More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2223 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1672  5'-Nucleotidase domain protein  55.82 
 
 
571 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3253  sulfur oxidation signal peptide protein  56.66 
 
 
572 aa  671    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1032  5'-Nucleotidase domain protein  58.25 
 
 
576 aa  709    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.556642  normal  0.811589 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0807  5'-nucleotidase domain-containing protein  57.74 
 
 
576 aa  698    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2223  5'-Nucleotidase domain protein  100 
 
 
596 aa  1234    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3451  5'-Nucleotidase domain protein  56.04 
 
 
573 aa  664    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3128  sulfate thiol esterase SoxB  60.44 
 
 
573 aa  724    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304524  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3249  sulfate thiol esterase SoxB  56.76 
 
 
573 aa  684    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0563  sulfate thiol esterase SoxB  61.29 
 
 
610 aa  722    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000246299  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1916  5'-Nucleotidase domain protein  58.1 
 
 
600 aa  724    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3123  5'-Nucleotidase domain protein  55.87 
 
 
573 aa  651    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0627  5'-Nucleotidase domain protein  68.34 
 
 
603 aa  822    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.367803 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2279  sulfate thiol esterase SoxB  55.57 
 
 
571 aa  657    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1596  5'-Nucleotidase domain protein  55.74 
 
 
570 aa  658    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2625  sulfate thiol esterase SoxB  57.07 
 
 
574 aa  677    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.561369  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3417  sulfate thiol esterase SoxB  57.26 
 
 
574 aa  690    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1150  5'-Nucleotidase domain protein  54.01 
 
 
577 aa  675    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000459069 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2432  sulfate thiol esterase SoxB  58.85 
 
 
575 aa  689    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3778  5'-nucleotidase domain-containing protein  57.98 
 
 
580 aa  692    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1939  5'-nucleotidase domain-containing protein  51.08 
 
 
581 aa  593  1e-168  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0816  5'-Nucleotidase domain protein  50.74 
 
 
586 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24833  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1927  twin-arginine translocation pathway signal  49.84 
 
 
585 aa  580  1e-164  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3914  hypothetical protein  50.09 
 
 
563 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1905  sulfate thiol esterase SoxB  48.71 
 
 
565 aa  563  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1549  Sulfate thiol esterase  46.33 
 
 
636 aa  554  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229205  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4154  5'-nucleotidase domain-containing protein  48.98 
 
 
564 aa  553  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  50.43 
 
 
564 aa  552  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3675  sulfate thiol esterase SoxB  49.91 
 
 
553 aa  534  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0941118  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  49.04 
 
 
559 aa  533  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3671  twin-arginine translocation pathway signal  47.15 
 
 
580 aa  530  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1519  5'-nucleotidase domain-containing protein  48.03 
 
 
563 aa  529  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.661634 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4958  5'-Nucleotidase domain protein  47.1 
 
 
565 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0692  sulfate thiol esterase SoxB  45.41 
 
 
583 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4369  twin-arginine translocation pathway signal  45.88 
 
 
578 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  46.98 
 
 
565 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0141  5'-nucleotidase domain-containing protein  47.78 
 
 
592 aa  504  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3048  5'-nucleotidase domain-containing protein  45.72 
 
 
578 aa  497  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  43.24 
 
 
577 aa  498  1e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0264  sulfate thiol esterase SoxB  37.16 
 
 
587 aa  414  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000260669  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2861  5'-Nucleotidase domain-containing protein  38.38 
 
 
568 aa  388  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1467  5'-Nucleotidase domain protein  38.11 
 
 
579 aa  380  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00451887  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3451  hypothetical protein  35.35 
 
 
572 aa  365  2e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  29.81 
 
 
482 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.02 
 
 
479 aa  183  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  27.63 
 
 
481 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1292  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  26.96 
 
 
595 aa  160  7e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.519034  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  29 
 
 
504 aa  157  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  26.16 
 
 
505 aa  137  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11803  5'-nucleotidase  25.74 
 
 
552 aa  135  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3035  5'-Nucleotidase domain protein  25.23 
 
 
594 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1621  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  23.09 
 
 
577 aa  132  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637652  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.6 
 
 
508 aa  129  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.57 
 
 
515 aa  124  7e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  25.53 
 
 
489 aa  121  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4182  lipoprotein UxpA  23.81 
 
 
546 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  28.3 
 
 
530 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1041  lipoprotein UxpA  24.17 
 
 
546 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2012  putative esterase  24.94 
 
 
713 aa  108  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  25.51 
 
 
520 aa  106  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.79 
 
 
508 aa  103  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.79 
 
 
508 aa  103  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1085  lipoprotein UxpA  23.81 
 
 
546 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  25.97 
 
 
520 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  25.97 
 
 
520 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  25.97 
 
 
523 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  25.97 
 
 
523 aa  101  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1044  lipoprotein UxpA  23.14 
 
 
550 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0577127  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.69 
 
 
555 aa  99  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.49 
 
 
517 aa  97.4  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  23.8 
 
 
523 aa  96.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  25.41 
 
 
504 aa  95.9  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4363  cell wall anchor domain-containing protein  23.33 
 
 
633 aa  93.6  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  23.83 
 
 
532 aa  92.8  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  25.11 
 
 
518 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.36 
 
 
503 aa  91.7  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27420  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  31.25 
 
 
826 aa  91.3  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  24.89 
 
 
518 aa  91.3  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  24.89 
 
 
518 aa  90.9  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  26.15 
 
 
515 aa  90.5  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  24.67 
 
 
518 aa  90.5  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  24.89 
 
 
518 aa  89.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  29 
 
 
581 aa  87.8  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.71 
 
 
1284 aa  86.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.53 
 
 
509 aa  86.7  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  25.91 
 
 
1215 aa  84.7  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0402  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.66 
 
 
689 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0127264  normal  0.0127974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  23.72 
 
 
516 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  25.91 
 
 
1202 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0171  5'-nucleotidase family protein  24.55 
 
 
590 aa  82  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  22.59 
 
 
530 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  24.08 
 
 
558 aa  80.9  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.31 
 
 
533 aa  80.5  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2951  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.34 
 
 
686 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.84 
 
 
523 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2813  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.62 
 
 
686 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  22.62 
 
 
517 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2731  hypothetical protein  24.33 
 
 
575 aa  79  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  24.34 
 
 
560 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  25.73 
 
 
547 aa  79  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.11 
 
 
627 aa  78.2  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>