More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1173 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  100 
 
 
482 aa  998    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  57.77 
 
 
479 aa  578  1e-164  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  52.1 
 
 
481 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  34.39 
 
 
577 aa  278  1e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4154  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.52 
 
 
564 aa  260  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3914  hypothetical protein  37.5 
 
 
563 aa  259  9e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0264  sulfate thiol esterase SoxB  31.57 
 
 
587 aa  257  3e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000260669  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11803  5'-nucleotidase  31.58 
 
 
552 aa  251  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  34.48 
 
 
564 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  35.29 
 
 
559 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1905  sulfate thiol esterase SoxB  34.39 
 
 
565 aa  231  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3675  sulfate thiol esterase SoxB  32.47 
 
 
553 aa  231  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0941118  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4958  5'-Nucleotidase domain protein  34.62 
 
 
565 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416285  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1467  5'-Nucleotidase domain protein  33.33 
 
 
579 aa  230  4e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00451887  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  34.87 
 
 
565 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2861  5'-Nucleotidase domain-containing protein  32.26 
 
 
568 aa  226  7e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4369  twin-arginine translocation pathway signal  32.36 
 
 
578 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3249  sulfate thiol esterase SoxB  33.5 
 
 
573 aa  222  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0692  sulfate thiol esterase SoxB  33.49 
 
 
583 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1519  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.62 
 
 
563 aa  217  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.661634 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1939  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.05 
 
 
581 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3417  sulfate thiol esterase SoxB  32.77 
 
 
574 aa  213  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3048  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.81 
 
 
578 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3253  sulfur oxidation signal peptide protein  32.84 
 
 
572 aa  211  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1596  5'-Nucleotidase domain protein  33.09 
 
 
570 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3451  5'-Nucleotidase domain protein  32.84 
 
 
573 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3671  twin-arginine translocation pathway signal  33.41 
 
 
580 aa  210  5e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1672  5'-Nucleotidase domain protein  33.09 
 
 
571 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2432  sulfate thiol esterase SoxB  32.28 
 
 
575 aa  209  7e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2279  sulfate thiol esterase SoxB  33.57 
 
 
571 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3123  5'-Nucleotidase domain protein  33.33 
 
 
573 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2625  sulfate thiol esterase SoxB  32.13 
 
 
574 aa  207  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.561369  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1621  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  31.63 
 
 
577 aa  206  7e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637652  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0807  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.92 
 
 
576 aa  205  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1916  5'-Nucleotidase domain protein  30.31 
 
 
600 aa  202  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0816  5'-Nucleotidase domain protein  33.25 
 
 
586 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24833  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3128  sulfate thiol esterase SoxB  30.18 
 
 
573 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304524  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3778  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.72 
 
 
580 aa  201  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0563  sulfate thiol esterase SoxB  29.95 
 
 
610 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000246299  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1927  twin-arginine translocation pathway signal  32.76 
 
 
585 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1032  5'-Nucleotidase domain protein  30.19 
 
 
576 aa  197  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.556642  normal  0.811589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0141  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.25 
 
 
592 aa  196  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3451  hypothetical protein  29.95 
 
 
572 aa  195  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1292  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  28.87 
 
 
595 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.519034  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  27.86 
 
 
504 aa  181  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2223  5'-Nucleotidase domain protein  28.94 
 
 
596 aa  180  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1150  5'-Nucleotidase domain protein  27.78 
 
 
577 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000459069 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  28.29 
 
 
505 aa  171  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0627  5'-Nucleotidase domain protein  28.22 
 
 
603 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.367803 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.85 
 
 
508 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3035  5'-Nucleotidase domain protein  28.01 
 
 
594 aa  157  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1549  Sulfate thiol esterase  27.29 
 
 
636 aa  153  7e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229205  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2012  putative esterase  27.21 
 
 
713 aa  149  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  29.14 
 
 
523 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.31 
 
 
515 aa  143  6e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.83 
 
 
539 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.47 
 
 
508 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.47 
 
 
508 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.6 
 
 
503 aa  139  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  26.29 
 
 
523 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.56 
 
 
517 aa  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  26.95 
 
 
520 aa  137  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.87 
 
 
523 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  22.86 
 
 
515 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  25.62 
 
 
489 aa  133  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1908  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.01 
 
 
572 aa  132  9e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00316066  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  24.41 
 
 
657 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  24.36 
 
 
530 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  25.5 
 
 
638 aa  130  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  24.41 
 
 
659 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  27.27 
 
 
520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  24.88 
 
 
526 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1286  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  26.4 
 
 
687 aa  128  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  23.96 
 
 
532 aa  128  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.68 
 
 
516 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  23.98 
 
 
504 aa  127  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  25.63 
 
 
1215 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  25.55 
 
 
663 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  26.65 
 
 
619 aa  124  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  25.4 
 
 
1202 aa  123  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3060  metallophosphoesterase  26.62 
 
 
460 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2669  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.07 
 
 
569 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000803412  normal  0.0151204 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.5 
 
 
533 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  25.43 
 
 
518 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  25.43 
 
 
518 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.07 
 
 
518 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.76 
 
 
627 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  25 
 
 
518 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3228  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.15 
 
 
549 aa  121  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00425735  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1751  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.26 
 
 
553 aa  121  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000978587  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.36 
 
 
509 aa  121  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  27.81 
 
 
547 aa  120  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1952  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.82 
 
 
569 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.643025  normal  0.0714944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  25 
 
 
518 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  25.81 
 
 
555 aa  120  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  26.14 
 
 
558 aa  119  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  25 
 
 
517 aa  119  9e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4357  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.42 
 
 
535 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000122656  decreased coverage  0.0000528459 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.72 
 
 
605 aa  118  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.01 
 
 
607 aa  117  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>