More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0513 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0264  sulfate thiol esterase SoxB  57.83 
 
 
587 aa  717    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000260669  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  100 
 
 
577 aa  1189    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1467  5'-Nucleotidase domain protein  51.74 
 
 
579 aa  609  1e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00451887  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2861  5'-Nucleotidase domain-containing protein  46.02 
 
 
568 aa  540  9.999999999999999e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3451  hypothetical protein  45.23 
 
 
572 aa  513  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3249  sulfate thiol esterase SoxB  45.97 
 
 
573 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2279  sulfate thiol esterase SoxB  47.24 
 
 
571 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1672  5'-Nucleotidase domain protein  46.67 
 
 
571 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1596  5'-Nucleotidase domain protein  46.86 
 
 
570 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3128  sulfate thiol esterase SoxB  45.21 
 
 
573 aa  502  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304524  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3417  sulfate thiol esterase SoxB  46.48 
 
 
574 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1519  5'-nucleotidase domain-containing protein  45.31 
 
 
563 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.661634 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1150  5'-Nucleotidase domain protein  41.88 
 
 
577 aa  498  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000459069 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4154  5'-nucleotidase domain-containing protein  45.35 
 
 
564 aa  501  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  44.58 
 
 
559 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3253  sulfur oxidation signal peptide protein  45.01 
 
 
572 aa  491  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0807  5'-nucleotidase domain-containing protein  46.42 
 
 
576 aa  491  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1032  5'-Nucleotidase domain protein  44.92 
 
 
576 aa  491  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.556642  normal  0.811589 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0563  sulfate thiol esterase SoxB  43.11 
 
 
610 aa  489  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000246299  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3914  hypothetical protein  42.86 
 
 
563 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1905  sulfate thiol esterase SoxB  43.29 
 
 
565 aa  491  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3675  sulfate thiol esterase SoxB  43.4 
 
 
553 aa  488  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0941118  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3451  5'-Nucleotidase domain protein  44.77 
 
 
573 aa  488  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  41.9 
 
 
564 aa  483  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1916  5'-Nucleotidase domain protein  44.55 
 
 
600 aa  484  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4958  5'-Nucleotidase domain protein  46.39 
 
 
565 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416285  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2625  sulfate thiol esterase SoxB  43.36 
 
 
574 aa  479  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.561369  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  46.2 
 
 
565 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3123  5'-Nucleotidase domain protein  44.77 
 
 
573 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3778  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.68 
 
 
580 aa  479  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4369  twin-arginine translocation pathway signal  42.68 
 
 
578 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2223  5'-Nucleotidase domain protein  42.47 
 
 
596 aa  477  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2432  sulfate thiol esterase SoxB  44.32 
 
 
575 aa  476  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1939  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.36 
 
 
581 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1927  twin-arginine translocation pathway signal  41.01 
 
 
585 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0692  sulfate thiol esterase SoxB  41.71 
 
 
583 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0141  5'-nucleotidase domain-containing protein  41.81 
 
 
592 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0627  5'-Nucleotidase domain protein  42.94 
 
 
603 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.367803 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3048  5'-nucleotidase domain-containing protein  41.94 
 
 
578 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0816  5'-Nucleotidase domain protein  39.46 
 
 
586 aa  442  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24833  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3671  twin-arginine translocation pathway signal  40.07 
 
 
580 aa  445  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1549  Sulfate thiol esterase  34.54 
 
 
636 aa  386  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229205  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  34.39 
 
 
482 aa  278  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  35.94 
 
 
481 aa  265  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.12 
 
 
479 aa  259  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  29.64 
 
 
505 aa  186  8e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1621  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  28.72 
 
 
577 aa  174  5.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637652  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11803  5'-nucleotidase  28.22 
 
 
552 aa  173  7.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.28 
 
 
508 aa  171  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  29.87 
 
 
504 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1292  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  27.64 
 
 
595 aa  167  5e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.519034  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  30.12 
 
 
530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  29.57 
 
 
489 aa  160  9e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3035  5'-Nucleotidase domain protein  25.74 
 
 
594 aa  157  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  29.81 
 
 
516 aa  153  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.13 
 
 
517 aa  152  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  29.66 
 
 
515 aa  146  9e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  29.03 
 
 
523 aa  140  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  28.66 
 
 
520 aa  139  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.54 
 
 
627 aa  133  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  26.28 
 
 
518 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  26.08 
 
 
518 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  26.08 
 
 
518 aa  132  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  28.18 
 
 
547 aa  130  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.28 
 
 
518 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  25.87 
 
 
518 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  26.27 
 
 
532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  29.27 
 
 
508 aa  128  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  29.27 
 
 
508 aa  128  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  26.68 
 
 
517 aa  126  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  26.34 
 
 
657 aa  126  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  26.18 
 
 
539 aa  126  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.26 
 
 
555 aa  126  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  26.9 
 
 
520 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  26.9 
 
 
520 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.77 
 
 
503 aa  125  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  26.9 
 
 
523 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.9 
 
 
523 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.49 
 
 
607 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2012  putative esterase  24.66 
 
 
713 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.81 
 
 
509 aa  121  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4363  cell wall anchor domain-containing protein  25.53 
 
 
633 aa  120  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4182  lipoprotein UxpA  24.75 
 
 
546 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1085  lipoprotein UxpA  24.94 
 
 
546 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  25.72 
 
 
659 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1041  lipoprotein UxpA  24.06 
 
 
546 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.89 
 
 
1284 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  31.84 
 
 
515 aa  117  6e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4241  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  26.21 
 
 
608 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  25 
 
 
638 aa  115  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  25.16 
 
 
529 aa  115  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2582  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.54 
 
 
505 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270196  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.79 
 
 
533 aa  114  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.75 
 
 
523 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  24.95 
 
 
529 aa  113  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  25.75 
 
 
523 aa  113  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  27.09 
 
 
504 aa  113  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.56 
 
 
530 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  26.1 
 
 
558 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  23.77 
 
 
529 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>