More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4386 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  58.56 
 
 
517 aa  643    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  100 
 
 
516 aa  1054    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  59.38 
 
 
520 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  59.38 
 
 
520 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  59.38 
 
 
523 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  59.38 
 
 
523 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  56.92 
 
 
518 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  57.12 
 
 
518 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  56.92 
 
 
518 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  56.73 
 
 
518 aa  594  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  56.73 
 
 
518 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  54.16 
 
 
539 aa  585  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  58.43 
 
 
517 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  50.67 
 
 
530 aa  514  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  36.05 
 
 
504 aa  292  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.4 
 
 
508 aa  269  8.999999999999999e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  31.28 
 
 
529 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  31.1 
 
 
529 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  31.28 
 
 
529 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  31.28 
 
 
529 aa  221  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  31.1 
 
 
529 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  31.1 
 
 
529 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  31.09 
 
 
529 aa  219  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  31.21 
 
 
529 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.65 
 
 
529 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.97 
 
 
530 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  30.54 
 
 
529 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  28.73 
 
 
520 aa  211  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  28.49 
 
 
523 aa  210  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  30.35 
 
 
529 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  30.35 
 
 
529 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  30.35 
 
 
529 aa  204  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.34 
 
 
529 aa  204  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  30.16 
 
 
529 aa  204  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  29.63 
 
 
515 aa  203  5e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  30.16 
 
 
529 aa  203  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  30.16 
 
 
529 aa  203  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  30.16 
 
 
529 aa  202  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  30.16 
 
 
529 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  29.96 
 
 
529 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  27.44 
 
 
659 aa  181  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  28.83 
 
 
509 aa  180  5.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  27.26 
 
 
657 aa  179  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.31 
 
 
587 aa  179  9e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  29.26 
 
 
556 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.66 
 
 
607 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  28.6 
 
 
558 aa  177  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.11 
 
 
557 aa  176  7e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  27.63 
 
 
559 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.51 
 
 
605 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2257  5'-nucleotidase family protein  28.74 
 
 
533 aa  174  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000083157  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.49 
 
 
627 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0320  5'-Nucleotidase domain protein  28.07 
 
 
489 aa  172  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000730834  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  26.09 
 
 
607 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26 
 
 
555 aa  171  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2368  5'-nucleotidase-like  26.92 
 
 
578 aa  170  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.287077  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1414  5`-nucleotidase  26.12 
 
 
560 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0268  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.76 
 
 
567 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  27.56 
 
 
560 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.93 
 
 
1284 aa  168  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0229  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.84 
 
 
567 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  29.98 
 
 
508 aa  167  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  29.98 
 
 
508 aa  167  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  29.07 
 
 
503 aa  167  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.26 
 
 
523 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4307  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.12 
 
 
560 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  27.26 
 
 
523 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  28.6 
 
 
515 aa  164  5.0000000000000005e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0023  cell wall anchor domain-containing protein  28.46 
 
 
772 aa  163  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0275377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0023  cell wall anchor domain-containing protein  28.46 
 
 
772 aa  163  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.244704  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  26.27 
 
 
558 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  27.88 
 
 
1512 aa  163  9e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1162  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.25 
 
 
509 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.587696  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  28.79 
 
 
1215 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  26.13 
 
 
555 aa  159  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  26.76 
 
 
1506 aa  158  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  26.14 
 
 
532 aa  158  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  28.79 
 
 
1202 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0467  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.37 
 
 
479 aa  158  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.92 
 
 
722 aa  157  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  27.2 
 
 
663 aa  157  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  26.54 
 
 
1577 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05939  conserved hypothetical protein  25.61 
 
 
582 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3391  5'-Nucleotidase domain protein  28.47 
 
 
585 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  25.68 
 
 
638 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.55 
 
 
533 aa  153  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  27.92 
 
 
1181 aa  153  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0513  5'-Nucleotidase domain protein  29.81 
 
 
577 aa  153  8.999999999999999e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000761029  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4357  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.95 
 
 
535 aa  151  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000122656  decreased coverage  0.0000528459 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  27.59 
 
 
1652 aa  150  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  27.79 
 
 
504 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1753  UshA protein  25.6 
 
 
508 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  25.97 
 
 
1175 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.61 
 
 
1525 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4541  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.36 
 
 
604 aa  147  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101042  normal  0.534355 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.36 
 
 
578 aa  147  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0448  5'-nucleotidase family protein  25.91 
 
 
580 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1474  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.57 
 
 
491 aa  145  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0972  5'-Nucleotidase domain protein  29.04 
 
 
481 aa  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.305687  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0036  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  26.5 
 
 
1311 aa  144  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>