More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2772 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_2772  putative 5'-nucleotidase  100 
 
 
664 aa  1359    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000553351  hitchhiker  0.00604315 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0478  putative 5`-nucleotidase  31.5 
 
 
580 aa  291  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000584896  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2995  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.98 
 
 
581 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3010  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.81 
 
 
581 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1368  metallophosphoesterase  32.69 
 
 
580 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.198191  normal  0.0110218 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1427  5'-nucleotidase  32.57 
 
 
581 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3153  5'-nucleotidase domain protein  32.63 
 
 
581 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867594 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1223  metallophosphoesterase  32.46 
 
 
583 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1224  metallophosphoesterase  32.22 
 
 
583 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.618653  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3317  5'-nucleotidase, putative  32.81 
 
 
583 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2657  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.1 
 
 
581 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1300  5'-nucleotidase  32.56 
 
 
592 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.291258  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1294  metallophosphoesterase  32.11 
 
 
583 aa  279  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.260824  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2370  5'-nucleotidase, putative  34.4 
 
 
573 aa  278  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.405664 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1111  metallophosphoesterase  31.62 
 
 
578 aa  276  8e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.443136  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1252  5'-nucleotidase-like protein  32.8 
 
 
580 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1285  5'-nucleotidase  32.59 
 
 
586 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1539  metallophosphoesterase  30.55 
 
 
577 aa  264  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.337659 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05914  5'-nucleotidase  30.23 
 
 
585 aa  259  8e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0357  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  31.46 
 
 
607 aa  256  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000189  5'-nucleotidase  30.09 
 
 
578 aa  254  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000310598  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0450  5'-nucleotidase  30.51 
 
 
579 aa  249  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  30.38 
 
 
555 aa  238  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  29.85 
 
 
581 aa  231  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  30.24 
 
 
558 aa  228  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.09 
 
 
601 aa  223  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0670  5'-nucleotidase  30.05 
 
 
637 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.785834  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0692  5'-nucleotidase  30.05 
 
 
637 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0157449 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1134  5'-nucleotidase  29.21 
 
 
625 aa  211  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00179734  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  28.01 
 
 
663 aa  209  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43694  predicted protein  28.35 
 
 
663 aa  206  9e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.553489  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0349  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  31.25 
 
 
591 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  28.18 
 
 
526 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  28.76 
 
 
520 aa  197  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.7 
 
 
627 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  28.83 
 
 
532 aa  194  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4022  5'-nucleotidase  29.64 
 
 
641 aa  190  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.887399 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  29.02 
 
 
659 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  28.84 
 
 
657 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.36 
 
 
523 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  27.18 
 
 
529 aa  184  6e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.3 
 
 
533 aa  183  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  29.09 
 
 
523 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5725  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.53 
 
 
672 aa  179  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.695831 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0538  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  29.47 
 
 
584 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  27.68 
 
 
638 aa  174  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.46 
 
 
587 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05939  conserved hypothetical protein  26.16 
 
 
582 aa  143  9e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.62 
 
 
605 aa  138  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.94 
 
 
607 aa  137  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  23.47 
 
 
619 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  25.99 
 
 
504 aa  114  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.31 
 
 
503 aa  114  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2137  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.57 
 
 
571 aa  113  9e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000210765  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1235  5'-Nucleotidase domain protein  25.13 
 
 
613 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.798144  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0825  5'-Nucleotidase domain protein  24.77 
 
 
619 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0854  5'-Nucleotidase domain protein  24.77 
 
 
619 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192901  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  26.39 
 
 
504 aa  110  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.17 
 
 
508 aa  109  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.93 
 
 
515 aa  106  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.31 
 
 
509 aa  106  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.72 
 
 
508 aa  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.72 
 
 
508 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  24.53 
 
 
520 aa  103  7e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2336  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.96 
 
 
573 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.27789  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2264  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.72 
 
 
573 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.96145 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2454  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.72 
 
 
573 aa  102  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2309  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.48 
 
 
572 aa  102  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.897886  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  24.01 
 
 
529 aa  101  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1038  metallophosphoesterase  28.75 
 
 
638 aa  101  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27161  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1753  UshA protein  23.99 
 
 
508 aa  101  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.71 
 
 
529 aa  100  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  24.01 
 
 
529 aa  100  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  24.01 
 
 
529 aa  100  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  24.01 
 
 
529 aa  100  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2669  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.43 
 
 
569 aa  100  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000803412  normal  0.0151204 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  24.01 
 
 
529 aa  100  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3214  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.49 
 
 
668 aa  99  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  23.71 
 
 
529 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01256  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.71 
 
 
553 aa  99.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  23.71 
 
 
529 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  23.68 
 
 
529 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  23.34 
 
 
529 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2001  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.93 
 
 
569 aa  97.4  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  23.63 
 
 
530 aa  97.4  8e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0324  metallophosphoesterase  28.92 
 
 
313 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0297927  normal  0.111016 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1793  metallophosphoesterase  28 
 
 
302 aa  95.9  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3914  hypothetical protein  28.63 
 
 
563 aa  94  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.321338 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2135  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.47 
 
 
567 aa  94.4  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035246  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0800  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.55 
 
 
553 aa  92.4  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1751  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.98 
 
 
553 aa  92.8  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000978587  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  23.39 
 
 
529 aa  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1464  5'-Nucleotidase domain protein  28.75 
 
 
657 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577619  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004198  5'-nucleotidase  23.15 
 
 
560 aa  91.3  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  23.26 
 
 
523 aa  90.9  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02665  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.87 
 
 
578 aa  90.9  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1952  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.04 
 
 
569 aa  90.9  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.643025  normal  0.0714944 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  22.39 
 
 
517 aa  90.5  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.53 
 
 
529 aa  90.1  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4342  metallophosphoesterase  29.92 
 
 
313 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.266194  normal  0.291471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>