More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4307 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1414  5`-nucleotidase  96.96 
 
 		 560 aa  1126    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4307  5'-nucleotidase domain-containing protein  100 
 
 		 560 aa  1154    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00130  5-nucleotidase/phosphoesterase  45.56 
 
 		 571 aa  508  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  41.52 
 
 		 557 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  39.27 
 
 		 560 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2368  5'-nucleotidase-like  38.25 
 
 		 578 aa  369  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.287077  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  38.39 
 
 		 559 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  38.52 
 
 		 607 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  39.29 
 
 		 558 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  38.68 
 
 		 555 aa  347  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0356  5'-nucleotidase  36.9 
 
 		 655 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0863234 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  35.89 
 
 		 529 aa  324  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  36.49 
 
 		 529 aa  324  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.5 
 
 		 529 aa  323  7e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  36.49 
 
 		 529 aa  323  8e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  36.29 
 
 		 529 aa  322  8e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  36.29 
 
 		 529 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  36.29 
 
 		 529 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  36.1 
 
 		 529 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  36.1 
 
 		 529 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  36.1 
 
 		 529 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.81 
 
 		 578 aa  320  3e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0268  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.55 
 
 		 567 aa  319  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492479 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.37 
 
 		 530 aa  317  4e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3482  5'-Nucleotidase domain protein  36.13 
 
 		 611 aa  317  5e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0448  5'-nucleotidase family protein  35.9 
 
 		 580 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  35.19 
 
 		 529 aa  309  9e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0229  5'-nucleotidase domain-containing protein  37 
 
 		 567 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  35.16 
 
 		 529 aa  307  3e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  34.83 
 
 		 529 aa  307  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  34.83 
 
 		 529 aa  307  3e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  34.97 
 
 		 529 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  35 
 
 		 529 aa  306  6e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  34.97 
 
 		 529 aa  306  6e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  34.97 
 
 		 529 aa  306  6e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  34.81 
 
 		 529 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.63 
 
 		 529 aa  302  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3391  5'-Nucleotidase domain protein  36.56 
 
 		 585 aa  299  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4541  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.96 
 
 		 604 aa  289  8e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101042  normal  0.534355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.27 
 
 		 722 aa  286  7e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  35.13 
 
 		 556 aa  286  8e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2145  5'-Nucleotidase domain protein  34.93 
 
 		 569 aa  282  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07100  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  34.52 
 
 		 597 aa  277  5e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.593719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4270  5'-Nucleotidase domain-containing protein  34.62 
 
 		 588 aa  274  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0143  5'-Nucleotidase domain protein  34.22 
 
 		 575 aa  273  8.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0559  5'-nucleotidase  32.64 
 
 		 583 aa  270  5.9999999999999995e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.562968  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2321  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.74 
 
 		 731 aa  269  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857665  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1162  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.68 
 
 		 509 aa  258  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.587696  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2731  hypothetical protein  31.65 
 
 		 575 aa  256  9e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2604  hypothetical protein  31.12 
 
 		 574 aa  251  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1147  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.59 
 
 		 561 aa  242  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0894  putative 5'-nucleotidase family protein  32.16 
 
 		 602 aa  238  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0860  5'-Nucleotidase domain protein  31.99 
 
 		 580 aa  234  3e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1461  5'-Nucleotidase domain protein  30.29 
 
 		 583 aa  218  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.899956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0875  5'-Nucleotidase domain protein  30.11 
 
 		 580 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.38 
 
 		 1525 aa  213  7e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4841  5'-Nucleotidase domain-containing protein  27.61 
 
 		 586 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.374418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  27.62 
 
 		 1512 aa  211  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1086  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.78 
 
 		 571 aa  207  4e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.244523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  29.09 
 
 		 1577 aa  206  9e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2724  5'-nucleotidase-like  30.73 
 
 		 581 aa  206  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00164791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4846  5'-Nucleotidase domain-containing protein  29.26 
 
 		 578 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3554  5'-Nucleotidase domain protein  30.58 
 
 		 870 aa  201  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00406796  hitchhiker  0.00346018 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  27.56 
 
 		 1652 aa  201  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  30.96 
 
 		 504 aa  196  7e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1029  cell wall anchor domain-containing protein  30.41 
 
 		 752 aa  195  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0457373  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  27.98 
 
 		 1506 aa  192  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1067  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase related esterase  30.64 
 
 		 765 aa  189  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000206277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  27.89 
 
 		 1577 aa  189  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0036  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  27.55 
 
 		 1311 aa  181  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.94 
 
 		 508 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27420  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  27.12 
 
 		 826 aa  178  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  26.55 
 
 		 1591 aa  178  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  30.59 
 
 		 518 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.84 
 
 		 517 aa  171  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  30.59 
 
 		 518 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  30.39 
 
 		 518 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  30.39 
 
 		 518 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  26.12 
 
 		 516 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  30.41 
 
 		 518 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1333  5'-nucleotidase family protein  26.44 
 
 		 690 aa  161  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00306106  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  28.93 
 
 		 520 aa  159  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  29.47 
 
 		 517 aa  159  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  26.93 
 
 		 530 aa  156  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  28.76 
 
 		 508 aa  148  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  28.76 
 
 		 508 aa  148  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  27.5 
 
 		 657 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2906  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.44 
 
 		 872 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.865364  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  26.06 
 
 		 539 aa  144  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  27.5 
 
 		 659 aa  144  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  26.24 
 
 		 523 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  26.7 
 
 		 520 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  26.7 
 
 		 520 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.5 
 
 		 1284 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03620  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  26.84 
 
 		 750 aa  139  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.422162  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0036  5'-Nucleotidase domain-containing protein  25.87 
 
 		 523 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0257777 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  28.85 
 
 		 529 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.17 
 
 		 509 aa  137  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  27.97 
 
 		 555 aa  137  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.5 
 
 		 605 aa  133  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>