More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3675 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3914  hypothetical protein  64.86 
 
 		 563 aa  754    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4369  twin-arginine translocation pathway signal  63.59 
 
 		 578 aa  757    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  64.76 
 
 		 565 aa  752    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1519  5'-nucleotidase domain-containing protein  63.72 
 
 		 563 aa  738    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.661634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  72.27 
 
 		 559 aa  832    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4154  5'-nucleotidase domain-containing protein  63.36 
 
 		 564 aa  741    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4958  5'-Nucleotidase domain protein  63.95 
 
 		 565 aa  753    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3675  sulfate thiol esterase SoxB  100 
 
 		 553 aa  1131    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0941118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  64.01 
 
 		 564 aa  751    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1905  sulfate thiol esterase SoxB  52.99 
 
 		 565 aa  612  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2279  sulfate thiol esterase SoxB  54.56 
 
 		 571 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1596  5'-Nucleotidase domain protein  54.76 
 
 		 570 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1672  5'-Nucleotidase domain protein  54.17 
 
 		 571 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3253  sulfur oxidation signal peptide protein  53.5 
 
 		 572 aa  561  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3451  5'-Nucleotidase domain protein  52.83 
 
 		 573 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2625  sulfate thiol esterase SoxB  52.31 
 
 		 574 aa  555  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.561369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3417  sulfate thiol esterase SoxB  51.42 
 
 		 574 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0563  sulfate thiol esterase SoxB  50.57 
 
 		 610 aa  549  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000246299  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3123  5'-Nucleotidase domain protein  52.83 
 
 		 573 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3249  sulfate thiol esterase SoxB  51.04 
 
 		 573 aa  544  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1150  5'-Nucleotidase domain protein  49.51 
 
 		 577 aa  539  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000459069 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3128  sulfate thiol esterase SoxB  48.82 
 
 		 573 aa  538  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1032  5'-Nucleotidase domain protein  48.27 
 
 		 576 aa  536  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.556642  normal  0.811589 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0807  5'-nucleotidase domain-containing protein  49.26 
 
 		 576 aa  537  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0627  5'-Nucleotidase domain protein  47.49 
 
 		 603 aa  528  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.367803 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2432  sulfate thiol esterase SoxB  50 
 
 		 575 aa  529  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0141  5'-nucleotidase domain-containing protein  49.01 
 
 		 592 aa  525  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3778  5'-nucleotidase domain-containing protein  47.52 
 
 		 580 aa  523  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2223  5'-Nucleotidase domain protein  48.87 
 
 		 596 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0816  5'-Nucleotidase domain protein  46.31 
 
 		 586 aa  509  1e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24833  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3671  twin-arginine translocation pathway signal  50.87 
 
 		 580 aa  509  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0692  sulfate thiol esterase SoxB  49.52 
 
 		 583 aa  508  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1939  5'-nucleotidase domain-containing protein  45.75 
 
 		 581 aa  501  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1927  twin-arginine translocation pathway signal  45.14 
 
 		 585 aa  498  1e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1916  5'-Nucleotidase domain protein  42.66 
 
 		 600 aa  489  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  43.4 
 
 		 577 aa  488  1e-136  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3048  5'-nucleotidase domain-containing protein  46.93 
 
 		 578 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0264  sulfate thiol esterase SoxB  40.41 
 
 		 587 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000260669  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2861  5'-Nucleotidase domain-containing protein  41.83 
 
 		 568 aa  420  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1549  Sulfate thiol esterase  38.95 
 
 		 636 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229205  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1467  5'-Nucleotidase domain protein  37.01 
 
 		 579 aa  399  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00451887  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3451  hypothetical protein  37.13 
 
 		 572 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  32.47 
 
 		 482 aa  231  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  33.49 
 
 		 481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.88 
 
 		 479 aa  211  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  26.96 
 
 		 505 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  25.57 
 
 		 504 aa  143  9e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3035  5'-Nucleotidase domain protein  26.29 
 
 		 594 aa  136  8e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1292  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  25.23 
 
 		 595 aa  136  8e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.519034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.27 
 
 		 508 aa  133  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1621  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  26.08 
 
 		 577 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11803  5'-nucleotidase  25.81 
 
 		 552 aa  127  6e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  27.52 
 
 		 516 aa  126  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1472  5'-nucleotidase  27.57 
 
 		 505 aa  124  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633021  normal  0.092078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1750  5'-nucleotidase  27.55 
 
 		 500 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.398789 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  28.05 
 
 		 520 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  28.05 
 
 		 520 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  28.05 
 
 		 523 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4645  5'-Nucleotidase domain protein  27.82 
 
 		 506 aa  118  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132836  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  26.27 
 
 		 523 aa  118  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.5 
 
 		 523 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.18 
 
 		 523 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1472  5'-nucleotidase  26.87 
 
 		 517 aa  117  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.150971 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  27.11 
 
 		 518 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2012  putative esterase  27.18 
 
 		 713 aa  115  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1085  lipoprotein UxpA  24.86 
 
 		 546 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  26.91 
 
 		 518 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  26.91 
 
 		 518 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  27.11 
 
 		 518 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  27.73 
 
 		 523 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.92 
 
 		 517 aa  113  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.71 
 
 		 518 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.8 
 
 		 539 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  26.3 
 
 		 530 aa  111  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1041  lipoprotein UxpA  24.41 
 
 		 546 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  27.63 
 
 		 520 aa  107  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1044  lipoprotein UxpA  24.68 
 
 		 550 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0577127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2582  5'-nucleotidase domain-containing protein  26 
 
 		 505 aa  106  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270196  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.8 
 
 		 607 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4182  lipoprotein UxpA  24.76 
 
 		 546 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  27.11 
 
 		 517 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  23.75 
 
 		 489 aa  103  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  26.69 
 
 		 515 aa  102  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  26.2 
 
 		 520 aa  101  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0171  5'-nucleotidase family protein  26.52 
 
 		 590 aa  100  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  24.95 
 
 		 657 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  25.47 
 
 		 526 aa  100  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  26.51 
 
 		 638 aa  100  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  25.75 
 
 		 659 aa  100  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.59 
 
 		 627 aa  98.2  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  26.89 
 
 		 547 aa  98.2  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.94 
 
 		 515 aa  98.6  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  25.81 
 
 		 504 aa  97.8  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  23.31 
 
 		 532 aa  97.4  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.73 
 
 		 503 aa  97.4  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  25 
 
 		 533 aa  95.5  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  24.02 
 
 		 527 aa  94.7  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3374  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.06 
 
 		 527 aa  94.4  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.231702  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.94 
 
 		 605 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1253  metallophosphoesterase  27.84 
 
 		 392 aa  94  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00126646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>