More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1111 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1285  5'-nucleotidase  58.43 
 
 		 586 aa  662    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1300  5'-nucleotidase  59.1 
 
 		 592 aa  694    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.291258  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1427  5'-nucleotidase  58.8 
 
 		 581 aa  689    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3010  5'-nucleotidase domain-containing protein  59.76 
 
 		 581 aa  707    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3317  5'-nucleotidase, putative  58.86 
 
 		 583 aa  689    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2995  5'-nucleotidase domain-containing protein  59.59 
 
 		 581 aa  706    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1252  5'-nucleotidase-like protein  66.15 
 
 		 580 aa  788    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2657  5'-nucleotidase domain-containing protein  59.59 
 
 		 581 aa  694    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3153  5'-nucleotidase domain protein  59.41 
 
 		 581 aa  702    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867594 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1223  metallophosphoesterase  59.38 
 
 		 583 aa  688    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1294  metallophosphoesterase  59.38 
 
 		 583 aa  692    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.260824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1111  metallophosphoesterase  100 
 
 		 578 aa  1185    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.443136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1368  metallophosphoesterase  59.86 
 
 		 580 aa  707    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.198191  normal  0.0110218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1224  metallophosphoesterase  59.38 
 
 		 583 aa  688    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.618653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2370  5'-nucleotidase, putative  56.37 
 
 		 573 aa  668    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.405664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1539  metallophosphoesterase  56.6 
 
 		 577 aa  660    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.337659 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0478  putative 5`-nucleotidase  44.9 
 
 		 580 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000584896  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05914  5'-nucleotidase  42.88 
 
 		 585 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000189  5'-nucleotidase  42.34 
 
 		 578 aa  443  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000310598  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0450  5'-nucleotidase  37.46 
 
 		 579 aa  417  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2772  putative 5'-nucleotidase  31.62 
 
 		 664 aa  265  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000553351  hitchhiker  0.00604315 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.28 
 
 		 601 aa  223  7e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  29.11 
 
 		 526 aa  219  7.999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  29.14 
 
 		 638 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  27.7 
 
 		 529 aa  213  7e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  27.96 
 
 		 663 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.09 
 
 		 605 aa  212  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.09 
 
 		 607 aa  210  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0357  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  27.66 
 
 		 607 aa  207  6e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.37 
 
 		 627 aa  205  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  29.4 
 
 		 581 aa  205  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1134  5'-nucleotidase  28.47 
 
 		 625 aa  204  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00179734  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  27.56 
 
 		 523 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  27.29 
 
 		 659 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.05 
 
 		 523 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.38 
 
 		 533 aa  201  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0538  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  28.62 
 
 		 584 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  27.51 
 
 		 558 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  27.58 
 
 		 657 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  29.35 
 
 		 555 aa  196  7e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0349  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  27.4 
 
 		 591 aa  196  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  28.83 
 
 		 520 aa  194  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43694  predicted protein  28.19 
 
 		 663 aa  189  9e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.553489  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.34 
 
 		 587 aa  187  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4022  5'-nucleotidase  24.83 
 
 		 641 aa  179  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.887399 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  26.48 
 
 		 532 aa  178  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5725  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.31 
 
 		 672 aa  176  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695831 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0692  5'-nucleotidase  25.31 
 
 		 637 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0157449 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0670  5'-nucleotidase  25.13 
 
 		 637 aa  164  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.785834  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05939  conserved hypothetical protein  27.36 
 
 		 582 aa  157  5.0000000000000005e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  26.08 
 
 		 504 aa  150  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.22 
 
 		 508 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  25.05 
 
 		 619 aa  130  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.8 
 
 		 515 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  24.08 
 
 		 523 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  23.62 
 
 		 509 aa  114  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25 
 
 		 503 aa  111  3e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  23.36 
 
 		 515 aa  110  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  22.63 
 
 		 1202 aa  101  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  22.26 
 
 		 1215 aa  101  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  22.72 
 
 		 517 aa  97.1  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  20.49 
 
 		 508 aa  96.7  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  20.49 
 
 		 508 aa  96.7  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  24.81 
 
 		 512 aa  96.3  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  22.44 
 
 		 1181 aa  95.9  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0023  cell wall anchor domain-containing protein  22.35 
 
 		 772 aa  92.8  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0275377  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  22.05 
 
 		 1175 aa  92.4  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1753  UshA protein  22.98 
 
 		 508 aa  92.4  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0023  cell wall anchor domain-containing protein  22.35 
 
 		 772 aa  92.8  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.244704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4342  metallophosphoesterase  29.25 
 
 		 313 aa  91.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.266194  normal  0.291471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2185  metallophosphoesterase  31.35 
 
 		 315 aa  92  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.123783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  22.55 
 
 		 520 aa  92  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  22.84 
 
 		 504 aa  91.7  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2257  5'-nucleotidase family protein  22.14 
 
 		 533 aa  90.9  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000083157  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  22.46 
 
 		 489 aa  90.1  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1474  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.98 
 
 		 491 aa  89.4  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1793  metallophosphoesterase  28.24 
 
 		 302 aa  88.2  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1926  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  21.92 
 
 		 568 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0770  hypothetical protein  23.06 
 
 		 494 aa  84.7  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0435577  normal  0.251523 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  20.42 
 
 		 530 aa  84.3  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0324  metallophosphoesterase  28.57 
 
 		 313 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0297927  normal  0.111016 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0959  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.66 
 
 		 550 aa  82.8  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  20.73 
 
 		 516 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3228  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.66 
 
 		 549 aa  81.3  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00425735  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00431  UDP-sugar hydrolase  22.91 
 
 		 550 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.373208  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3130  5'-Nucleotidase domain protein  22.91 
 
 		 550 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.520535  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0557  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.91 
 
 		 550 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  20.99 
 
 		 529 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0519  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.91 
 
 		 550 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3136  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.91 
 
 		 550 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.161033  unclonable  0.0000000215982 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  20.99 
 
 		 529 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1083  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.86 
 
 		 549 aa  79.7  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000234705  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  20.19 
 
 		 556 aa  79.7  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  22.6 
 
 		 523 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00436  hypothetical protein  22.91 
 
 		 550 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.335822  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1176  metallophosphoesterase  26.18 
 
 		 505 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  20.81 
 
 		 529 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0524  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.02 
 
 		 550 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0415  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  22.72 
 
 		 550 aa  79  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  20.99 
 
 		 529 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>