More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1472 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1472  5'-nucleotidase  88.29 
 
 
517 aa  830    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.150971 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1472  5'-nucleotidase  100 
 
 
505 aa  986    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633021  normal  0.092078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1750  5'-nucleotidase  96.24 
 
 
500 aa  907    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.398789 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2582  5'-nucleotidase domain-containing protein  60.08 
 
 
505 aa  555  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270196  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4645  5'-Nucleotidase domain protein  57.2 
 
 
506 aa  509  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132836  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3478  5'-nucleotidase domain-containing protein  45.35 
 
 
508 aa  372  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622587  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  37.73 
 
 
512 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10661  5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14310)  32.3 
 
 
666 aa  212  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  29.85 
 
 
523 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  30.32 
 
 
659 aa  196  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3839  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.18 
 
 
502 aa  194  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0174247 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3565  5'-nucleotidase-like  27.35 
 
 
491 aa  193  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  29.27 
 
 
657 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.32 
 
 
627 aa  187  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  30.42 
 
 
520 aa  183  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.67 
 
 
587 aa  179  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  32.22 
 
 
523 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.51 
 
 
523 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.74 
 
 
607 aa  173  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  30.96 
 
 
532 aa  173  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  30.83 
 
 
526 aa  172  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.35 
 
 
508 aa  170  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  26.79 
 
 
638 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.81 
 
 
605 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  31.31 
 
 
529 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  26.35 
 
 
504 aa  161  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  28.02 
 
 
663 aa  160  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05655  5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01160)  28.74 
 
 
498 aa  159  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.511883 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.77 
 
 
533 aa  156  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  30.04 
 
 
555 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  28 
 
 
509 aa  149  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  25.81 
 
 
518 aa  148  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  25.62 
 
 
518 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  25.62 
 
 
518 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.32 
 
 
518 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  25.62 
 
 
518 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  25.35 
 
 
530 aa  144  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  29.15 
 
 
558 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3996  metallophosphoesterase  29.61 
 
 
501 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  26.84 
 
 
529 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.72 
 
 
515 aa  139  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  26.84 
 
 
529 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  26.64 
 
 
529 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  26.39 
 
 
517 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  26.84 
 
 
529 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  26.64 
 
 
529 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  26.15 
 
 
529 aa  137  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.53 
 
 
508 aa  137  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.53 
 
 
508 aa  137  5e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  26.84 
 
 
529 aa  137  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  26.39 
 
 
529 aa  136  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  26.39 
 
 
529 aa  136  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  26.39 
 
 
529 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  26.84 
 
 
529 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  25.97 
 
 
529 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  26.39 
 
 
529 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  26.88 
 
 
529 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  26.18 
 
 
529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.24 
 
 
529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  26.64 
 
 
529 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.18 
 
 
529 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  25.97 
 
 
529 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  25.75 
 
 
529 aa  134  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.01 
 
 
530 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.32 
 
 
539 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2272  5'-Nucleotidase domain protein  27.77 
 
 
698 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  25.5 
 
 
504 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  27 
 
 
722 aa  128  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.86 
 
 
503 aa  127  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  29 
 
 
556 aa  126  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  25.05 
 
 
733 aa  126  8.000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3675  sulfate thiol esterase SoxB  27.36 
 
 
553 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0941118  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  23.67 
 
 
516 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1162  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.84 
 
 
509 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.587696  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2906  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.02 
 
 
872 aa  121  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.865364  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4357  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.11 
 
 
535 aa  120  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000122656  decreased coverage  0.0000528459 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0193  5'-Nucleotidase domain protein  28.19 
 
 
647 aa  120  7.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  27.98 
 
 
559 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4958  5'-Nucleotidase domain protein  26.9 
 
 
565 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416285  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0770  hypothetical protein  25.85 
 
 
494 aa  119  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0435577  normal  0.251523 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.35 
 
 
601 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0448  5'-nucleotidase family protein  29.5 
 
 
580 aa  118  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  23.67 
 
 
489 aa  118  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  28.65 
 
 
619 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  25.66 
 
 
547 aa  117  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05939  conserved hypothetical protein  25.42 
 
 
582 aa  117  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.35 
 
 
578 aa  117  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0615  5'-Nucleotidase domain protein  27.8 
 
 
700 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  28.4 
 
 
558 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  27.36 
 
 
520 aa  113  6e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0854  5'-Nucleotidase domain protein  25.91 
 
 
619 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192901  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0825  5'-Nucleotidase domain protein  25.91 
 
 
619 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.37 
 
 
1284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4369  twin-arginine translocation pathway signal  26.08 
 
 
578 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  28.37 
 
 
559 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  28.57 
 
 
555 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0023  cell wall anchor domain-containing protein  24.03 
 
 
772 aa  110  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0275377  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04020  conserved hypothetical protein  22.2 
 
 
788 aa  110  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.43338  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.53 
 
 
517 aa  110  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.31 
 
 
557 aa  110  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>