
 
 
517 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  26.77 
 
 
638 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.36 
 
 
627 aa  103  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.8 
 
 
503 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.66 
 
 
515 aa  101  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.57 
 
 
605 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.91 
 
 
539 aa  100  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  24.24 
 
 
657 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2582  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.79 
 
 
505 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270196  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  24.83 
 
 
526 aa  97.4  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  23.79 
 
 
663 aa  97.8  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4241  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  26.79 
 
 
608 aa  96.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0435  metallophosphoesterase  28.13 
 
 
483 aa  95.5  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  27.05 
 
 
547 aa  95.9  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  26.98 
 
 
512 aa  94  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  24.32 
 
 
504 aa  93.6  9e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  25 
 
 
555 aa  92.8  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4645  5'-Nucleotidase domain protein  25.42 
 
 
506 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>