More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3671 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1927  twin-arginine translocation pathway signal  55.15 
 
 		 585 aa  675    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0692  sulfate thiol esterase SoxB  71.03 
 
 		 583 aa  856    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0141  5'-nucleotidase domain-containing protein  69.41 
 
 		 592 aa  795    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3671  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 580 aa  1184    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0816  5'-Nucleotidase domain protein  56.28 
 
 		 586 aa  682    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24833  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3048  5'-nucleotidase domain-containing protein  60.36 
 
 		 578 aa  685    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3253  sulfur oxidation signal peptide protein  57.36 
 
 		 572 aa  625  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3417  sulfate thiol esterase SoxB  54.34 
 
 		 574 aa  613  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3128  sulfate thiol esterase SoxB  53.82 
 
 		 573 aa  611  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3451  5'-Nucleotidase domain protein  55.12 
 
 		 573 aa  610  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0807  5'-nucleotidase domain-containing protein  52.88 
 
 		 576 aa  609  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3249  sulfate thiol esterase SoxB  54.47 
 
 		 573 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2279  sulfate thiol esterase SoxB  57.3 
 
 		 571 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1032  5'-Nucleotidase domain protein  52.03 
 
 		 576 aa  607  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.556642  normal  0.811589 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3123  5'-Nucleotidase domain protein  55.29 
 
 		 573 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2625  sulfate thiol esterase SoxB  54.27 
 
 		 574 aa  600  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.561369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0563  sulfate thiol esterase SoxB  52.39 
 
 		 610 aa  595  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000246299  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1596  5'-Nucleotidase domain protein  56.58 
 
 		 570 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1672  5'-Nucleotidase domain protein  56.4 
 
 		 571 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3778  5'-nucleotidase domain-containing protein  52.87 
 
 		 580 aa  594  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2432  sulfate thiol esterase SoxB  54.72 
 
 		 575 aa  591  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1549  Sulfate thiol esterase  47.54 
 
 		 636 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229205  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1905  sulfate thiol esterase SoxB  49.65 
 
 		 565 aa  577  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1916  5'-Nucleotidase domain protein  46.42 
 
 		 600 aa  568  1e-161  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1150  5'-Nucleotidase domain protein  49 
 
 		 577 aa  561  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000459069 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4154  5'-nucleotidase domain-containing protein  48.29 
 
 		 564 aa  534  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  50.92 
 
 		 559 aa  525  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3675  sulfate thiol esterase SoxB  50.87 
 
 		 553 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0941118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1519  5'-nucleotidase domain-containing protein  50.44 
 
 		 563 aa  524  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.661634 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0627  5'-Nucleotidase domain protein  48.2 
 
 		 603 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.367803 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2223  5'-Nucleotidase domain protein  46.41 
 
 		 596 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3914  hypothetical protein  45.96 
 
 		 563 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4369  twin-arginine translocation pathway signal  46.36 
 
 		 578 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4958  5'-Nucleotidase domain protein  47.42 
 
 		 565 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416285  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  46.03 
 
 		 565 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  46.56 
 
 		 564 aa  491  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1939  5'-nucleotidase domain-containing protein  46.11 
 
 		 581 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  40.07 
 
 		 577 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0264  sulfate thiol esterase SoxB  39.08 
 
 		 587 aa  443  1e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000260669  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2861  5'-Nucleotidase domain-containing protein  39.93 
 
 		 568 aa  414  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1467  5'-Nucleotidase domain protein  36.21 
 
 		 579 aa  402  1e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00451887  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3451  hypothetical protein  39.78 
 
 		 572 aa  376  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  34.43 
 
 		 481 aa  229  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  33.41 
 
 		 482 aa  217  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.59 
 
 		 479 aa  200  7e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11803  5'-nucleotidase  30.09 
 
 		 552 aa  184  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1621  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  29.8 
 
 		 577 aa  151  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1292  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  25.88 
 
 		 595 aa  150  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.519034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  27.96 
 
 		 504 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2012  putative esterase  30.07 
 
 		 713 aa  145  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.28 
 
 		 508 aa  138  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1085  lipoprotein UxpA  28.54 
 
 		 546 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  28.21 
 
 		 505 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  28.35 
 
 		 520 aa  123  9e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  27.95 
 
 		 638 aa  122  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.38 
 
 		 607 aa  120  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4182  lipoprotein UxpA  25.77 
 
 		 546 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1041  lipoprotein UxpA  27.82 
 
 		 546 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  26.21 
 
 		 659 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  26.29 
 
 		 523 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  26 
 
 		 657 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.57 
 
 		 533 aa  116  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1044  lipoprotein UxpA  26.94 
 
 		 550 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0577127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.81 
 
 		 627 aa  113  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  28.94 
 
 		 512 aa  110  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  25.11 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3035  5'-Nucleotidase domain protein  24.61 
 
 		 594 aa  109  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  26.61 
 
 		 518 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  26.83 
 
 		 518 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  26.61 
 
 		 518 aa  107  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.61 
 
 		 518 aa  107  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.83 
 
 		 518 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.7 
 
 		 515 aa  106  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  28.84 
 
 		 523 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  24.89 
 
 		 530 aa  105  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.63 
 
 		 523 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.01 
 
 		 605 aa  103  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  26.93 
 
 		 520 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  26.93 
 
 		 520 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  26.93 
 
 		 523 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  26.72 
 
 		 558 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  24.3 
 
 		 1215 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.93 
 
 		 523 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  24.3 
 
 		 1202 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1038  metallophosphoesterase  28.7 
 
 		 638 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  28.68 
 
 		 520 aa  96.7  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  26.67 
 
 		 581 aa  96.3  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  26.61 
 
 		 517 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  23.16 
 
 		 516 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  28.23 
 
 		 547 aa  95.5  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.95 
 
 		 503 aa  94.7  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  27.89 
 
 		 504 aa  94.7  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  25 
 
 		 517 aa  92.8  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  25.31 
 
 		 526 aa  93.6  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  25.53 
 
 		 555 aa  92.8  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.53 
 
 		 601 aa  92.8  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  23.95 
 
 		 532 aa  90.9  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4645  5'-Nucleotidase domain protein  24.54 
 
 		 506 aa  90.5  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132836  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  25.05 
 
 		 527 aa  90.5  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.21 
 
 		 539 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.970271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>