More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0264 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  57.83 
 
 
577 aa  717    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0264  sulfate thiol esterase SoxB  100 
 
 
587 aa  1212    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000260669  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1467  5'-Nucleotidase domain protein  46.11 
 
 
579 aa  564  1.0000000000000001e-159  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00451887  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2861  5'-Nucleotidase domain-containing protein  40.24 
 
 
568 aa  479  1e-134  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1905  sulfate thiol esterase SoxB  40.56 
 
 
565 aa  481  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  40.66 
 
 
564 aa  468  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  41.84 
 
 
559 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3451  hypothetical protein  38.73 
 
 
572 aa  449  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3914  hypothetical protein  40.24 
 
 
563 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4154  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.55 
 
 
564 aa  451  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4369  twin-arginine translocation pathway signal  40.03 
 
 
578 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3675  sulfate thiol esterase SoxB  40.41 
 
 
553 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0941118  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3417  sulfate thiol esterase SoxB  39.86 
 
 
574 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1519  5'-nucleotidase domain-containing protein  39.16 
 
 
563 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.661634 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1596  5'-Nucleotidase domain protein  38.73 
 
 
570 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3128  sulfate thiol esterase SoxB  39.89 
 
 
573 aa  439  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304524  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3249  sulfate thiol esterase SoxB  39.35 
 
 
573 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0563  sulfate thiol esterase SoxB  39.3 
 
 
610 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000246299  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2279  sulfate thiol esterase SoxB  38.73 
 
 
571 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1672  5'-Nucleotidase domain protein  38.38 
 
 
571 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0807  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.57 
 
 
576 aa  441  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4958  5'-Nucleotidase domain protein  41.11 
 
 
565 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416285  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3451  5'-Nucleotidase domain protein  40.4 
 
 
573 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2625  sulfate thiol esterase SoxB  39.38 
 
 
574 aa  436  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.561369  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1032  5'-Nucleotidase domain protein  39.96 
 
 
576 aa  437  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.556642  normal  0.811589 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3123  5'-Nucleotidase domain protein  40.94 
 
 
573 aa  438  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3253  sulfur oxidation signal peptide protein  39.82 
 
 
572 aa  435  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0692  sulfate thiol esterase SoxB  38.03 
 
 
583 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2432  sulfate thiol esterase SoxB  38.87 
 
 
575 aa  435  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1916  5'-Nucleotidase domain protein  38.23 
 
 
600 aa  430  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  38.37 
 
 
565 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3671  twin-arginine translocation pathway signal  39.08 
 
 
580 aa  429  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3778  5'-nucleotidase domain-containing protein  39.12 
 
 
580 aa  425  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0816  5'-Nucleotidase domain protein  37.5 
 
 
586 aa  425  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24833  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1927  twin-arginine translocation pathway signal  36.88 
 
 
585 aa  419  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3048  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.95 
 
 
578 aa  419  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1939  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.12 
 
 
581 aa  419  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0141  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.41 
 
 
592 aa  415  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1150  5'-Nucleotidase domain protein  35.37 
 
 
577 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000459069 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2223  5'-Nucleotidase domain protein  36.49 
 
 
596 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0627  5'-Nucleotidase domain protein  36.1 
 
 
603 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.367803 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1549  Sulfate thiol esterase  34.91 
 
 
636 aa  385  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229205  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  31.57 
 
 
482 aa  257  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.55 
 
 
479 aa  240  6.999999999999999e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  33.18 
 
 
481 aa  238  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11803  5'-nucleotidase  24.91 
 
 
552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  26.69 
 
 
505 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  30.5 
 
 
530 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1292  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  26.24 
 
 
595 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.519034  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1621  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  26.43 
 
 
577 aa  144  6e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637652  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  27.47 
 
 
504 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  29.56 
 
 
523 aa  130  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4182  lipoprotein UxpA  26.17 
 
 
546 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3035  5'-Nucleotidase domain protein  23.1 
 
 
594 aa  123  8e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1041  lipoprotein UxpA  24.75 
 
 
546 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2012  putative esterase  25.63 
 
 
713 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  26.48 
 
 
520 aa  120  7.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1085  lipoprotein UxpA  23.93 
 
 
546 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.76 
 
 
515 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.24 
 
 
517 aa  119  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  27.2 
 
 
532 aa  119  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1044  lipoprotein UxpA  23.84 
 
 
550 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0577127  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  27.71 
 
 
523 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.58 
 
 
508 aa  117  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.85 
 
 
503 aa  116  8.999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  29.87 
 
 
516 aa  114  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.97 
 
 
533 aa  113  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.87 
 
 
509 aa  113  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  28.95 
 
 
508 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  26.86 
 
 
489 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  28.95 
 
 
508 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.48 
 
 
523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.36 
 
 
523 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  26.36 
 
 
520 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  26.36 
 
 
520 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  26.14 
 
 
523 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  25.95 
 
 
558 aa  107  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  27.05 
 
 
555 aa  107  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0023  cell wall anchor domain-containing protein  26.84 
 
 
772 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0275377  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  27.33 
 
 
539 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0023  cell wall anchor domain-containing protein  26.84 
 
 
772 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.244704  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  23.67 
 
 
547 aa  104  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  27.79 
 
 
518 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.8 
 
 
627 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  26.9 
 
 
638 aa  102  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  27.56 
 
 
518 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  27.56 
 
 
518 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  27.56 
 
 
518 aa  99.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  27.56 
 
 
518 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  26.42 
 
 
526 aa  98.6  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  24.63 
 
 
659 aa  97.1  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  28.77 
 
 
504 aa  96.7  9e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  27.47 
 
 
515 aa  96.3  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  24.75 
 
 
587 aa  96.3  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  25.17 
 
 
657 aa  95.1  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1207  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.77 
 
 
596 aa  94.7  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  25.43 
 
 
663 aa  94.4  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1038  metallophosphoesterase  26.9 
 
 
638 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27161  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4241  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  22.74 
 
 
608 aa  92.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  27.91 
 
 
619 aa  92  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>