More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0816 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0141  5'-nucleotidase domain-containing protein  55.76 
 
 
592 aa  645    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3128  sulfate thiol esterase SoxB  54.25 
 
 
573 aa  637    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304524  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1927  twin-arginine translocation pathway signal  80 
 
 
585 aa  1004    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1549  Sulfate thiol esterase  50.56 
 
 
636 aa  636    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229205  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3671  twin-arginine translocation pathway signal  56.28 
 
 
580 aa  672    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0816  5'-Nucleotidase domain protein  100 
 
 
586 aa  1209    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.24833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0692  sulfate thiol esterase SoxB  54.56 
 
 
583 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0807  5'-nucleotidase domain-containing protein  54.65 
 
 
576 aa  633  1e-180  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1032  5'-Nucleotidase domain protein  53.81 
 
 
576 aa  630  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.556642  normal  0.811589 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3249  sulfate thiol esterase SoxB  55.54 
 
 
573 aa  631  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0563  sulfate thiol esterase SoxB  53.5 
 
 
610 aa  620  1e-176  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000246299  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3417  sulfate thiol esterase SoxB  53.49 
 
 
574 aa  619  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2625  sulfate thiol esterase SoxB  53.9 
 
 
574 aa  617  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.561369  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3253  sulfur oxidation signal peptide protein  53.81 
 
 
572 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1596  5'-Nucleotidase domain protein  54.1 
 
 
570 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3778  5'-nucleotidase domain-containing protein  52.79 
 
 
580 aa  602  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3048  5'-nucleotidase domain-containing protein  52.99 
 
 
578 aa  600  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1672  5'-Nucleotidase domain protein  53.41 
 
 
571 aa  598  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3451  5'-Nucleotidase domain protein  53.57 
 
 
573 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3123  5'-Nucleotidase domain protein  54.25 
 
 
573 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2279  sulfate thiol esterase SoxB  52.9 
 
 
571 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2432  sulfate thiol esterase SoxB  53.31 
 
 
575 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1150  5'-Nucleotidase domain protein  48.99 
 
 
577 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000459069 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1905  sulfate thiol esterase SoxB  50.26 
 
 
565 aa  576  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0627  5'-Nucleotidase domain protein  51.25 
 
 
603 aa  560  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.367803 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1916  5'-Nucleotidase domain protein  46.17 
 
 
600 aa  556  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2223  5'-Nucleotidase domain protein  49.92 
 
 
596 aa  551  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  47.91 
 
 
559 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3914  hypothetical protein  46.49 
 
 
563 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3675  sulfate thiol esterase SoxB  46.31 
 
 
553 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0941118  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4369  twin-arginine translocation pathway signal  44.91 
 
 
578 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4154  5'-nucleotidase domain-containing protein  46.33 
 
 
564 aa  504  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4958  5'-Nucleotidase domain protein  44.93 
 
 
565 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416285  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1519  5'-nucleotidase domain-containing protein  46.34 
 
 
563 aa  498  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.661634 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  44.39 
 
 
565 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  46.06 
 
 
564 aa  491  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1939  5'-nucleotidase domain-containing protein  44.31 
 
 
581 aa  490  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  39.46 
 
 
577 aa  442  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0264  sulfate thiol esterase SoxB  37.5 
 
 
587 aa  425  1e-117  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000260669  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1467  5'-Nucleotidase domain protein  35.88 
 
 
579 aa  397  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00451887  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2861  5'-Nucleotidase domain-containing protein  36.14 
 
 
568 aa  363  5.0000000000000005e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3451  hypothetical protein  37.19 
 
 
572 aa  359  7e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1173  5'-Nucleotidase domain protein  33.25 
 
 
482 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  30.82 
 
 
481 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.25 
 
 
479 aa  181  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11803  5'-nucleotidase  28.05 
 
 
552 aa  155  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4182  lipoprotein UxpA  26.7 
 
 
546 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1292  putative 5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  26.13 
 
 
595 aa  143  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.519034  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2012  putative esterase  26.54 
 
 
713 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  25.52 
 
 
505 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1041  lipoprotein UxpA  26.09 
 
 
546 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1085  lipoprotein UxpA  25.59 
 
 
546 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  29.37 
 
 
504 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1621  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase  26.71 
 
 
577 aa  124  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.637652  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1044  lipoprotein UxpA  24.92 
 
 
550 aa  124  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0577127  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3035  5'-Nucleotidase domain protein  24.91 
 
 
594 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.05 
 
 
508 aa  113  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  26.68 
 
 
489 aa  103  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  24.68 
 
 
530 aa  101  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1038  metallophosphoesterase  29.06 
 
 
638 aa  100  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27161  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  28.06 
 
 
547 aa  97.1  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  24.78 
 
 
638 aa  96.3  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  28.04 
 
 
520 aa  96.3  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.9 
 
 
607 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  25.48 
 
 
512 aa  92.8  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.78 
 
 
627 aa  93.2  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  24.15 
 
 
659 aa  91.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.34 
 
 
533 aa  89  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  23.58 
 
 
657 aa  88.2  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  24.65 
 
 
523 aa  87  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4645  5'-Nucleotidase domain protein  23.73 
 
 
506 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132836  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1793  metallophosphoesterase  30.49 
 
 
302 aa  86.3  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7607  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  31.02 
 
 
585 aa  84  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.79 
 
 
523 aa  84  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  27.11 
 
 
523 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.55 
 
 
503 aa  83.6  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.9 
 
 
605 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0171  5'-nucleotidase family protein  25.68 
 
 
590 aa  82.4  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  24.34 
 
 
518 aa  82.4  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0450  5'-nucleotidase  26.71 
 
 
579 aa  82.4  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05939  conserved hypothetical protein  25.44 
 
 
582 aa  82  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  25.97 
 
 
504 aa  82  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  25 
 
 
520 aa  82  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  24.12 
 
 
518 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  24.12 
 
 
518 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  24.34 
 
 
518 aa  81.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  24.12 
 
 
518 aa  80.9  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4241  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  24.19 
 
 
608 aa  79.7  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  23.55 
 
 
527 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  23.55 
 
 
520 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3228  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.21 
 
 
549 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00425735  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  23.55 
 
 
523 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.52 
 
 
515 aa  79  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  23.55 
 
 
520 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  23.59 
 
 
1215 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  31.43 
 
 
619 aa  79  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  23.55 
 
 
523 aa  78.2  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3705  5'-nucleotidase family protein  23.67 
 
 
527 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000001284 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0351  5'-Nucleotidase domain protein  23.82 
 
 
579 aa  77.4  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  26.2 
 
 
515 aa  77.4  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>