More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2370 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1539  metallophosphoesterase  58.64 
 
 		 577 aa  684    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.337659 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3317  5'-nucleotidase, putative  57.96 
 
 		 583 aa  689    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1368  metallophosphoesterase  57.64 
 
 		 580 aa  689    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.198191  normal  0.0110218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1300  5'-nucleotidase  57.57 
 
 		 592 aa  692    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.291258  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3153  5'-nucleotidase domain protein  57.54 
 
 		 581 aa  685    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867594 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1223  metallophosphoesterase  57.44 
 
 		 583 aa  690    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1294  metallophosphoesterase  58.13 
 
 		 583 aa  696    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.260824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2657  5'-nucleotidase domain-containing protein  57.64 
 
 		 581 aa  685    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1111  metallophosphoesterase  56.37 
 
 		 578 aa  668    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.443136  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1427  5'-nucleotidase  57.37 
 
 		 581 aa  671    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1224  metallophosphoesterase  57.61 
 
 		 583 aa  690    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.618653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3010  5'-nucleotidase domain-containing protein  57.89 
 
 		 581 aa  691    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2370  5'-nucleotidase, putative  100 
 
 		 573 aa  1181    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.405664 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2995  5'-nucleotidase domain-containing protein  58.06 
 
 		 581 aa  691    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1285  5'-nucleotidase  60.48 
 
 		 586 aa  681    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1252  5'-nucleotidase-like protein  55.48 
 
 		 580 aa  630  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0478  putative 5`-nucleotidase  44.14 
 
 		 580 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000584896  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05914  5'-nucleotidase  43.48 
 
 		 585 aa  442  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000189  5'-nucleotidase  42.93 
 
 		 578 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000310598  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0450  5'-nucleotidase  38.64 
 
 		 579 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2772  putative 5'-nucleotidase  34.4 
 
 		 664 aa  268  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000553351  hitchhiker  0.00604315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  30.7 
 
 		 529 aa  236  6e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  29.57 
 
 		 526 aa  229  7e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.74 
 
 		 533 aa  220  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  29.31 
 
 		 523 aa  217  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  31.29 
 
 		 581 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.74 
 
 		 523 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  29.36 
 
 		 663 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  28.8 
 
 		 558 aa  210  7e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.4 
 
 		 607 aa  209  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0357  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  30.29 
 
 		 607 aa  209  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  28.09 
 
 		 638 aa  206  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.84 
 
 		 605 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1134  5'-nucleotidase  28.83 
 
 		 625 aa  204  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00179734  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.87 
 
 		 627 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0670  5'-nucleotidase  27.41 
 
 		 637 aa  196  9e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.785834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.28 
 
 		 601 aa  196  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5725  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.04 
 
 		 672 aa  194  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695831 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0692  5'-nucleotidase  27.24 
 
 		 637 aa  192  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0157449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  26.14 
 
 		 659 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0538  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  28.06 
 
 		 584 aa  192  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.22 
 
 		 587 aa  189  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4022  5'-nucleotidase  26.45 
 
 		 641 aa  189  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.887399 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  26.14 
 
 		 657 aa  187  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  28.49 
 
 		 555 aa  186  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  27.76 
 
 		 520 aa  185  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  27.53 
 
 		 532 aa  183  9.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43694  predicted protein  27.05 
 
 		 663 aa  182  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.553489  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0349  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  27.59 
 
 		 591 aa  179  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  26.93 
 
 		 504 aa  176  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05939  conserved hypothetical protein  27.58 
 
 		 582 aa  150  5e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.23 
 
 		 508 aa  144  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  26.63 
 
 		 619 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  23.12 
 
 		 523 aa  140  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.84 
 
 		 515 aa  118  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  27.12 
 
 		 512 aa  118  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.48 
 
 		 509 aa  118  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  24.49 
 
 		 515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25 
 
 		 503 aa  109  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.04 
 
 		 517 aa  108  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  24.56 
 
 		 504 aa  107  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  23.63 
 
 		 489 aa  106  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.49 
 
 		 508 aa  103  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.49 
 
 		 508 aa  103  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0023  cell wall anchor domain-containing protein  24.39 
 
 		 772 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0275377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0023  cell wall anchor domain-containing protein  24.39 
 
 		 772 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.244704  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  22.63 
 
 		 518 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  22.2 
 
 		 516 aa  100  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  23.28 
 
 		 1215 aa  99.4  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1793  metallophosphoesterase  28.9 
 
 		 302 aa  98.2  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  22.46 
 
 		 518 aa  97.4  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  22.46 
 
 		 518 aa  96.3  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  22.86 
 
 		 1202 aa  96.7  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  22.46 
 
 		 518 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2582  5'-nucleotidase domain-containing protein  25 
 
 		 505 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270196  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  22.28 
 
 		 518 aa  94.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2185  metallophosphoesterase  30 
 
 		 315 aa  93.6  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  23.52 
 
 		 1181 aa  93.2  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  21.89 
 
 		 517 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  21.67 
 
 		 556 aa  92  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2669  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.78 
 
 		 569 aa  90.5  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000803412  normal  0.0151204 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3228  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.09 
 
 		 549 aa  90.5  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00425735  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  22.94 
 
 		 1175 aa  89.7  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  24.96 
 
 		 520 aa  89.4  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1083  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.95 
 
 		 549 aa  89  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000234705  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2257  5'-nucleotidase family protein  22.44 
 
 		 533 aa  88.6  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000083157  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2803  putative 5'-nucleotidase  28.16 
 
 		 564 aa  88.6  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1753  UshA protein  23.05 
 
 		 508 aa  88.2  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4253  twin-arginine translocation pathway signal  27.74 
 
 		 565 aa  87.8  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.417802  normal  0.174095 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4160  5'-Nucleotidase domain protein  27.24 
 
 		 559 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1908  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.05 
 
 		 572 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00316066  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3473  metallophosphoesterase  26.19 
 
 		 303 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.590454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  21.94 
 
 		 529 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  21.58 
 
 		 529 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.78 
 
 		 1284 aa  86.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4342  metallophosphoesterase  27.89 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.266194  normal  0.291471 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  22.52 
 
 		 523 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0324  metallophosphoesterase  27.13 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0297927  normal  0.111016 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  22.33 
 
 		 520 aa  83.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  22.33 
 
 		 520 aa  83.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>