More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3554 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  51.11 
 
 		 1652 aa  690    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3554  5'-Nucleotidase domain protein  100 
 
 		 870 aa  1714    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00406796  hitchhiker  0.00346018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  55.89 
 
 		 1577 aa  726    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0036  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  50.21 
 
 		 1311 aa  626  1e-178  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  54.59 
 
 		 1512 aa  624  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  45.01 
 
 		 1506 aa  609  1e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  55.27 
 
 		 1525 aa  603  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  51.9 
 
 		 1577 aa  579  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  48.42 
 
 		 1591 aa  546  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27420  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  38.47 
 
 		 826 aa  349  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2321  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.49 
 
 		 731 aa  320  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857665  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.24 
 
 		 578 aa  274  5.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0143  5'-Nucleotidase domain protein  34.95 
 
 		 575 aa  266  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  35.53 
 
 		 559 aa  263  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03620  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  34.85 
 
 		 750 aa  260  6e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.422162  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  34.31 
 
 		 607 aa  257  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  35.15 
 
 		 558 aa  252  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  33.5 
 
 		 560 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0894  putative 5'-nucleotidase family protein  32.66 
 
 		 602 aa  244  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  34.13 
 
 		 555 aa  244  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2368  5'-nucleotidase-like  33.06 
 
 		 578 aa  239  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.287077  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4270  5'-Nucleotidase domain-containing protein  33.67 
 
 		 588 aa  238  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0356  5'-nucleotidase  32.6 
 
 		 655 aa  236  9e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0863234 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0268  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.91 
 
 		 567 aa  233  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492479 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  31.28 
 
 		 529 aa  227  6e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  30.94 
 
 		 529 aa  226  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  30.94 
 
 		 529 aa  226  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  30.94 
 
 		 529 aa  226  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  30.94 
 
 		 529 aa  226  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  30.92 
 
 		 529 aa  226  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  31.08 
 
 		 529 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  31.08 
 
 		 529 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  30.74 
 
 		 529 aa  224  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  30.74 
 
 		 529 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  30.74 
 
 		 529 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.59 
 
 		 557 aa  223  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  30.92 
 
 		 529 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  30.21 
 
 		 529 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0229  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.22 
 
 		 567 aa  221  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  30.57 
 
 		 529 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  30.43 
 
 		 529 aa  221  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  30.26 
 
 		 529 aa  220  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  30.26 
 
 		 529 aa  220  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1414  5`-nucleotidase  30.45 
 
 		 560 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.39 
 
 		 529 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00130  5-nucleotidase/phosphoesterase  30.47 
 
 		 571 aa  218  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.11 
 
 		 529 aa  218  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.35 
 
 		 722 aa  218  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2145  5'-Nucleotidase domain protein  33.1 
 
 		 569 aa  218  5.9999999999999996e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4307  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.58 
 
 		 560 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0448  5'-nucleotidase family protein  30.88 
 
 		 580 aa  217  8e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.06 
 
 		 530 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  30.09 
 
 		 529 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3391  5'-Nucleotidase domain protein  33.61 
 
 		 585 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4541  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.94 
 
 		 604 aa  209  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101042  normal  0.534355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3482  5'-Nucleotidase domain protein  34.08 
 
 		 611 aa  207  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  32.02 
 
 		 556 aa  198  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4841  5'-Nucleotidase domain-containing protein  29.34 
 
 		 586 aa  183  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.374418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  51.78 
 
 		 1331 aa  172  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1147  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.77 
 
 		 561 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07100  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  30.85 
 
 		 597 aa  165  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.593719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0559  5'-nucleotidase  29.37 
 
 		 583 aa  164  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.562968  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0860  5'-Nucleotidase domain protein  27.99 
 
 		 580 aa  161  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  27 
 
 		 1175 aa  160  9e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.18 
 
 		 508 aa  160  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  30.3 
 
 		 520 aa  157  6e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2604  hypothetical protein  25.61 
 
 		 574 aa  156  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  27.1 
 
 		 1181 aa  157  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  25.84 
 
 		 504 aa  157  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1162  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.48 
 
 		 509 aa  157  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.587696  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2731  hypothetical protein  25.45 
 
 		 575 aa  156  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  26.82 
 
 		 1202 aa  152  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1086  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.59 
 
 		 571 aa  151  6e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.244523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  29.95 
 
 		 657 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.38 
 
 		 533 aa  148  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  26.64 
 
 		 1215 aa  148  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  29.26 
 
 		 659 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4846  5'-Nucleotidase domain-containing protein  27.67 
 
 		 578 aa  147  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.56 
 
 		 607 aa  146  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.31 
 
 		 627 aa  146  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1461  5'-Nucleotidase domain protein  27.46 
 
 		 583 aa  145  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.899956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  28.4 
 
 		 532 aa  144  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0875  5'-Nucleotidase domain protein  26.39 
 
 		 580 aa  142  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  28.79 
 
 		 638 aa  140  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  28.08 
 
 		 663 aa  140  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  26.79 
 
 		 555 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.48 
 
 		 523 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0015  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  26.45 
 
 		 540 aa  135  5e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2695  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.48 
 
 		 577 aa  134  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.432031 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2724  5'-nucleotidase-like  27.1 
 
 		 581 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00164791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.55 
 
 		 1284 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.5 
 
 		 605 aa  133  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  24.6 
 
 		 530 aa  132  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.96 
 
 		 517 aa  132  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.77 
 
 		 516 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  28.77 
 
 		 529 aa  132  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  27.3 
 
 		 523 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  27.55 
 
 		 526 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2257  5'-nucleotidase family protein  25.81 
 
 		 533 aa  127  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000083157  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  26.52 
 
 		 558 aa  125  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.149567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>