More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0141 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_3048  5'-nucleotidase domain-containing protein  57.59 
 
 
578 aa  652    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0141  5'-nucleotidase domain-containing protein  100 
 
 
592 aa  1199    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0816  5'-Nucleotidase domain protein  54.91 
 
 
586 aa  649    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24833  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1927  twin-arginine translocation pathway signal  54.37 
 
 
585 aa  649    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3671  twin-arginine translocation pathway signal  67.47 
 
 
580 aa  782    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0692  sulfate thiol esterase SoxB  67.09 
 
 
583 aa  775    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1672  5'-Nucleotidase domain protein  55.58 
 
 
571 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3253  sulfur oxidation signal peptide protein  56.07 
 
 
572 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1596  5'-Nucleotidase domain protein  55.22 
 
 
570 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2279  sulfate thiol esterase SoxB  55.3 
 
 
571 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2625  sulfate thiol esterase SoxB  54.31 
 
 
574 aa  581  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.561369  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3417  sulfate thiol esterase SoxB  54.25 
 
 
574 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3249  sulfate thiol esterase SoxB  53.08 
 
 
573 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3451  5'-Nucleotidase domain protein  54.48 
 
 
573 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1032  5'-Nucleotidase domain protein  50.51 
 
 
576 aa  568  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.556642  normal  0.811589 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0807  5'-nucleotidase domain-containing protein  50.42 
 
 
576 aa  568  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3128  sulfate thiol esterase SoxB  50.68 
 
 
573 aa  568  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304524  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0563  sulfate thiol esterase SoxB  51.11 
 
 
610 aa  565  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000246299  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3778  5'-nucleotidase domain-containing protein  51.18 
 
 
580 aa  566  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3123  5'-Nucleotidase domain protein  54.48 
 
 
573 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2432  sulfate thiol esterase SoxB  53.13 
 
 
575 aa  559  1e-158  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1905  sulfate thiol esterase SoxB  49.31 
 
 
565 aa  549  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1549  Sulfate thiol esterase  46.7 
 
 
636 aa  543  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229205  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1916  5'-Nucleotidase domain protein  48.69 
 
 
600 aa  543  1e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4154  5'-nucleotidase domain-containing protein  48.8 
 
 
564 aa  538  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3675  sulfate thiol esterase SoxB  48.68 
 
 
553 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0941118  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  49.64 
 
 
559 aa  523  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3914  hypothetical protein  46.72 
 
 
563 aa  524  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1150  5'-Nucleotidase domain protein  45.18 
 
 
577 aa  518  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000459069 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  46.13 
 
 
564 aa  499  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1519  5'-nucleotidase domain-containing protein  48.1 
 
 
563 aa  501  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.661634 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4958  5'-Nucleotidase domain protein  46.03 
 
 
565 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416285  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  46.88 
 
 
565 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2223  5'-Nucleotidase domain protein  47.59 
 
 
596 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4369  twin-arginine translocation pathway signal  44.1 
 
 
578 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0627  5'-Nucleotidase domain protein  47.71 
 
 
603 aa  477  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.367803 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  40.35 
 
 
577 aa  449  1e-125  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1939  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.7 
 
 
581 aa  427  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0264  sulfate thiol esterase SoxB  37.41 
 
 
587 aa  416  9.999999999999999e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000260669  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2861  5'-Nucleotidase domain-containing protein  39.39 
 
 
568 aa  387  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1467  5'-Nucleotidase domain protein  35.5 
 
 
579 aa  371  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00451887  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3451  hypothetical protein  38.49 
 
 
572 aa  355  1e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  33.49 
 
 
481 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  31.25 
 
 
482 aa  196  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.27 
 
 
479 aa  179  9e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11803  5'-nucleotidase  29.64 
 
 
552 aa  166  9e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1292  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  24.89 
 
 
595 aa  133  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.519034  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  28.77 
 
 
504 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4182  lipoprotein UxpA  27.71 
 
 
546 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.21 
 
 
508 aa  124  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1041  lipoprotein UxpA  27.61 
 
 
546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.39 
 
 
627 aa  117  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1621  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  26.93 
 
 
577 aa  117  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637652  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1085  lipoprotein UxpA  27.19 
 
 
546 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2012  putative esterase  25.89 
 
 
713 aa  113  8.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1044  lipoprotein UxpA  26.33 
 
 
550 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0577127  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  25.51 
 
 
523 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  26.29 
 
 
505 aa  108  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  25.66 
 
 
1215 aa  107  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  25.66 
 
 
1202 aa  104  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  26.85 
 
 
518 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  26.85 
 
 
518 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  26.85 
 
 
518 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  26.03 
 
 
657 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.85 
 
 
518 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.62 
 
 
518 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  26.86 
 
 
659 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.59 
 
 
555 aa  97.8  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3035  5'-Nucleotidase domain protein  25.22 
 
 
594 aa  95.1  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  26.52 
 
 
520 aa  94.7  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  26.28 
 
 
526 aa  94.7  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.84 
 
 
503 aa  93.6  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.98 
 
 
533 aa  93.6  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  25.33 
 
 
1181 aa  92.4  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.18 
 
 
517 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  23.96 
 
 
530 aa  91.7  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0959  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.16 
 
 
550 aa  90.5  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  28.18 
 
 
512 aa  90.1  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  26.77 
 
 
520 aa  89.7  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.29 
 
 
523 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1793  metallophosphoesterase  29.84 
 
 
302 aa  89  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  24.67 
 
 
1175 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.72 
 
 
1284 aa  89.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  24.78 
 
 
520 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  24.78 
 
 
520 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  24.78 
 
 
523 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  24.78 
 
 
523 aa  88.2  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  26.92 
 
 
547 aa  87.4  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1427  5'-nucleotidase  29.78 
 
 
581 aa  87.4  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.78 
 
 
508 aa  87  9e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.78 
 
 
508 aa  87  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4645  5'-Nucleotidase domain protein  24.89 
 
 
506 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132836  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0547  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.26 
 
 
550 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0959773  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  27.87 
 
 
638 aa  86.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0557  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.48 
 
 
550 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.448857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.71 
 
 
607 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0540  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.26 
 
 
550 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  26.62 
 
 
523 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.34 
 
 
515 aa  85.1  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.26 
 
 
550 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0295686  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>