More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1038 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1038  metallophosphoesterase  100 
 
 
638 aa  1280    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27161  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1174  metallophosphoesterase  30.93 
 
 
645 aa  268  2.9999999999999995e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00165263  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  27.56 
 
 
526 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  27.27 
 
 
663 aa  157  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  26.19 
 
 
659 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  26.54 
 
 
638 aa  147  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  25.24 
 
 
657 aa  146  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.13 
 
 
627 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.65 
 
 
1284 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  28.74 
 
 
504 aa  139  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  27.5 
 
 
529 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  27.26 
 
 
523 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.26 
 
 
523 aa  134  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.63 
 
 
508 aa  131  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.42 
 
 
601 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.77 
 
 
533 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  26.78 
 
 
532 aa  127  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.37 
 
 
605 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.59 
 
 
607 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4342  metallophosphoesterase  34.96 
 
 
313 aa  123  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.266194  normal  0.291471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0324  metallophosphoesterase  31.12 
 
 
313 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0297927  normal  0.111016 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  26.73 
 
 
619 aa  120  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  24.91 
 
 
555 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.64 
 
 
517 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2185  metallophosphoesterase  29.77 
 
 
315 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123783  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  25.31 
 
 
587 aa  119  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  29.48 
 
 
520 aa  118  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  26.82 
 
 
520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3473  metallophosphoesterase  30.15 
 
 
303 aa  117  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.590454  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  23.78 
 
 
504 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4357  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.92 
 
 
535 aa  114  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000122656  decreased coverage  0.0000528459 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  23.72 
 
 
558 aa  113  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1793  metallophosphoesterase  30.41 
 
 
302 aa  107  8e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  31.64 
 
 
581 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  25 
 
 
530 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5725  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.14 
 
 
672 aa  105  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.695831 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0854  5'-Nucleotidase domain protein  25.32 
 
 
619 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192901  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0825  5'-Nucleotidase domain protein  25.32 
 
 
619 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  26 
 
 
577 aa  104  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  22.12 
 
 
530 aa  104  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.94 
 
 
509 aa  103  8e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.37 
 
 
515 aa  103  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2772  putative 5'-nucleotidase  28 
 
 
664 aa  103  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000553351  hitchhiker  0.00604315 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  24.6 
 
 
556 aa  103  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4363  cell wall anchor domain-containing protein  27.78 
 
 
633 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  28.93 
 
 
547 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3048  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.43 
 
 
578 aa  102  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1253  metallophosphoesterase  30.82 
 
 
392 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00126646  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.13 
 
 
516 aa  102  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1753  UshA protein  24.75 
 
 
508 aa  102  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  26.29 
 
 
1202 aa  101  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  27.33 
 
 
512 aa  100  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4022  5'-nucleotidase  24.91 
 
 
641 aa  100  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.887399 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0816  5'-Nucleotidase domain protein  29.06 
 
 
586 aa  100  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  21.89 
 
 
529 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0692  sulfate thiol esterase SoxB  30.17 
 
 
583 aa  99.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  23.8 
 
 
518 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0692  5'-nucleotidase  24.95 
 
 
637 aa  99.4  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0157449 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  26.51 
 
 
1215 aa  99  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0357  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  25.23 
 
 
607 aa  98.6  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  24.25 
 
 
515 aa  98.2  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  23.8 
 
 
518 aa  97.8  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0670  5'-nucleotidase  29.29 
 
 
637 aa  97.8  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.785834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  21.02 
 
 
529 aa  97.4  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  23.8 
 
 
518 aa  97.4  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  23.8 
 
 
518 aa  97.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  21.89 
 
 
529 aa  97.1  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  21.89 
 
 
529 aa  97.1  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  21.89 
 
 
529 aa  96.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  21.89 
 
 
529 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  30.52 
 
 
564 aa  96.3  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  23.56 
 
 
518 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  23.84 
 
 
489 aa  95.5  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1751  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.23 
 
 
553 aa  95.9  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000978587  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  23.12 
 
 
523 aa  96.3  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1083  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.93 
 
 
549 aa  95.1  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000234705  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  22.93 
 
 
520 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  22.93 
 
 
520 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  21.47 
 
 
529 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  24.36 
 
 
523 aa  95.1  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.67 
 
 
503 aa  94.7  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  21.02 
 
 
529 aa  94.4  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  22.93 
 
 
523 aa  94.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  25.16 
 
 
1591 aa  94  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1027  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.61 
 
 
550 aa  94  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0023  cell wall anchor domain-containing protein  23.43 
 
 
772 aa  93.6  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0275377  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3032  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.12 
 
 
550 aa  93.6  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0023  cell wall anchor domain-containing protein  23.43 
 
 
772 aa  93.6  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.244704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  21.44 
 
 
529 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1916  5'-Nucleotidase domain protein  25.32 
 
 
600 aa  93.6  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3228  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.03 
 
 
549 aa  92.8  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00425735  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0223  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.38 
 
 
567 aa  92.8  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0264  sulfate thiol esterase SoxB  26.9 
 
 
587 aa  92.8  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000260669  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  26.91 
 
 
482 aa  92.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2625  sulfate thiol esterase SoxB  29.17 
 
 
574 aa  92.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.561369  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2309  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.79 
 
 
572 aa  92.8  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.897886  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1134  5'-nucleotidase  30.74 
 
 
625 aa  92  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00179734  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3671  twin-arginine translocation pathway signal  28.7 
 
 
580 aa  91.3  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  25.84 
 
 
1181 aa  91.3  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  21.05 
 
 
529 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>