More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3303 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  95.11 
 
 
657 aa  1040    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  69.09 
 
 
627 aa  912    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  59.7 
 
 
529 aa  652    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  59.62 
 
 
526 aa  654    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  65.12 
 
 
663 aa  817    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  64.85 
 
 
638 aa  852    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  100 
 
 
659 aa  1330    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  56.93 
 
 
533 aa  615  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  55.77 
 
 
532 aa  592  1e-167  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  55.92 
 
 
523 aa  587  1e-166  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  55.73 
 
 
523 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  43.95 
 
 
587 aa  442  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  41.99 
 
 
607 aa  422  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  41.4 
 
 
605 aa  411  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  42.34 
 
 
555 aa  404  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  40.72 
 
 
558 aa  403  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  41.67 
 
 
520 aa  394  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05939  conserved hypothetical protein  34.03 
 
 
582 aa  304  3.0000000000000004e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  32.74 
 
 
619 aa  279  9e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0357  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  34.21 
 
 
607 aa  279  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1134  5'-nucleotidase  34.27 
 
 
625 aa  278  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00179734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.52 
 
 
601 aa  268  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  33.03 
 
 
581 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  33.33 
 
 
504 aa  260  7e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.9 
 
 
508 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0349  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  33.69 
 
 
591 aa  257  4e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0670  5'-nucleotidase  34.92 
 
 
637 aa  247  6e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.785834  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0692  5'-nucleotidase  34.92 
 
 
637 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0157449 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0538  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  31.69 
 
 
584 aa  240  5.999999999999999e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4022  5'-nucleotidase  33.45 
 
 
641 aa  239  9e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.887399 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5725  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.09 
 
 
672 aa  239  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.695831 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  33.33 
 
 
529 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  33.33 
 
 
529 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  32.96 
 
 
529 aa  234  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.96 
 
 
529 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  32.58 
 
 
529 aa  232  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  32.77 
 
 
529 aa  232  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  32.58 
 
 
529 aa  232  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  32.77 
 
 
529 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  32.77 
 
 
529 aa  232  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  32.39 
 
 
529 aa  226  9e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43694  predicted protein  32.93 
 
 
663 aa  221  5e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.553489  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  32.57 
 
 
523 aa  213  7.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.52 
 
 
530 aa  213  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  30.81 
 
 
515 aa  212  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  32.37 
 
 
509 aa  211  3e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  33.53 
 
 
512 aa  211  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  30.82 
 
 
556 aa  206  9e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  30.89 
 
 
529 aa  206  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  30.7 
 
 
529 aa  206  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  30.7 
 
 
529 aa  206  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  30.7 
 
 
529 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  30.7 
 
 
529 aa  206  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  30.7 
 
 
529 aa  206  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  30.7 
 
 
529 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  30.39 
 
 
529 aa  205  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1539  metallophosphoesterase  29.23 
 
 
577 aa  205  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.337659 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.7 
 
 
529 aa  203  7e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  30.32 
 
 
529 aa  203  9e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  31.47 
 
 
503 aa  203  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0854  5'-Nucleotidase domain protein  31.03 
 
 
619 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192901  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0825  5'-Nucleotidase domain protein  31.03 
 
 
619 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1111  metallophosphoesterase  27.29 
 
 
578 aa  200  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.443136  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  31.86 
 
 
520 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3010  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.27 
 
 
581 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1235  5'-Nucleotidase domain protein  31.3 
 
 
613 aa  194  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.798144  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1368  metallophosphoesterase  27.32 
 
 
580 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.198191  normal  0.0110218 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3153  5'-nucleotidase domain protein  27.07 
 
 
581 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867594 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2995  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.09 
 
 
581 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.78 
 
 
722 aa  191  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  30.93 
 
 
508 aa  191  5e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2370  5'-nucleotidase, putative  26.33 
 
 
573 aa  191  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.405664 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  30.93 
 
 
508 aa  191  5e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1300  5'-nucleotidase  26.2 
 
 
592 aa  187  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.291258  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1427  5'-nucleotidase  27.01 
 
 
581 aa  187  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  29.03 
 
 
518 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1472  5'-nucleotidase  30.25 
 
 
517 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.150971 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  29.03 
 
 
518 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0023  cell wall anchor domain-containing protein  29.22 
 
 
772 aa  185  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.244704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0023  cell wall anchor domain-containing protein  29.22 
 
 
772 aa  185  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0275377  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  29.03 
 
 
518 aa  185  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  28.83 
 
 
518 aa  185  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3317  5'-nucleotidase, putative  26.53 
 
 
583 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  28.83 
 
 
518 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1472  5'-nucleotidase  30.13 
 
 
505 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633021  normal  0.092078 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1464  5'-Nucleotidase domain protein  27.73 
 
 
657 aa  183  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577619  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3844  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.98 
 
 
712 aa  183  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2657  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.6 
 
 
581 aa  182  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1294  metallophosphoesterase  26.9 
 
 
583 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.260824  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1750  5'-nucleotidase  30.33 
 
 
500 aa  182  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.398789 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2772  putative 5'-nucleotidase  29.41 
 
 
664 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000553351  hitchhiker  0.00604315 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1252  5'-nucleotidase-like protein  26.53 
 
 
580 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  27.44 
 
 
516 aa  179  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2669  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  30.15 
 
 
569 aa  178  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000803412  normal  0.0151204 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4357  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  28.71 
 
 
535 aa  178  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000122656  decreased coverage  0.0000528459 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05914  5'-nucleotidase  26.11 
 
 
585 aa  177  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2582  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.91 
 
 
505 aa  177  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270196  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1223  metallophosphoesterase  26.9 
 
 
583 aa  177  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1224  metallophosphoesterase  27.09 
 
 
583 aa  177  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.618653  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  28.45 
 
 
808 aa  177  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>