288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1549 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1549  Sulfate thiol esterase  100 
 
 
636 aa  1324    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229205  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0816  5'-Nucleotidase domain protein  50.56 
 
 
586 aa  636    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24833  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1927  twin-arginine translocation pathway signal  49.37 
 
 
585 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0563  sulfate thiol esterase SoxB  50.31 
 
 
610 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000246299  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3128  sulfate thiol esterase SoxB  50.55 
 
 
573 aa  597  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304524  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2625  sulfate thiol esterase SoxB  49.68 
 
 
574 aa  579  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.561369  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3671  twin-arginine translocation pathway signal  47.06 
 
 
580 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3249  sulfate thiol esterase SoxB  49.13 
 
 
573 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1032  5'-Nucleotidase domain protein  48.58 
 
 
576 aa  568  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.556642  normal  0.811589 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3778  5'-nucleotidase domain-containing protein  47.16 
 
 
580 aa  559  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3417  sulfate thiol esterase SoxB  47.87 
 
 
574 aa  560  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0692  sulfate thiol esterase SoxB  45.38 
 
 
583 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2432  sulfate thiol esterase SoxB  47.16 
 
 
575 aa  552  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0807  5'-nucleotidase domain-containing protein  47.4 
 
 
576 aa  554  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0627  5'-Nucleotidase domain protein  47.54 
 
 
603 aa  551  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.367803 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1150  5'-Nucleotidase domain protein  45.51 
 
 
577 aa  548  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000459069 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0141  5'-nucleotidase domain-containing protein  46.7 
 
 
592 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2279  sulfate thiol esterase SoxB  46.68 
 
 
571 aa  545  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3253  sulfur oxidation signal peptide protein  46.13 
 
 
572 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1672  5'-Nucleotidase domain protein  46.13 
 
 
571 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1596  5'-Nucleotidase domain protein  46.36 
 
 
570 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3451  5'-Nucleotidase domain protein  45.91 
 
 
573 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1916  5'-Nucleotidase domain protein  44.25 
 
 
600 aa  533  1e-150  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3123  5'-Nucleotidase domain protein  46.07 
 
 
573 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2223  5'-Nucleotidase domain protein  45.78 
 
 
596 aa  523  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3048  5'-nucleotidase domain-containing protein  44.07 
 
 
578 aa  523  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1905  sulfate thiol esterase SoxB  41.63 
 
 
565 aa  476  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1939  5'-nucleotidase domain-containing protein  41.26 
 
 
581 aa  465  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4154  5'-nucleotidase domain-containing protein  39.9 
 
 
564 aa  444  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3914  hypothetical protein  41.45 
 
 
563 aa  445  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1519  5'-nucleotidase domain-containing protein  39.38 
 
 
563 aa  428  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.661634 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  40 
 
 
564 aa  421  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3675  sulfate thiol esterase SoxB  38.95 
 
 
553 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0941118  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  38.37 
 
 
559 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4958  5'-Nucleotidase domain protein  38.29 
 
 
565 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416285  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4369  twin-arginine translocation pathway signal  36.82 
 
 
578 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  36.65 
 
 
565 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  34.54 
 
 
577 aa  386  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0264  sulfate thiol esterase SoxB  34.91 
 
 
587 aa  385  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000260669  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1467  5'-Nucleotidase domain protein  31.97 
 
 
579 aa  322  1.9999999999999998e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00451887  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2861  5'-Nucleotidase domain-containing protein  31.42 
 
 
568 aa  302  1e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3451  hypothetical protein  31.15 
 
 
572 aa  295  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  26.48 
 
 
481 aa  160  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  27.29 
 
 
482 aa  153  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.43 
 
 
479 aa  139  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11803  5'-nucleotidase  24.43 
 
 
552 aa  135  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1621  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  27.64 
 
 
577 aa  128  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637652  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  26.31 
 
 
504 aa  118  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1292  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  23.59 
 
 
595 aa  111  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.519034  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4182  lipoprotein UxpA  23.26 
 
 
546 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1041  lipoprotein UxpA  23.83 
 
 
546 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1085  lipoprotein UxpA  23.17 
 
 
546 aa  105  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2012  putative esterase  24.78 
 
 
713 aa  104  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.32 
 
 
508 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1044  lipoprotein UxpA  22.74 
 
 
550 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0577127  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  23.99 
 
 
659 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  24.2 
 
 
1215 aa  100  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  25.19 
 
 
657 aa  100  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.18 
 
 
627 aa  99.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  25.52 
 
 
489 aa  98.2  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  24.34 
 
 
1202 aa  97.8  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  24.06 
 
 
523 aa  97.4  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3035  5'-Nucleotidase domain protein  22.63 
 
 
594 aa  95.5  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  24.17 
 
 
638 aa  94  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  22.39 
 
 
607 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  24.82 
 
 
530 aa  91.7  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.65 
 
 
515 aa  89  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.46 
 
 
533 aa  87.8  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  22.53 
 
 
505 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  22.35 
 
 
605 aa  84.7  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.36 
 
 
601 aa  84.3  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  23 
 
 
663 aa  83.6  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1926  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.05 
 
 
568 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  24.36 
 
 
520 aa  82.8  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  23.41 
 
 
532 aa  79  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  27.24 
 
 
504 aa  78.2  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  23.46 
 
 
581 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  24.18 
 
 
555 aa  77.4  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  26.15 
 
 
520 aa  77.4  0.0000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3228  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.06 
 
 
549 aa  76.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00425735  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.34 
 
 
523 aa  75.5  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  27.68 
 
 
523 aa  75.1  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0572  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.94 
 
 
550 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0524  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.94 
 
 
550 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.74 
 
 
1284 aa  74.3  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0223  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.9 
 
 
567 aa  73.6  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  24.64 
 
 
558 aa  73.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  22.8 
 
 
518 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  22.6 
 
 
518 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  22.6 
 
 
518 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00431  UDP-sugar hydrolase  25.6 
 
 
550 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.373208  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3130  5'-Nucleotidase domain protein  25.6 
 
 
550 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.520535  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00436  hypothetical protein  25.6 
 
 
550 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.335822  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3136  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.6 
 
 
550 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.161033  unclonable  0.0000000215982 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0519  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.6 
 
 
550 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0557  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.6 
 
 
550 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  24.29 
 
 
529 aa  71.6  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08461  metallophosphoesterase  26.3 
 
 
503 aa  71.2  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1252  5'-nucleotidase-like protein  23.42 
 
 
580 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2669  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.86 
 
 
569 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000803412  normal  0.0151204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>